Предобработка данных

Чтение, слияние, редактирование исходных датасетов

  • Загрузка датасетов с информацией о здоровых людях (info_healthy) и пациентах с СРК (info_ibs)
info_healthy <- read_xlsx ("data/raw/final_health_statistic.xlsx")
info_ibs <- read_xlsx ("data/raw/final_ibs_141_statistic.xlsx")
  • Сравнение переменных в info_healthy и info_ibs
## Уникальные переменные в info_ibs:
## Main_Disease
## Weight_kg
## Height_cm
## BMI
## Diet_type
## Diet_duration
## Additive_usage
## Уникальные переменные в info_healthy:
## Drugs

combined_info

  • Объединение info_healthy и info_ibs в единый датасет combined_info c редактированием содержимого
combined_info <- info_healthy %>% 
  bind_rows(info_ibs) %>%
  mutate (
    BMI_min = ifelse (is.na (BMI_min), round (Weight_min /(Height_max/100 * Height_max/100), 2), BMI_min),
    BMI_max = ifelse (is.na (BMI_max), round (Weight_max /(Height_min/100 * Height_min/100), 2), BMI_max)
    ) %>% 
  unite("BMI_range", BMI_min, BMI_max, sep = "-", na.rm = TRUE) %>%
  unite ("Age_range", Age_min, Age_max, sep = "-", na.rm = TRUE) %>%
  mutate(
    Age_range = case_when(
      Age_range == "18-40" | Age_range == "23-28" | Age_range == "16-42" | Age_range == "21-43" ~ "16-43",
      Age <= 43 ~ "16-43",
      Age > 43 ~ "> 43",
      TRUE ~ NA_character_), #удалена группа 28-54
    research_ID = sub ("research_", "", research_ID),
    research_ID = case_when(
      research_ID == 0 ~ 1,
      research_ID == 1 ~ 2,
      research_ID == 2 ~ 3,
      research_ID == 3 ~ 4,
      research_ID == 4 ~ 5, 
      research_ID == 6 ~ 6, 
      research_ID == 7 ~ 7), 
    patient_ID = row_number(),
    Sex = ifelse (Sex == "mixed", NA, Sex),
    Smoking = sub ("never", "Never",  Smoking),
    Smoking = case_when(
      Smoking == "No" ~ "No",
      Smoking == "Never" ~ "No",
      Smoking == "Rarely (a few times/month)" ~ "Yes", #5 чел.
      Smoking == "Occasionally (1-2 times/week)" ~ "Yes",  #3 чел.
      Smoking == "Regularly (3-5 times/week)" ~ "Yes",  #1 чел.
      Smoking == "Daily" ~ "Yes"), #7 чел.
    Alcohol = sub ("rarely", "Rarely", Alcohol),
    Alcohol = ifelse(Alcohol == "Regularly (3-5 times/week)"|
                       Alcohol == "Daily", #3 чел.
                     "Regularly (3-7 times/week)", Alcohol),
    Antibiotics_usage = case_when(
      Antibiotics_usage == "Month" | Antibiotics_usage == ~ "3 months" |
        Antibiotics_usage == "6 months" ~ "1-6 months",
        #2 чел. больных Month, 0 чел. здоровых 3 months, 0 чел. здоровых для 6 months
      Antibiotics_usage == "Year" | Antibiotics_usage == "Not use"  ~ 
        "12 months/Not use"), # 0 чел. из здоровых для 6-12 months, 0 чел. больных для Not use
    Hygiene = case_when(
      Hygiene == "Occasionally (1-2 times/week) cosmetics" ~ "Occasionally cosmetics (1-2 times/week)",
      Hygiene == "Rarely (a few times/month) cosmetics" ~ "Rarely cosmetics (a few times/month)",
      TRUE ~ Hygiene),
    Hygiene = case_when(
      Hygiene == "Daily cosmetics"|Hygiene == "Regularly cosmetics (3-5 times/week)" ~ "Regularly (3-7 times/week)", #0 чел. больных  для 3-5 times/week
      Hygiene == "Occasionally cosmetics (1-2 times/week)" | Hygiene == "Rarely cosmetics (a few times/month)" ~ "Occasionally (a few-8 times/month)",
      #только 2 чел. больных для 1-2 times/week
      Hygiene == "Never cosmetics" ~ "Never"),
    Physical_activity = sub ("regularly", "Regularly",  Smoking),
    BMI = ifelse (is.na(Weight_kg), BMI, Weight_kg/ (Height_cm/100 * Height_cm/100)),
    BMI_range = ifelse(BMI_range == "", NA, BMI_range),
    BMI_category = case_when(
      BMI_range == "18-25" ~ "normal/overweight",
      BMI_range == "19.21-29.29" ~ "normal/overweight",
      BMI_range == "20.6-29.6" ~ "normal/overweight",
      BMI_range == "21.74-28.38" ~ "normal/overweight",
      BMI_range == "18.5-30.8" ~ "normal/overweight", #немного больше 30
      BMI < 18.5 ~ "underweight",
      BMI >= 18.5 & BMI < 30 ~ "normal/overweight",
      BMI >= 30 ~ "obese")
    ) %>% 
  rename ("Cosmetics" = Hygiene ) %>% 
  
  mutate_if (is.character, as.factor) %>% 
  
  select(-c(
    Instrument, # unique (combined_info$Instrument) = "Illumina MiSeq" 
    Isolation_source, # unique (combined_info$Isolation_source) = "faeces" 
    Assay_type, # unique (combined_info$Assay_type) = "AMPLICON"
    Target_gene, # unique (combined_info$Target_gene) = "16S"
    Main_Disease, # unique (combined_info$Main_Disease) = NA (for healthy), 141 (for ibs)
    Drugs, # unique (combined_info$Drugs) = NA
    Social_status, # unique (combined_info$Social_status) =  NA, urban 
    Weight_kg, Height_cm, Weight_min, Weight_max, Height_min, Height_max, BMI_range, #использованы для создания BMI_category, уменьшения количества NA в BMI
    BMI, # NA у всех здоровых
    Birth_Year, # имеются значения только в тех случаях, где возраст уже известен
    Pets_type # только cat и NA
  ))

rm (info_healthy, info_ibs)
summary (combined_info)
##   research_ID      patient_ID  Seq_region     Seq_date     Health_state
##  Min.   :1.000   Min.   :  1   V3-V4:106   Min.   :2015   Disease:170  
##  1st Qu.:3.000   1st Qu.: 96   V4   :229   1st Qu.:2017   Health :211  
##  Median :4.000   Median :191   V5-V6: 46   Median :2018                
##  Mean   :4.194   Mean   :191               Mean   :2019                
##  3rd Qu.:6.000   3rd Qu.:286               3rd Qu.:2021                
##  Max.   :7.000   Max.   :381               Max.   :2023                
##                                                                        
##       Age        Age_range       Sex         Country  
##  Min.   :19.00   > 43 : 44   female: 79   Spain  :95  
##  1st Qu.:27.25   16-43:242   male  :112   Poland :70  
##  Median :34.00   NA's : 95   NA's  :190   Belgium:46  
##  Mean   :38.71                            Germany:45  
##  3rd Qu.:47.00                            Italy  :37  
##  Max.   :76.00                            Austria:28  
##  NA's   :247                              (Other):60  
##                         Race     Smoking                             Alcohol   
##  African American         :  1   No  :187   Never                        : 12  
##  Asian or Pacific Islander:  1   Yes : 16   Occasionally (1-2 times/week): 24  
##  Caucasian                :116   NA's:178   Rarely (a few times/month)   : 36  
##  Hispanic                 :  1              Regularly (3-7 times/week)   : 15  
##  Other                    : 11              NA's                         :294  
##  NA's                     :251                                                 
##                                                                                
##          Antibiotics_usage Physical_activity  Travel_period
##  1-6 months       : 48     No  :187          3 months: 18  
##  12 months/Not use:129     Yes : 16          6 months: 10  
##  NA's             :204     NA's:178          Month   : 13  
##                                              Year    : 45  
##                                              NA's    :295  
##                                                            
##                                                            
##          Education_level                              Cosmetics  
##  Bachelor's level: 31    Never                             : 44  
##  Master's level  : 28    Occasionally (a few-8 times/month): 17  
##  School Level    : 25    Regularly (3-7 times/week)        : 25  
##  NA's            :297    NA's                              :295  
##                                                                  
##                                                                  
##                                                                  
##    Sleep_duration Diet_type  Diet_duration Additive_usage
##  > 8 hours:  9    10.0: 13   3.0 :  8      22.0:  1      
##  4-6 hours:  9    5.0 :  5   6.0 :  5      23.0:  1      
##  6-7 hours: 31    NA's:363   NA's:368      4.0 :  9      
##  7-8 hours: 38                             NA's:370      
##  NA's     :294                                           
##                                                          
##                                                          
##             BMI_category
##  normal/overweight:287  
##  obese            :  5  
##  underweight      :  1  
##  NA's             : 88  
##                         
##                         
## 
  • Таблица с количеством субъектов (n) в зависимости от исследования, даты, наличия/отсутствия СРК
combined_info %>% 
  select (research_ID, Country, Seq_date, Health_state) %>% 
  group_by(research_ID, Country, Seq_date, Health_state) %>% 
  summarise(n = n()) %>% 
  flextable() %>% theme_box() %>% 
  merge_v(c ("research_ID", "Country", "Seq_date", "Health_state")) %>% 
  align(align = "center", part = "all")

research_ID

Country

Seq_date

Health_state

n

1

Belgium

2,018

Health

46

2

Italy

36

3

Poland

2,023

70

4

Australia

2,021

6

Austria

2,020

3

Germany

33

2,021

12

Greece

1

Hungary

2

Ireland

Disease

1

Israel

Health

1

Italy

1

Norway

2,018

Disease

1

UK

7

2,020

2

2,021

3

USA

2,018

6

2,020

1

2,021

5

2,022

1

2,023

1

5

Austria

2,017

25

6

Israel

2,022

22

7

Spain

2,015

95

tbl_summary of combined_info

library(gtsummary)

combined_info %>% 
  select(! c(patient_ID,
              Diet_duration, Additive_usage, Diet_type #у всех здоровых данные переменные = NA
              )) %>% 
  tbl_summary(digits = list(all_continuous() ~ c(0, 0),
                            all_categorical() ~ c(0, 0)),
              by = Health_state) %>%
  add_p()
Characteristic Disease, N = 1701 Health, N = 2111 p-value2
research_ID

<0.001
    1 0 (0%) 46 (22%)
    2 0 (0%) 36 (17%)
    3 0 (0%) 70 (33%)
    4 28 (16%) 59 (28%)
    5 25 (15%) 0 (0%)
    6 22 (13%) 0 (0%)
    7 95 (56%) 0 (0%)
Seq_region

<0.001
    V3-V4 0 (0%) 106 (50%)
    V4 170 (100%) 59 (28%)
    V5-V6 0 (0%) 46 (22%)
Seq_date

<0.001
    2015 95 (56%) 0 (0%)
    2017 25 (15%) 0 (0%)
    2018 14 (8%) 82 (39%)
    2020 3 (2%) 36 (17%)
    2021 9 (5%) 23 (11%)
    2022 23 (14%) 0 (0%)
    2023 1 (1%) 70 (33%)
Age 42 (32, 50) 28 (26, 37) <0.001
    Unknown 95 152
Age_range

<0.001
    > 43 34 (45%) 10 (5%)
    16-43 41 (55%) 201 (95%)
    Unknown 95 0
Sex

0.15
    female 35 (48%) 44 (37%)
    male 38 (52%) 74 (63%)
    Unknown 97 93
Country


    Australia 0 (0%) 6 (3%)
    Austria 25 (15%) 3 (1%)
    Belgium 0 (0%) 46 (22%)
    Germany 0 (0%) 45 (21%)
    Greece 0 (0%) 1 (0%)
    Hungary 0 (0%) 2 (1%)
    Ireland 1 (1%) 0 (0%)
    Israel 22 (13%) 1 (0%)
    Italy 0 (0%) 37 (18%)
    Norway 1 (1%) 0 (0%)
    Poland 0 (0%) 70 (33%)
    Spain 95 (56%) 0 (0%)
    UK 12 (7%) 0 (0%)
    USA 14 (8%) 0 (0%)
Race

0.4
    African American 0 (0%) 1 (1%)
    Asian or Pacific Islander 0 (0%) 1 (1%)
    Caucasian 27 (100%) 89 (86%)
    Hispanic 0 (0%) 1 (1%)
    Other 0 (0%) 11 (11%)
    Unknown 143 108
Smoking 4 (14%) 12 (7%) 0.2
    Unknown 142 36
Alcohol

0.002
    Never 4 (14%) 8 (14%)
    Occasionally (1-2 times/week) 4 (14%) 20 (34%)
    Rarely (a few times/month) 9 (32%) 27 (46%)
    Regularly (3-7 times/week) 11 (39%) 4 (7%)
    Unknown 142 152
Antibiotics_usage

0.020
    1-6 months 2 (8%) 46 (30%)
    12 months/Not use 23 (92%) 106 (70%)
    Unknown 145 59
Physical_activity 4 (14%) 12 (7%) 0.2
    Unknown 142 36
Travel_period

0.066
    3 months 3 (11%) 15 (26%)
    6 months 1 (4%) 9 (16%)
    Month 4 (14%) 9 (16%)
    Year 20 (71%) 25 (43%)
    Unknown 142 153
Education_level

<0.001
    Bachelor's level 5 (18%) 26 (46%)
    Master's level 18 (64%) 10 (18%)
    School Level 5 (18%) 20 (36%)
    Unknown 142 155
Cosmetics

0.6
    Never 15 (56%) 29 (49%)
    Occasionally (a few-8 times/month) 6 (22%) 11 (19%)
    Regularly (3-7 times/week) 6 (22%) 19 (32%)
    Unknown 143 152
Sleep_duration

0.2
    > 8 hours 4 (14%) 5 (8%)
    4-6 hours 4 (14%) 5 (8%)
    6-7 hours 12 (43%) 19 (32%)
    7-8 hours 8 (29%) 30 (51%)
    Unknown 142 152
BMI_category

0.012
    normal/overweight 135 (96%) 152 (100%)
    obese 5 (4%) 0 (0%)
    underweight 1 (1%) 0 (0%)
    Unknown 29 59
1 n (%); Median (IQR)
2 Pearson’s Chi-squared test; Wilcoxon rank sum test; Fisher’s exact test
  • Загрузка датасетов с данными о микробиоме здоровых людей (bacteria_healthy) и пациентов с СРК (bacteria_ibs) и их объединение в combined_bacteria
bacteria_healthy <- read_csv("data/raw/final_bacteria_health.csv")
bacteria_ibs <- read_csv("data/raw/final_bacteria_ibs_141.csv")

combined_bacteria <- bacteria_healthy %>% 
  bind_rows (bacteria_ibs) %>% 
  mutate(patient_ID = row_number())

rm (bacteria_healthy, bacteria_ibs)
  • Объединение combined_bacteria и combined_info в data_wide
data_wide <- combined_info %>% 
  left_join (combined_bacteria)

Оценка доли NA и нулевых значений

  • Оценка доли NA в переменных data_wide
data_wide %>% 
  select (where (function(x) sum (is.na(x))/ nrow(data_wide) * 100 > 0)) %>% 
  sapply (function(x) sum (is.na(x))/ nrow(data_wide) * 100) %>% round(1) %>% 
  as.data.frame() %>% 
  rename(NA_percentage = ".") %>% 
  mutate (
    "Number of people with known data" = round (nrow(data_wide) - NA_percentage/100 * nrow(data_wide)),
    NA_percentage = paste (NA_percentage, "%", sep = " ")
    ) %>% 
  arrange(desc (NA_percentage)) %>% 
  rownames_to_column() %>% 
  as_tibble() %>% flextable()

rowname

NA_percentage

Number of people with known data

Additive_usage

97.1 %

11

Diet_duration

96.6 %

13

Diet_type

95.3 %

18

Education_level

78 %

84

Travel_period

77.4 %

86

Cosmetics

77.4 %

86

Alcohol

77.2 %

87

Sleep_duration

77.2 %

87

Race

65.9 %

130

Age

64.8 %

134

Antibiotics_usage

53.5 %

177

Sex

49.9 %

191

Smoking

46.7 %

203

Physical_activity

46.7 %

203

Age_range

24.9 %

286

BMI_category

23.1 %

293

  • Рассчитаем процент не NA и не 0 данных по колонкам широкого формата
# Устанавливаем порог процента 
threshold_percent <- 95 
 
# Функция для вычисления процента записей, не равных NA и не равных 0, для каждой колонки 
calculate_percentage <- function(col) { 
  sum(!is.na(col) & col != 0) / length(col) * 100 
} 
 
# Применяем функцию к каждой колонке в датасете 
percentage_non_zero_non_na <- sapply(data_wide[, -1], calculate_percentage) 
 
# Создаем датафрейм с результатами 
result_df_sort <- data.frame( 
  column = names(percentage_non_zero_non_na), 
  percentage = round(100 - percentage_non_zero_non_na, 2) # percentage означает пропущенные или 0 значения
) %>% 
  arrange(desc(percentage))
 
# Отфильтровываем колонки, у которых процент записей менее threshold_percent% 
filtered_columns <- result_df_sort[result_df_sort$percentage < threshold_percent, ]

# Сохраним датасет в excel для дальнейшего анализа
write.xlsx(filtered_columns, 
           file = "data/originals/percentage_by_vars.xlsx")

# Перезапись data_wide с выбором колонок с процентом NA/0 менее threshold_percent 
data_wide <- data_wide %>% 
  select (row.names(filtered_columns), research_ID)

rm (calculate_percentage, result_df_sort)
  • Рассчитаем процент не NA и не 0 данных по форматированному patient_ID
# Устанавливаем порог процента 
threshold_percent <- 95
 
# Рассчитываем процент значений, не являющихся NA и не равных 0, для каждого пациента 
percentage_non_zero_non_na <- rowMeans(!is.na(data_wide) & data_wide != 0, na.rm = TRUE) * 100 
 
# Создаем датафрейм с результатами 
result_df_sort <- data.frame( 
  patient_id = data_wide$patient_ID, 
  percentage = round(100 - percentage_non_zero_non_na, 2) # percentage означает пропущенные или 0 значения
) %>% arrange(desc(percentage))

# Отфильтровываем пациентов, у которых процент значений менее threshold_percent% 
filtered_patients <- result_df_sort[result_df_sort$percentage < threshold_percent, ] 

# Сохраним датасет в excel для дальнейшего анализа 
write.xlsx(filtered_patients,
           file = "data/originals/percentage_by_patient.xlsx") 

# Перезапись data_wide с удалением строк с процентом NA/0 более threshold_percent 
data_wide <- data_wide %>% 
  slice (filtered_patients$patient_id) #при threshold_percent = 95%, изменения data_wide не происходит, так как нет пациентов с процентом NA/0 более 95%

rm (percentage_non_zero_non_na, result_df_sort)
  • Удалениe из data_wide колонок и строк с процентом NA/0 более threshold_percent
data_wide <- data_wide %>% 
  select (patient_ID, any_of (colnames(combined_info)), everything()) %>% 
  arrange(patient_ID)

Поиск “таксонов одного исследования”

Среднее содержание G_таксонов, которые были обнаружены только в одном исследовании

G_only_one <- data_wide %>% 
  select (research_ID, ends_with("_G")) %>%
  add_column(n = 1) %>% #колонка для дальнейшего подсчёта количества субъектов в исследовании
  group_by(research_ID) %>% 
  summarise_each (sum) %>% 
  select (research_ID, n, where (function(x) sum (x!=0) == 1)) %>%  #выбираем таксоны, которые обнаружены только в одном исследовании 
  mutate (across(-c(1:2),
                 function(x) x/n))
## Warning: `summarise_each_()` was deprecated in dplyr 0.7.0.
## ℹ Please use `across()` instead.
## ℹ The deprecated feature was likely used in the dplyr package.
##   Please report the issue at <https://github.com/tidyverse/dplyr/issues>.
## This warning is displayed once every 8 hours.
## Call `lifecycle::last_lifecycle_warnings()` to see where this warning was
## generated.
G_only_one
## # A tibble: 7 × 15
##   research_ID     n CM1G08_G Cladosporium_G Lentimonas_G Micromonospora_G
##         <dbl> <dbl>    <dbl>          <dbl>        <dbl>            <dbl>
## 1           1    46  0              0             0.0500           0.0331
## 2           2    36  0              0.00811       0                0     
## 3           3    70  0              0             0                0     
## 4           4    87  0.00550        0             0                0     
## 5           5    25  0              0             0                0     
## 6           6    22  0              0             0                0     
## 7           7    95  0              0             0                0     
## # ℹ 9 more variables: Pseudosphingobacterium_G <dbl>,
## #   `Schizothrix LEGE 07164_G` <dbl>, Talaromyces_G <dbl>,
## #   `Rs-D38 termite group_G` <dbl>, Kabatiella_G <dbl>,
## #   `Anaerolineaceae UCG-001_G` <dbl>, Iamia_G <dbl>, Thiohalocapsa_G <dbl>,
## #   Ellin517_G <dbl>
  • Определение процента людей, у которых данные таксоны не обнаружены ()

Среднее содержание F_таксонов, которые были обнаружены только в одном исследовании

data_wide %>% 
  select (research_ID, ends_with("_F")) %>%
  add_column(n = 1) %>% #колонка для дальнейшего подсчёта количества субъектов в исследовании
  group_by(research_ID) %>% 
  summarise_each (sum) %>% 
  select (research_ID, n, where (function(x) sum (x!=0) == 1)) %>%  #выбираем таксоны, которые обнаружены только в одном исследовании 
  mutate (across(-c(1:2),
                 function(x) x/n))
## # A tibble: 7 × 9
##   research_ID     n Didymellaceae_F Cladosporiaceae_F Trichocomaceae_F
##         <dbl> <dbl>           <dbl>             <dbl>            <dbl>
## 1           1    46          0                0                 0     
## 2           2    36          0.0213           0.00811           0.0143
## 3           3    70          0                0                 0     
## 4           4    87          0                0                 0     
## 5           5    25          0                0                 0     
## 6           6    22          0                0                 0     
## 7           7    95          0                0                 0     
## # ℹ 4 more variables: `type III_F` <dbl>, `09D2Z48_F` <dbl>,
## #   Aureobasidiaceae_F <dbl>, Iamiaceae_F <dbl>
  • Определение процента людей, у которых данные таксоны не обнаружены ()

Среднее содержание O_таксонов, которые были обнаружены только в одном исследовании

data_wide %>% 
  select (research_ID, ends_with("_O")) %>%
  add_column(n = 1) %>% #колонка для дальнейшего подсчёта количества субъектов в исследовании
  group_by(research_ID) %>% 
  summarise_each (sum) %>% 
  select (research_ID, n, where (function(x) sum (x!=0) == 1)) %>%  #выбираем таксоны, которые обнаружены только в одном исследовании 
  mutate (across(-c(1:2),
                 function(x) x/n))
## # A tibble: 7 × 12
##   research_ID     n Hypocreales_O Pleosporales_O `Candidatus Abawacabacteria_O`
##         <dbl> <dbl>         <dbl>          <dbl>                          <dbl>
## 1           1    46        0              0                             0.00892
## 2           2    36        0.0622         0.0367                        0      
## 3           3    70        0              0                             0      
## 4           4    87        0              0                             0      
## 5           5    25        0              0                             0      
## 6           6    22        0              0                             0      
## 7           7    95        0              0                             0      
## # ℹ 7 more variables: `Candidatus Peregrinibacteria_O` <dbl>,
## #   Capnodiales_O <dbl>, `Candidatus Terrybacteria_O` <dbl>,
## #   Eurotiales_O <dbl>, Dothideales_O <dbl>, eub62A3_O <dbl>,
## #   `LD1-PA32_O` <dbl>
  • Определение процента людей, у которых данные таксоны не обнаружены ()

Среднее содержание C_таксонов, которые были обнаружены только в одном исследовании

data_wide %>% 
  select (research_ID, ends_with("_C")) %>%
  add_column(n = 1) %>% #колонка для дальнейшего подсчёта количества субъектов в исследовании
  group_by(research_ID) %>% 
  summarise_each (sum) %>% 
  select (research_ID, n, where (function(x) sum (x!=0) == 1)) %>%  #выбираем таксоны, которые обнаружены только в одном исследовании 
  mutate (across(-c(1:2),
                 function(x) x/n))
## # A tibble: 7 × 5
##   research_ID     n WWE3_C Eurotiomycetes_C Dothideomycetes_C
##         <dbl> <dbl>  <dbl>            <dbl>             <dbl>
## 1           1    46 0                0                  0    
## 2           2    36 0                0.0229             0.102
## 3           3    70 0                0                  0    
## 4           4    87 0.0135           0                  0    
## 5           5    25 0                0                  0    
## 6           6    22 0                0                  0    
## 7           7    95 0                0                  0
  • Определение процента людей, у которых данные таксоны не обнаружены ()

Среднее содержание P_таксонов, которые были обнаружены только в одном исследовании

P_таксонов, которые были обнаружены только в одном исследовании, нет

    ## data_wide (not batched) `

data_wide <- data_wide %>% 
  select (!colnames (G_only_one) [- c (1,2)]) #удаление G_таксонов, которые обнаружены только в одном исследовании (все они в этом исследовании встречались редко - до 25% людей)

data_wide_not_batched <- data_wide  

write_rds(data_wide, 
          file = "data/originals/data_wide_not_batched.rds")

Кластеризация

Кластеризация родов (G-таксонов)

AGNES (agglomerative clustering)

clusters_number <- 4 #количество кластеров

library(cluster)
library(factoextra)

G_scaled <- data_wide %>% 
  mutate(patient_ID = paste0("patient_", patient_ID)) %>% 
  column_to_rownames("patient_ID") %>% 
  select (ends_with("_G")) %>% #выбираем только G-таксоны
  scale () #нормируем данные

agnes <- G_scaled %>% 
  dist (method = "euclidean") %>% #cоздаём матрицу дистанций
  as.matrix() %>%  
  agnes( #выбираем Agglomerative clustering (иерархическая кластеризация снизу вверх)
    diss = TRUE, #на вход подана dissimilarity matrix
    method = "ward")

fviz_dend(agnes,
          k = clusters_number,
          rect = TRUE,
          k_colors = "jco",
          show_labels = TRUE,
          label_cols = ifelse (data_wide[agnes$order,]$Health_state == "Health", "green", "red"),#цвет лейблов определяется по Health_state
          cex = 0.2, #размер шрифта лейблов
          main = "Дендрограмма кластеризации субъектов по количеству G-таксонов",
          ylab = "Высота")

  • Сравнение полученных кластеров по основным переменным
data_wide %>% 
  add_column("Cluster" = cutree(agnes, k = clusters_number)) %>% # Создаём новый столбец - вектор принадлежности к кластерам  
  select(any_of(colnames (combined_info)), Cluster, - patient_ID) %>% 
  tbl_summary(digits = list(all_continuous() ~ c(0, 0),
                            all_categorical() ~ c(0, 0)),
              by = Cluster) %>% 
  add_p()
Characteristic 1, N = 461 2, N = 961 3, N = 2141 4, N = 251 p-value2
research_ID




    1 46 (100%) 0 (0%) 0 (0%) 0 (0%)
    2 0 (0%) 31 (32%) 5 (2%) 0 (0%)
    3 0 (0%) 65 (68%) 5 (2%) 0 (0%)
    4 0 (0%) 0 (0%) 87 (41%) 0 (0%)
    5 0 (0%) 0 (0%) 0 (0%) 25 (100%)
    6 0 (0%) 0 (0%) 22 (10%) 0 (0%)
    7 0 (0%) 0 (0%) 95 (44%) 0 (0%)
Seq_region




    V3-V4 0 (0%) 96 (100%) 10 (5%) 0 (0%)
    V4 0 (0%) 0 (0%) 204 (95%) 25 (100%)
    V5-V6 46 (100%) 0 (0%) 0 (0%) 0 (0%)
Seq_date




    2015 0 (0%) 0 (0%) 95 (44%) 0 (0%)
    2017 0 (0%) 0 (0%) 0 (0%) 25 (100%)
    2018 46 (100%) 31 (32%) 19 (9%) 0 (0%)
    2020 0 (0%) 0 (0%) 39 (18%) 0 (0%)
    2021 0 (0%) 0 (0%) 32 (15%) 0 (0%)
    2022 0 (0%) 0 (0%) 23 (11%) 0 (0%)
    2023 0 (0%) 65 (68%) 6 (3%) 0 (0%)
Health_state



<0.001
    Disease 0 (0%) 0 (0%) 145 (68%) 25 (100%)
    Health 46 (100%) 96 (100%) 69 (32%) 0 (0%)
Age NA (NA, NA) NA (NA, NA) 33 (27, 47) 39 (28, 49) 0.5
    Unknown 46 96 105 0
Age_range



<0.001
    > 43 0 (0%) 0 (0%) 34 (29%) 10 (40%)
    16-43 46 (100%) 96 (100%) 85 (71%) 15 (60%)
    Unknown 0 0 95 0
Sex



0.042
    female 0 (NA%) 38 (40%) 25 (36%) 16 (64%)
    male 0 (NA%) 58 (60%) 45 (64%) 9 (36%)
    Unknown 46 0 144 0
Country




    Australia 0 (0%) 0 (0%) 6 (3%) 0 (0%)
    Austria 0 (0%) 0 (0%) 3 (1%) 25 (100%)
    Belgium 46 (100%) 0 (0%) 0 (0%) 0 (0%)
    Germany 0 (0%) 0 (0%) 45 (21%) 0 (0%)
    Greece 0 (0%) 0 (0%) 1 (0%) 0 (0%)
    Hungary 0 (0%) 0 (0%) 2 (1%) 0 (0%)
    Ireland 0 (0%) 0 (0%) 1 (0%) 0 (0%)
    Israel 0 (0%) 0 (0%) 23 (11%) 0 (0%)
    Italy 0 (0%) 31 (32%) 6 (3%) 0 (0%)
    Norway 0 (0%) 0 (0%) 1 (0%) 0 (0%)
    Poland 0 (0%) 65 (68%) 5 (2%) 0 (0%)
    Spain 0 (0%) 0 (0%) 95 (44%) 0 (0%)
    UK 0 (0%) 0 (0%) 12 (6%) 0 (0%)
    USA 0 (0%) 0 (0%) 14 (7%) 0 (0%)
Race



0.015
    African American 0 (0%) 0 (NA%) 1 (1%) 0 (NA%)
    Asian or Pacific Islander 0 (0%) 0 (NA%) 1 (1%) 0 (NA%)
    Caucasian 46 (100%) 0 (NA%) 70 (83%) 0 (NA%)
    Hispanic 0 (0%) 0 (NA%) 1 (1%) 0 (NA%)
    Other 0 (0%) 0 (NA%) 11 (13%) 0 (NA%)
    Unknown 0 96 130 25
Smoking 0 (0%) 0 (0%) 16 (17%) 0 (NA%) <0.001
    Unknown 0 31 122 25
Alcohol



>0.9
    Never 0 (NA%) 0 (NA%) 12 (14%) 0 (NA%)
    Occasionally (1-2 times/week) 0 (NA%) 0 (NA%) 24 (28%) 0 (NA%)
    Rarely (a few times/month) 0 (NA%) 0 (NA%) 36 (41%) 0 (NA%)
    Regularly (3-7 times/week) 0 (NA%) 0 (NA%) 15 (17%) 0 (NA%)
    Unknown 46 96 127 25
Antibiotics_usage



<0.001
    1-6 months 46 (100%) 0 (0%) 2 (6%) 0 (NA%)
    12 months/Not use 0 (0%) 96 (100%) 33 (94%) 0 (NA%)
    Unknown 0 0 179 25
Physical_activity 0 (0%) 0 (0%) 16 (17%) 0 (NA%) <0.001
    Unknown 0 31 122 25
Travel_period



>0.9
    3 months 0 (NA%) 0 (NA%) 18 (21%) 0 (NA%)
    6 months 0 (NA%) 0 (NA%) 10 (12%) 0 (NA%)
    Month 0 (NA%) 0 (NA%) 13 (15%) 0 (NA%)
    Year 0 (NA%) 0 (NA%) 45 (52%) 0 (NA%)
    Unknown 46 96 128 25
Education_level



>0.9
    Bachelor's level 0 (NA%) 0 (NA%) 31 (37%) 0 (NA%)
    Master's level 0 (NA%) 0 (NA%) 28 (33%) 0 (NA%)
    School Level 0 (NA%) 0 (NA%) 25 (30%) 0 (NA%)
    Unknown 46 96 130 25
Cosmetics



>0.9
    Never 0 (NA%) 0 (NA%) 44 (51%) 0 (NA%)
    Occasionally (a few-8 times/month) 0 (NA%) 0 (NA%) 17 (20%) 0 (NA%)
    Regularly (3-7 times/week) 0 (NA%) 0 (NA%) 25 (29%) 0 (NA%)
    Unknown 46 96 128 25
Sleep_duration



>0.9
    > 8 hours 0 (NA%) 0 (NA%) 9 (10%) 0 (NA%)
    4-6 hours 0 (NA%) 0 (NA%) 9 (10%) 0 (NA%)
    6-7 hours 0 (NA%) 0 (NA%) 31 (36%) 0 (NA%)
    7-8 hours 0 (NA%) 0 (NA%) 38 (44%) 0 (NA%)
    Unknown 46 96 127 25
BMI_category



0.2
    normal/overweight 46 (100%) 96 (100%) 145 (96%) 0 (NA%)
    obese 0 (0%) 0 (0%) 5 (3%) 0 (NA%)
    underweight 0 (0%) 0 (0%) 1 (1%) 0 (NA%)
    Unknown 0 0 63 25
1 n (%); Median (IQR)
2 Pearson’s Chi-squared test; Kruskal-Wallis rank sum test; Fisher’s exact test

kMeans

kmeans <- G_scaled %>% 
  kmeans(centers = clusters_number, # Кол-во кластеров
         iter.max = 20, # Максимальное кол-во итераций
         nstart = 35) # Кол-во центройдов в начале

  fviz_cluster(kmeans,data = G_scaled,
               ellipse = FALSE,
               show.clust.cent = FALSE,
               geom = "point",
               main = "Кластеризация субъектов по содержанию G-таксонов до batch-коррекции")

Определение оптимального количества кластеров

  • методом локтя
G_scaled %>% 
fviz_nbclust(FUN = hcut, method = "wss") 

  • с помощью коэффициента силуэта
G_scaled %>% 
  fviz_nbclust(FUN = hcut, method = "silhouette") 

DBSCAN

  • определением оптимального размера радиуса (eps)
G_scaled %>% 
dbscan::kNNdistplot(minPts = 20)  # мин. количество субъектов в кластере

abline(h=37, col = "red", lty = 2)

G_scaled %>%
dbscan::dbscan(eps = 37, # радиус
       minPts = 20) %>%  # мин. количество субъектов в кластере
  fviz_cluster(
    data = G_scaled, 
    stand = TRUE,
    ellipse = FALSE, 
    show.clust.cent = FALSE,
    geom = "point", 
    palette = "jco", 
    ggtheme = theme_classic())

AGNES (несходство Брея - Кертиса)

  • с матрицей-дистанций с показателями несходства Брея — Кертиса
agnes2 <- data_wide %>% 
  column_to_rownames("patient_ID") %>% 
  select (ends_with("_G")) %>% 
  vegdist(method = "bray") %>% #cоздаём матрицу дистанций, рассчитывая показатель несходства Брея — Кертиса (Bray-Curtis dissimilarity, 0 - полное совпадение пациентов по составу микробиоты, 1 - полное несовпадение 
  as.matrix() %>% 
  agnes( #выбираем Agglomerative clustering (иерархическая кластеризация снизу вверх)
    diss = TRUE, #на вход подана dissimilarity matrix
    method = "ward")

fviz_dend(agnes2, 
          cex = 0.2, k = 3,
          rect = TRUE,
          k_colors = "jco",
          color_labels_by_k = FALSE,
          label_cols = ifelse (data_wide[agnes2$order,]$Health_state == "Health", "green", "red"),
          main = "Дендрограмма кластеризации субъектов по количеству G-таксонов",
  ylab = "Высота",)

  • Сравнение полученных кластеров по основным переменным
fisher.test.simulate.p.values <- function(data, variable, by, ...) {
  result <- list()
  test_results <- stats::fisher.test(data[[variable]], data[[by]], simulate.p.value = TRUE)
  result$p <- test_results$p.value
  result$test <- test_results$method
  result
}

data_wide %>% 
  add_column("Cluster" = cutree(agnes2, k = 3)) %>% # Создаём новый столбец - вектор принадлежности к кластерам  
  select(any_of(colnames (combined_info)), Cluster, - patient_ID) %>% 
  tbl_summary(digits = list(all_continuous() ~ c(0, 0),
                            all_categorical() ~ c(0, 0)),
              by = Cluster) %>% 
  add_p(test = list(all_categorical() ~ "fisher.test.simulate.p.values"))  # this applies the custom test to all categorical variables
Characteristic 1, N = 821 2, N = 2531 3, N = 461 p-value2
research_ID


<0.001
    1 46 (56%) 0 (0%) 0 (0%)
    2 0 (0%) 33 (13%) 3 (7%)
    3 2 (2%) 59 (23%) 9 (20%)
    4 16 (20%) 62 (25%) 9 (20%)
    5 13 (16%) 12 (5%) 0 (0%)
    6 2 (2%) 16 (6%) 4 (9%)
    7 3 (4%) 71 (28%) 21 (46%)
Seq_region


<0.001
    V3-V4 2 (2%) 92 (36%) 12 (26%)
    V4 34 (41%) 161 (64%) 34 (74%)
    V5-V6 46 (56%) 0 (0%) 0 (0%)
Seq_date


<0.001
    2015 3 (4%) 71 (28%) 21 (46%)
    2017 13 (16%) 12 (5%) 0 (0%)
    2018 47 (57%) 44 (17%) 5 (11%)
    2020 10 (12%) 24 (9%) 5 (11%)
    2021 5 (6%) 25 (10%) 2 (4%)
    2022 2 (2%) 17 (7%) 4 (9%)
    2023 2 (2%) 60 (24%) 9 (20%)
Health_state


<0.001
    Disease 20 (24%) 121 (48%) 29 (63%)
    Health 62 (76%) 132 (52%) 17 (37%)
Age 31 (26, 41) 39 (28, 49) 32 (29, 38) 0.11
    Unknown 51 163 33
Age_range


0.11
    > 43 7 (9%) 34 (19%) 3 (12%)
    16-43 72 (91%) 148 (81%) 22 (88%)
    Unknown 3 71 21
Sex


>0.9
    female 8 (40%) 64 (42%) 7 (37%)
    male 12 (60%) 88 (58%) 12 (63%)
    Unknown 62 101 27
Country


<0.001
    Australia 1 (1%) 5 (2%) 0 (0%)
    Austria 14 (17%) 14 (6%) 0 (0%)
    Belgium 46 (56%) 0 (0%) 0 (0%)
    Germany 12 (15%) 28 (11%) 5 (11%)
    Greece 0 (0%) 1 (0%) 0 (0%)
    Hungary 0 (0%) 2 (1%) 0 (0%)
    Ireland 0 (0%) 1 (0%) 0 (0%)
    Israel 2 (2%) 17 (7%) 4 (9%)
    Italy 0 (0%) 34 (13%) 3 (7%)
    Norway 0 (0%) 1 (0%) 0 (0%)
    Poland 2 (2%) 59 (23%) 9 (20%)
    Spain 3 (4%) 71 (28%) 21 (46%)
    UK 1 (1%) 7 (3%) 4 (9%)
    USA 1 (1%) 13 (5%) 0 (0%)
Race


0.2
    African American 0 (0%) 1 (2%) 0 (0%)
    Asian or Pacific Islander 0 (0%) 0 (0%) 1 (11%)
    Caucasian 55 (92%) 54 (89%) 7 (78%)
    Hispanic 1 (2%) 0 (0%) 0 (0%)
    Other 4 (7%) 6 (10%) 1 (11%)
    Unknown 22 192 37
Smoking 3 (5%) 12 (10%) 1 (6%) 0.5
    Unknown 18 132 28
Alcohol


0.6
    Never 1 (6%) 10 (16%) 1 (11%)
    Occasionally (1-2 times/week) 6 (38%) 17 (27%) 1 (11%)
    Rarely (a few times/month) 8 (50%) 24 (39%) 4 (44%)
    Regularly (3-7 times/week) 1 (6%) 11 (18%) 3 (33%)
    Unknown 66 191 37
Antibiotics_usage


<0.001
    1-6 months 47 (94%) 1 (1%) 0 (0%)
    12 months/Not use 3 (6%) 110 (99%) 16 (100%)
    Unknown 32 142 30
Physical_activity 3 (5%) 12 (10%) 1 (6%) 0.5
    Unknown 18 132 28
Travel_period


0.3
    3 months 2 (13%) 15 (25%) 1 (11%)
    6 months 1 (6%) 8 (13%) 1 (11%)
    Month 6 (38%) 6 (10%) 1 (11%)
    Year 7 (44%) 32 (52%) 6 (67%)
    Unknown 66 192 37
Education_level


0.2
    Bachelor's level 10 (63%) 18 (31%) 3 (33%)
    Master's level 3 (19%) 21 (36%) 4 (44%)
    School Level 3 (19%) 20 (34%) 2 (22%)
    Unknown 66 194 37
Cosmetics


0.5
    Never 7 (44%) 33 (53%) 4 (50%)
    Occasionally (a few-8 times/month) 4 (25%) 10 (16%) 3 (38%)
    Regularly (3-7 times/week) 5 (31%) 19 (31%) 1 (13%)
    Unknown 66 191 38
Sleep_duration


0.7
    > 8 hours 1 (6%) 7 (11%) 1 (11%)
    4-6 hours 2 (13%) 6 (10%) 1 (11%)
    6-7 hours 7 (44%) 23 (37%) 1 (11%)
    7-8 hours 6 (38%) 26 (42%) 6 (67%)
    Unknown 66 191 37
BMI_category


0.15
    normal/overweight 55 (100%) 193 (97%) 39 (98%)
    obese 0 (0%) 5 (3%) 0 (0%)
    underweight 0 (0%) 0 (0%) 1 (3%)
    Unknown 27 55 6
1 n (%); Median (IQR)
2 Fisher’s Exact Test for Count Data with simulated p-value (based on 2000 replicates); Kruskal-Wallis rank sum test

Кластеризация семейств (F-таксонов)

AGNES (agglomerative clustering)

clusters_number <- 2 #количество кластеров

F_scaled <- data_wide %>% 
  mutate(patient_ID = paste0("patient_", patient_ID)) %>% 
  column_to_rownames("patient_ID") %>% 
  select (ends_with("_F")) %>% #выбираем только G-таксоны
  scale () #нормируем данные

agnes <- F_scaled %>% 
  dist (method = "euclidean") %>% #cоздаём матрицу дистанций
  as.matrix() %>%  
  agnes(
    diss = TRUE, #на вход подана dissimilarity matrix
    method = "ward")

fviz_dend(agnes,
          k = clusters_number,
          rect = TRUE,
          k_colors = "jco",
          show_labels = TRUE,
          label_cols = ifelse (data_wide[agnes$order,]$Health_state == "Health", "green", "red"),#цвет лейблов определяется по Health_state
          cex = 0.2, #размер шрифта лейблов
          main = "Кластеризация субъектов по содержанию G-таксонов до коррекции batch-эффекта",
          ylab = "Высота")

  • Сравнение полученных кластеров по основным переменным
data_wide %>% 
  add_column("Cluster" = cutree(agnes, k = clusters_number)) %>% #Создаём новый столбец - вектор принадлежности к кластерам  
  select(any_of(colnames (combined_info)), Cluster, - patient_ID) %>% 
  tbl_summary(digits = list(all_continuous() ~ c(0, 0),
                            all_categorical() ~ c(0, 0)),
              by = Cluster) %>% 
  add_p()
Characteristic 1, N = 461 2, N = 3351 p-value2
research_ID

<0.001
    1 46 (100%) 0 (0%)
    2 0 (0%) 36 (11%)
    3 0 (0%) 70 (21%)
    4 0 (0%) 87 (26%)
    5 0 (0%) 25 (7%)
    6 0 (0%) 22 (7%)
    7 0 (0%) 95 (28%)
Seq_region

<0.001
    V3-V4 0 (0%) 106 (32%)
    V4 0 (0%) 229 (68%)
    V5-V6 46 (100%) 0 (0%)
Seq_date


    2015 0 (0%) 95 (28%)
    2017 0 (0%) 25 (7%)
    2018 46 (100%) 50 (15%)
    2020 0 (0%) 39 (12%)
    2021 0 (0%) 32 (10%)
    2022 0 (0%) 23 (7%)
    2023 0 (0%) 71 (21%)
Health_state

<0.001
    Disease 0 (0%) 170 (51%)
    Health 46 (100%) 165 (49%)
Age NA (NA, NA) 34 (27, 47)
    Unknown 46 201
Age_range

0.002
    > 43 0 (0%) 44 (18%)
    16-43 46 (100%) 196 (82%)
    Unknown 0 95
Sex

>0.9
    female 0 (NA%) 79 (41%)
    male 0 (NA%) 112 (59%)
    Unknown 46 144
Country

<0.001
    Australia 0 (0%) 6 (2%)
    Austria 0 (0%) 28 (8%)
    Belgium 46 (100%) 0 (0%)
    Germany 0 (0%) 45 (13%)
    Greece 0 (0%) 1 (0%)
    Hungary 0 (0%) 2 (1%)
    Ireland 0 (0%) 1 (0%)
    Israel 0 (0%) 23 (7%)
    Italy 0 (0%) 37 (11%)
    Norway 0 (0%) 1 (0%)
    Poland 0 (0%) 70 (21%)
    Spain 0 (0%) 95 (28%)
    UK 0 (0%) 12 (4%)
    USA 0 (0%) 14 (4%)
Race

0.015
    African American 0 (0%) 1 (1%)
    Asian or Pacific Islander 0 (0%) 1 (1%)
    Caucasian 46 (100%) 70 (83%)
    Hispanic 0 (0%) 1 (1%)
    Other 0 (0%) 11 (13%)
    Unknown 0 251
Smoking 0 (0%) 16 (10%) 0.025
    Unknown 0 178
Alcohol

>0.9
    Never 0 (NA%) 12 (14%)
    Occasionally (1-2 times/week) 0 (NA%) 24 (28%)
    Rarely (a few times/month) 0 (NA%) 36 (41%)
    Regularly (3-7 times/week) 0 (NA%) 15 (17%)
    Unknown 46 248
Antibiotics_usage

<0.001
    1-6 months 46 (100%) 2 (2%)
    12 months/Not use 0 (0%) 129 (98%)
    Unknown 0 204
Physical_activity 0 (0%) 16 (10%) 0.025
    Unknown 0 178
Travel_period

>0.9
    3 months 0 (NA%) 18 (21%)
    6 months 0 (NA%) 10 (12%)
    Month 0 (NA%) 13 (15%)
    Year 0 (NA%) 45 (52%)
    Unknown 46 249
Education_level

>0.9
    Bachelor's level 0 (NA%) 31 (37%)
    Master's level 0 (NA%) 28 (33%)
    School Level 0 (NA%) 25 (30%)
    Unknown 46 251
Cosmetics

>0.9
    Never 0 (NA%) 44 (51%)
    Occasionally (a few-8 times/month) 0 (NA%) 17 (20%)
    Regularly (3-7 times/week) 0 (NA%) 25 (29%)
    Unknown 46 249
Sleep_duration

>0.9
    > 8 hours 0 (NA%) 9 (10%)
    4-6 hours 0 (NA%) 9 (10%)
    6-7 hours 0 (NA%) 31 (36%)
    7-8 hours 0 (NA%) 38 (44%)
    Unknown 46 248
BMI_category

>0.9
    normal/overweight 46 (100%) 241 (98%)
    obese 0 (0%) 5 (2%)
    underweight 0 (0%) 1 (0%)
    Unknown 0 88
1 n (%); Median (IQR)
2 Fisher’s exact test; Pearson’s Chi-squared test

kMeans

kmeans <- F_scaled %>% 
  kmeans(centers = clusters_number, # Кол-во кластеров
         iter.max = 20, # Максимальное кол-во итераций
         nstart = 35) # Кол-во центройдов в начале

  fviz_cluster(kmeans,data = F_scaled,
               ellipse = FALSE,
               show.clust.cent = FALSE,
               geom = "point",
               main = "Кластеризация субъектов по F_таксонам")

DBSCAN

  • определением оптимального размера радиуса (eps)
F_scaled %>% 
dbscan::kNNdistplot(minPts = 20)  # мин. количество субъектов в кластере

abline(h=25, col = "red", lty = 2)

F_scaled %>%
dbscan::dbscan(eps = 25, # радиус
       minPts = 20) %>%  # мин. количество субъектов в кластере
  fviz_cluster(
    data = F_scaled, 
    stand = TRUE,
    ellipse = FALSE, 
    show.clust.cent = FALSE,
    geom = "point", 
    palette = "jco", 
    ggtheme = theme_classic())

Кластеризация порядков (O-таксонов)

AGNES (agglomerative clustering)

clusters_number <- 2 #количество кластеров

O_scaled <- data_wide %>% 
  mutate(patient_ID = paste0("patient_", patient_ID)) %>% 
  column_to_rownames("patient_ID") %>% 
  select (ends_with("_O")) %>% #выбираем только G-таксоны
  scale () #нормируем данные

agnes <- O_scaled %>% 
  dist (method = "euclidean") %>% #cоздаём матрицу дистанций
  as.matrix() %>%  
  agnes(
    diss = TRUE, #на вход подана dissimilarity matrix
    method = "ward")

fviz_dend(agnes,
          k = clusters_number,
          rect = TRUE,
          k_colors = "jco",
          show_labels = TRUE,
          label_cols = ifelse (data_wide[agnes$order,]$Health_state == "Health", "green", "red"),#цвет лейблов определяется по Health_state
          cex = 0.2, #размер шрифта лейблов
          main = "Дендрограмма кластеризации субъектов по количеству G-таксонов",
          ylab = "Высота")

  • Сравнение полученных кластеров по основным переменным
data_wide %>% 
  add_column("Cluster" = cutree(agnes, k = clusters_number)) %>% #Создаём новый столбец - вектор принадлежности к кластерам  
  select(any_of(colnames (combined_info)), Cluster, - patient_ID) %>% 
  tbl_summary(digits = list(all_continuous() ~ c(0, 0),
                            all_categorical() ~ c(0, 0)),
              by = Cluster) %>% 
  add_p()
Characteristic 1, N = 461 2, N = 3351 p-value2
research_ID

<0.001
    1 46 (100%) 0 (0%)
    2 0 (0%) 36 (11%)
    3 0 (0%) 70 (21%)
    4 0 (0%) 87 (26%)
    5 0 (0%) 25 (7%)
    6 0 (0%) 22 (7%)
    7 0 (0%) 95 (28%)
Seq_region

<0.001
    V3-V4 0 (0%) 106 (32%)
    V4 0 (0%) 229 (68%)
    V5-V6 46 (100%) 0 (0%)
Seq_date


    2015 0 (0%) 95 (28%)
    2017 0 (0%) 25 (7%)
    2018 46 (100%) 50 (15%)
    2020 0 (0%) 39 (12%)
    2021 0 (0%) 32 (10%)
    2022 0 (0%) 23 (7%)
    2023 0 (0%) 71 (21%)
Health_state

<0.001
    Disease 0 (0%) 170 (51%)
    Health 46 (100%) 165 (49%)
Age NA (NA, NA) 34 (27, 47)
    Unknown 46 201
Age_range

0.002
    > 43 0 (0%) 44 (18%)
    16-43 46 (100%) 196 (82%)
    Unknown 0 95
Sex

>0.9
    female 0 (NA%) 79 (41%)
    male 0 (NA%) 112 (59%)
    Unknown 46 144
Country

<0.001
    Australia 0 (0%) 6 (2%)
    Austria 0 (0%) 28 (8%)
    Belgium 46 (100%) 0 (0%)
    Germany 0 (0%) 45 (13%)
    Greece 0 (0%) 1 (0%)
    Hungary 0 (0%) 2 (1%)
    Ireland 0 (0%) 1 (0%)
    Israel 0 (0%) 23 (7%)
    Italy 0 (0%) 37 (11%)
    Norway 0 (0%) 1 (0%)
    Poland 0 (0%) 70 (21%)
    Spain 0 (0%) 95 (28%)
    UK 0 (0%) 12 (4%)
    USA 0 (0%) 14 (4%)
Race

0.015
    African American 0 (0%) 1 (1%)
    Asian or Pacific Islander 0 (0%) 1 (1%)
    Caucasian 46 (100%) 70 (83%)
    Hispanic 0 (0%) 1 (1%)
    Other 0 (0%) 11 (13%)
    Unknown 0 251
Smoking 0 (0%) 16 (10%) 0.025
    Unknown 0 178
Alcohol

>0.9
    Never 0 (NA%) 12 (14%)
    Occasionally (1-2 times/week) 0 (NA%) 24 (28%)
    Rarely (a few times/month) 0 (NA%) 36 (41%)
    Regularly (3-7 times/week) 0 (NA%) 15 (17%)
    Unknown 46 248
Antibiotics_usage

<0.001
    1-6 months 46 (100%) 2 (2%)
    12 months/Not use 0 (0%) 129 (98%)
    Unknown 0 204
Physical_activity 0 (0%) 16 (10%) 0.025
    Unknown 0 178
Travel_period

>0.9
    3 months 0 (NA%) 18 (21%)
    6 months 0 (NA%) 10 (12%)
    Month 0 (NA%) 13 (15%)
    Year 0 (NA%) 45 (52%)
    Unknown 46 249
Education_level

>0.9
    Bachelor's level 0 (NA%) 31 (37%)
    Master's level 0 (NA%) 28 (33%)
    School Level 0 (NA%) 25 (30%)
    Unknown 46 251
Cosmetics

>0.9
    Never 0 (NA%) 44 (51%)
    Occasionally (a few-8 times/month) 0 (NA%) 17 (20%)
    Regularly (3-7 times/week) 0 (NA%) 25 (29%)
    Unknown 46 249
Sleep_duration

>0.9
    > 8 hours 0 (NA%) 9 (10%)
    4-6 hours 0 (NA%) 9 (10%)
    6-7 hours 0 (NA%) 31 (36%)
    7-8 hours 0 (NA%) 38 (44%)
    Unknown 46 248
BMI_category

>0.9
    normal/overweight 46 (100%) 241 (98%)
    obese 0 (0%) 5 (2%)
    underweight 0 (0%) 1 (0%)
    Unknown 0 88
1 n (%); Median (IQR)
2 Fisher’s exact test; Pearson’s Chi-squared test

kMeans

kmeans <- O_scaled %>% 
  kmeans(centers = clusters_number, # Кол-во кластеров
         iter.max = 20, # Максимальное кол-во итераций
         nstart = 35) # Кол-во центройдов в начале

  fviz_cluster(kmeans,data = O_scaled,
               ellipse = FALSE,
               show.clust.cent = FALSE,
               geom = "point",
               main = "Кластеризация субъектов по O_таксонам")

DBSCAN

  • определением оптимального размера радиуса (eps)
O_scaled %>% 
dbscan::kNNdistplot(minPts = 20)  # мин. количество субъектов в кластере

abline(h=18, col = "red", lty = 2)

O_scaled %>%
dbscan::dbscan(eps = 18, #радиус
       minPts = 20) %>%  #мин. количество субъектов в кластере
  fviz_cluster(
    data = O_scaled, 
    stand = TRUE,
    ellipse = FALSE, 
    show.clust.cent = FALSE,
    geom = "point", 
    palette = "jco", 
    ggtheme = theme_classic())

Batch-effects correction

Подготовлен Preliminary report (data/originals/).

  • сравнение batch-эффектов от research_ID и Seq_region по их процентному вкладу в вариацию данных
mbecModelVariance(
  input.obj=mbec.obj, 
  model.vars=c('research_ID', 'Health_state'),
  method="pvca",type="otu") %>% 
  mbecPVCAStatsPlot() 

mbecModelVariance(
  input.obj=mbec.obj, 
  model.vars=c('Seq_region', 'Health_state'),
  method="pvca",type="otu") %>% 
  mbecPVCAStatsPlot()

  • коррекция batch-эффекта (research_ID)

  • Извлечение скорректированных данных

library (datawizard)

#Retrieve corrrected data
ps.cor.bat <- mbecGetPhyloseq(mbec.obj, 
                          type="cor",
                          label="bat") #which type of data to add (correction)

combined_bacteria_batched <- ps.cor.bat@otu_table %>% 
  as.data.frame() %>% 
  data_rotate (rownames = "patient_ID") %>% 
  mutate (patient_ID = sub ("S", "", patient_ID),
          patient_ID = as.numeric(patient_ID))

data_wide_batched <- combined_info %>% 
  select (where (function(x) 
      sum (!is.na(x))/ nrow(.) * 100 >= 5)) %>% #выбор переменных, у которых менее 95% NA
  left_join(combined_bacteria_batched)

rm (combined_bacteria_batched)

####Principal Component Analysis

  • Principal Component Analysis до коррекции batch-эффекта (research_ID)
plot <- mbecPCA(input.obj=mbec.obj, 
        model.vars=c('research_ID', 'Health_state'),
        type="otu", pca.axes=c(1,2), return.data = FALSE) 

ggsave("data/pictures/PCA_befor_batching.jpeg", plot = plot)
  • Principal Component Analysis после коррекции batch-эффекта (research_ID)
plot <- mbecPCA(input.obj=mbec.obj, 
        model.vars=c('research_ID', 'Health_state'),
        type="cor", label = "bat",
        pca.axes=c(1,2), return.data = FALSE)  

ggsave("data/pictures/PCA_after_batching.jpeg", plot = plot)

####Heatmap

  • Heatmap содержания 10-ти наиболее вариабельных таксонов до коррекции batch-эффекта (research_ID)
mbecHeat(input.obj=mbec.obj, method = "TOP", n = 10, 
         model.vars=c('research_ID', 'Health_state'),
         center = TRUE, scale = TRUE, 
         type="otu",
         return.data = FALSE)

  • Heatmap содержания 10-ти наиболее вариабельных таксонов после коррекции batch-эффекта (research_ID)
mbecHeat(input.obj=mbec.obj, method = "TOP", n = 10, 
         model.vars=c('research_ID', 'Health_state'),
         center = TRUE, scale = TRUE, 
         type="cor", label = "bat", 
         return.data = FALSE)

Кластеризация родов (G-таксонов) после коррекции batch-эффекта (research_ID)

AGNES (agglomerative clustering)

clusters_number <- 4 #количество кластеров

library(cluster)
library(factoextra)

G_scaled <- data_wide_batched %>% 
  mutate(patient_ID = paste0("patient_", patient_ID)) %>% 
  column_to_rownames("patient_ID") %>% 
  select (ends_with("_G")) %>% #выбираем только G-таксоны
  scale () #нормируем данные

agnes <- G_scaled %>% 
  dist (method = "euclidean") %>% #cоздаём матрицу дистанций
  as.matrix() %>%  
  agnes( #выбираем Agglomerative clustering (иерархическая кластеризация снизу вверх)
    diss = TRUE, #на вход подана dissimilarity matrix
    method = "ward")

fviz_dend(agnes,
          k = clusters_number,
          rect = TRUE,
          k_colors = "jco",
          show_labels = TRUE,
          label_cols = ifelse (data_wide_batched[agnes$order,]$Health_state == "Health", "green", "red"),#цвет лейблов определяется по Health_state
          cex = 0.2, #размер шрифта лейблов
          main = "Кластеризация субъектов по содержанию G-таксонов после batch-коррекции",
          ylab = "Высота")

  • Сравнение полученных кластеров по основным переменным
data_wide %>% 
  add_column("Cluster" = cutree(agnes, k = clusters_number)) %>% # Создаём новый столбец - вектор принадлежности к кластерам  
  select(any_of(colnames (combined_info)), Cluster, - patient_ID) %>% 
  tbl_summary(digits = list(all_continuous() ~ c(0, 0),
                            all_categorical() ~ c(0, 0)),
              by = Cluster) %>% 
  add_p()
Characteristic 1, N = 461 2, N = 2881 3, N = 221 4, N = 251 p-value2
research_ID




    1 46 (100%) 0 (0%) 0 (0%) 0 (0%)
    2 0 (0%) 35 (12%) 1 (5%) 0 (0%)
    3 0 (0%) 66 (23%) 4 (18%) 0 (0%)
    4 0 (0%) 69 (24%) 16 (73%) 2 (8%)
    5 0 (0%) 2 (1%) 0 (0%) 23 (92%)
    6 0 (0%) 22 (8%) 0 (0%) 0 (0%)
    7 0 (0%) 94 (33%) 1 (5%) 0 (0%)
Seq_region




    V3-V4 0 (0%) 101 (35%) 5 (23%) 0 (0%)
    V4 0 (0%) 187 (65%) 17 (77%) 25 (100%)
    V5-V6 46 (100%) 0 (0%) 0 (0%) 0 (0%)
Seq_date




    2015 0 (0%) 94 (33%) 1 (5%) 0 (0%)
    2017 0 (0%) 2 (1%) 0 (0%) 23 (92%)
    2018 46 (100%) 43 (15%) 6 (27%) 1 (4%)
    2020 0 (0%) 36 (13%) 2 (9%) 1 (4%)
    2021 0 (0%) 23 (8%) 9 (41%) 0 (0%)
    2022 0 (0%) 23 (8%) 0 (0%) 0 (0%)
    2023 0 (0%) 67 (23%) 4 (18%) 0 (0%)
Health_state



<0.001
    Disease 0 (0%) 137 (48%) 9 (41%) 24 (96%)
    Health 46 (100%) 151 (52%) 13 (59%) 1 (4%)
Age NA (NA, NA) 32 (27, 46) 48 (42, 51) 34 (28, 48) 0.010
    Unknown 46 195 6 0
Age_range



<0.001
    > 43 0 (0%) 24 (12%) 11 (52%) 9 (36%)
    16-43 46 (100%) 170 (88%) 10 (48%) 16 (64%)
    Unknown 0 94 1 0
Sex



0.11
    female 0 (NA%) 60 (41%) 5 (26%) 14 (58%)
    male 0 (NA%) 88 (59%) 14 (74%) 10 (42%)
    Unknown 46 140 3 1
Country




    Australia 0 (0%) 3 (1%) 3 (14%) 0 (0%)
    Austria 0 (0%) 2 (1%) 2 (9%) 24 (96%)
    Belgium 46 (100%) 0 (0%) 0 (0%) 0 (0%)
    Germany 0 (0%) 45 (16%) 0 (0%) 0 (0%)
    Greece 0 (0%) 1 (0%) 0 (0%) 0 (0%)
    Hungary 0 (0%) 0 (0%) 2 (9%) 0 (0%)
    Ireland 0 (0%) 0 (0%) 1 (5%) 0 (0%)
    Israel 0 (0%) 23 (8%) 0 (0%) 0 (0%)
    Italy 0 (0%) 35 (12%) 2 (9%) 0 (0%)
    Norway 0 (0%) 1 (0%) 0 (0%) 0 (0%)
    Poland 0 (0%) 66 (23%) 4 (18%) 0 (0%)
    Spain 0 (0%) 94 (33%) 1 (5%) 0 (0%)
    UK 0 (0%) 8 (3%) 3 (14%) 1 (4%)
    USA 0 (0%) 10 (3%) 4 (18%) 0 (0%)
Race



0.029
    African American 0 (0%) 1 (2%) 0 (0%) 0 (0%)
    Asian or Pacific Islander 0 (0%) 1 (2%) 0 (0%) 0 (0%)
    Caucasian 46 (100%) 52 (79%) 16 (100%) 2 (100%)
    Hispanic 0 (0%) 1 (2%) 0 (0%) 0 (0%)
    Other 0 (0%) 11 (17%) 0 (0%) 0 (0%)
    Unknown 0 222 6 23
Smoking 0 (0%) 15 (11%) 1 (5%) 0 (0%) 0.060
    Unknown 0 153 2 23
Alcohol



>0.9
    Never 0 (NA%) 10 (14%) 2 (13%) 0 (0%)
    Occasionally (1-2 times/week) 0 (NA%) 20 (29%) 4 (25%) 0 (0%)
    Rarely (a few times/month) 0 (NA%) 26 (38%) 8 (50%) 2 (100%)
    Regularly (3-7 times/week) 0 (NA%) 13 (19%) 2 (13%) 0 (0%)
    Unknown 46 219 6 23
Antibiotics_usage



<0.001
    1-6 months 46 (100%) 1 (1%) 1 (9%) 0 (0%)
    12 months/Not use 0 (0%) 118 (99%) 10 (91%) 1 (100%)
    Unknown 0 169 11 24
Physical_activity 0 (0%) 15 (11%) 1 (5%) 0 (0%) 0.060
    Unknown 0 153 2 23
Travel_period



0.016
    3 months 0 (NA%) 13 (19%) 5 (33%) 0 (0%)
    6 months 0 (NA%) 10 (14%) 0 (0%) 0 (0%)
    Month 0 (NA%) 7 (10%) 4 (27%) 2 (100%)
    Year 0 (NA%) 39 (57%) 6 (40%) 0 (0%)
    Unknown 46 219 7 23
Education_level



0.070
    Bachelor's level 0 (NA%) 26 (39%) 5 (33%) 0 (0%)
    Master's level 0 (NA%) 18 (27%) 8 (53%) 2 (100%)
    School Level 0 (NA%) 23 (34%) 2 (13%) 0 (0%)
    Unknown 46 221 7 23
Cosmetics



0.4
    Never 0 (NA%) 32 (47%) 11 (69%) 1 (50%)
    Occasionally (a few-8 times/month) 0 (NA%) 16 (24%) 1 (6%) 0 (0%)
    Regularly (3-7 times/week) 0 (NA%) 20 (29%) 4 (25%) 1 (50%)
    Unknown 46 220 6 23
Sleep_duration



0.14
    > 8 hours 0 (NA%) 7 (10%) 2 (13%) 0 (0%)
    4-6 hours 0 (NA%) 5 (7%) 4 (25%) 0 (0%)
    6-7 hours 0 (NA%) 23 (33%) 7 (44%) 1 (50%)
    7-8 hours 0 (NA%) 34 (49%) 3 (19%) 1 (50%)
    Unknown 46 219 6 23
BMI_category



0.063
    normal/overweight 46 (100%) 229 (98%) 11 (85%) 1 (100%)
    obese 0 (0%) 3 (1%) 2 (15%) 0 (0%)
    underweight 0 (0%) 1 (0%) 0 (0%) 0 (0%)
    Unknown 0 55 9 24
1 n (%); Median (IQR)
2 Pearson’s Chi-squared test; Kruskal-Wallis rank sum test; Fisher’s exact test

kMeans

kmeans <- G_scaled %>% 
  kmeans(centers = clusters_number, # Кол-во кластеров
         iter.max = 20, # Максимальное кол-во итераций
         nstart = 35) # Кол-во центройдов в начале

  fviz_cluster(kmeans,data = G_scaled,
               ellipse = FALSE,
               show.clust.cent = FALSE,
               geom = "point",
               main = "Кластеризация субъектов по содержанию G-таксонов до коррекции batch-эффекта")

AGNES (несходство Брея — Кертиса)

  • с матрицей-дистанций с показателями несходства Брея — Кертиса
agnes2 <- data_wide_batched %>% 
  column_to_rownames("patient_ID") %>% 
  select (ends_with("_G")) %>% 
  vegdist(method = "bray") %>% #cоздаём матрицу дистанций, рассчитывая показатель несходства Брея — Кертиса (Bray-Curtis dissimilarity, 0 - полное совпадение пациентов по составу микробиоты, 1 - полное несовпадение 
  as.matrix() %>% 
  agnes( #выбираем Agglomerative clustering (иерархическая кластеризация снизу вверх)
    diss = TRUE, #на вход подана dissimilarity matrix
    method = "ward")

fviz_dend(agnes2, 
          cex = 0.2, k = clusters_number,
          rect = TRUE,
          k_colors = "jco",
          color_labels_by_k = FALSE,
          label_cols = case_when (data_wide_batched[agnes2$order,]$Age_range == "> 43" ~ "red",
                                  data_wide_batched[agnes2$order,]$Age_range == "16-43" ~ "green",
                                  TRUE ~ "white"),
          main = "Дендрограмма кластеризации субъектов по количеству G-таксонов",
          ylab = "Высота")

  • Сравнение полученных кластеров по основным переменным
data_wide %>% 
  add_column("Cluster" = cutree(agnes2, k = clusters_number)) %>% # Создаём новый столбец - вектор принадлежности к кластерам  
  select(any_of(colnames (combined_info)), Cluster, - patient_ID) %>% 
  tbl_summary(digits = list(all_continuous() ~ c(0, 0),
                            all_categorical() ~ c(0, 0)),
              by = Cluster) %>% 
  add_p()
Characteristic 1, N = 2091 2, N = 401 3, N = 581 4, N = 741 p-value2
research_ID




    1 25 (12%) 3 (8%) 11 (19%) 7 (9%)
    2 20 (10%) 1 (3%) 3 (5%) 12 (16%)
    3 43 (21%) 3 (8%) 11 (19%) 13 (18%)
    4 47 (22%) 16 (40%) 9 (16%) 15 (20%)
    5 12 (6%) 9 (23%) 2 (3%) 2 (3%)
    6 13 (6%) 3 (8%) 4 (7%) 2 (3%)
    7 49 (23%) 5 (13%) 18 (31%) 23 (31%)
Seq_region




    V3-V4 63 (30%) 4 (10%) 14 (24%) 25 (34%)
    V4 121 (58%) 33 (83%) 33 (57%) 42 (57%)
    V5-V6 25 (12%) 3 (8%) 11 (19%) 7 (9%)
Seq_date




    2015 49 (23%) 5 (13%) 18 (31%) 23 (31%)
    2017 12 (6%) 9 (23%) 2 (3%) 2 (3%)
    2018 50 (24%) 8 (20%) 16 (28%) 22 (30%)
    2020 24 (11%) 3 (8%) 5 (9%) 7 (9%)
    2021 16 (8%) 9 (23%) 2 (3%) 5 (7%)
    2022 14 (7%) 3 (8%) 4 (7%) 2 (3%)
    2023 44 (21%) 3 (8%) 11 (19%) 13 (18%)
Health_state



0.3
    Disease 88 (42%) 23 (58%) 28 (48%) 31 (42%)
    Health 121 (58%) 17 (43%) 30 (52%) 43 (58%)
Age 35 (28, 47) 38 (31, 49) 32 (28, 41) 28 (26, 46) 0.5
    Unknown 137 12 43 55
Age_range



0.002
    > 43 21 (13%) 13 (37%) 4 (10%) 6 (12%)
    16-43 139 (87%) 22 (63%) 36 (90%) 45 (88%)
    Unknown 49 5 18 23
Sex



0.015
    female 54 (51%) 9 (31%) 8 (35%) 8 (24%)
    male 51 (49%) 20 (69%) 15 (65%) 26 (76%)
    Unknown 104 11 35 40
Country




    Australia 2 (1%) 3 (8%) 0 (0%) 1 (1%)
    Austria 12 (6%) 12 (30%) 2 (3%) 2 (3%)
    Belgium 25 (12%) 3 (8%) 11 (19%) 7 (9%)
    Germany 29 (14%) 1 (3%) 5 (9%) 10 (14%)
    Greece 1 (0%) 0 (0%) 0 (0%) 0 (0%)
    Hungary 0 (0%) 2 (5%) 0 (0%) 0 (0%)
    Ireland 1 (0%) 0 (0%) 0 (0%) 0 (0%)
    Israel 14 (7%) 3 (8%) 4 (7%) 2 (3%)
    Italy 20 (10%) 2 (5%) 3 (5%) 12 (16%)
    Norway 0 (0%) 0 (0%) 0 (0%) 1 (1%)
    Poland 43 (21%) 3 (8%) 11 (19%) 13 (18%)
    Spain 49 (23%) 5 (13%) 18 (31%) 23 (31%)
    UK 2 (1%) 4 (10%) 4 (7%) 2 (3%)
    USA 11 (5%) 2 (5%) 0 (0%) 1 (1%)
Race



0.6
    African American 1 (1%) 0 (0%) 0 (0%) 0 (0%)
    Asian or Pacific Islander 0 (0%) 0 (0%) 1 (5%) 0 (0%)
    Caucasian 60 (87%) 19 (100%) 18 (90%) 19 (86%)
    Hispanic 1 (1%) 0 (0%) 0 (0%) 0 (0%)
    Other 7 (10%) 0 (0%) 1 (5%) 3 (14%)
    Unknown 140 21 38 52
Smoking 8 (7%) 2 (9%) 1 (3%) 5 (14%) 0.4
    Unknown 94 18 27 39
Alcohol



0.9
    Never 8 (17%) 2 (13%) 1 (11%) 1 (7%)
    Occasionally (1-2 times/week) 15 (32%) 3 (19%) 1 (11%) 5 (33%)
    Rarely (a few times/month) 17 (36%) 8 (50%) 4 (44%) 7 (47%)
    Regularly (3-7 times/week) 7 (15%) 3 (19%) 3 (33%) 2 (13%)
    Unknown 162 24 49 59
Antibiotics_usage



0.2
    1-6 months 25 (25%) 5 (42%) 11 (38%) 7 (19%)
    12 months/Not use 75 (75%) 7 (58%) 18 (62%) 29 (81%)
    Unknown 109 28 29 38
Physical_activity 8 (7%) 2 (9%) 1 (3%) 5 (14%) 0.4
    Unknown 94 18 27 39
Travel_period



0.2
    3 months 11 (23%) 4 (27%) 1 (11%) 2 (13%)
    6 months 5 (11%) 0 (0%) 1 (11%) 4 (27%)
    Month 7 (15%) 5 (33%) 1 (11%) 0 (0%)
    Year 24 (51%) 6 (40%) 6 (67%) 9 (60%)
    Unknown 162 25 49 59
Education_level



0.8
    Bachelor's level 18 (38%) 5 (33%) 3 (33%) 5 (38%)
    Master's level 14 (30%) 7 (47%) 4 (44%) 3 (23%)
    School Level 15 (32%) 3 (20%) 2 (22%) 5 (38%)
    Unknown 162 25 49 61
Cosmetics



0.10
    Never 19 (40%) 12 (75%) 4 (50%) 9 (60%)
    Occasionally (a few-8 times/month) 11 (23%) 0 (0%) 3 (38%) 3 (20%)
    Regularly (3-7 times/week) 17 (36%) 4 (25%) 1 (13%) 3 (20%)
    Unknown 162 24 50 59
Sleep_duration



0.092
    > 8 hours 4 (9%) 2 (13%) 1 (11%) 2 (13%)
    4-6 hours 2 (4%) 5 (31%) 1 (11%) 1 (7%)
    6-7 hours 19 (40%) 6 (38%) 1 (11%) 5 (33%)
    7-8 hours 22 (47%) 3 (19%) 6 (67%) 7 (47%)
    Unknown 162 24 49 59
BMI_category



0.5
    normal/overweight 158 (98%) 20 (100%) 49 (98%) 60 (98%)
    obese 4 (2%) 0 (0%) 0 (0%) 1 (2%)
    underweight 0 (0%) 0 (0%) 1 (2%) 0 (0%)
    Unknown 47 20 8 13
1 n (%); Median (IQR)
2 Pearson’s Chi-squared test; Kruskal-Wallis rank sum test; Fisher’s exact test

data_wide (batched)

`

data_wide <- data_wide_batched  

write_rds(data_wide, 
          file = "data/originals/data_wide.rds")

bac_functions

  • загрузка и редактирование bac_functions
# Чтение листов Excel-файла с функциями бактерий и их объединение
path <- "data/raw/Bacterial group functions.xlsx"
taxon <- c ("TaxonName", "Rank")

neuromediators <- read_xlsx (path, 2) %>% 
  mutate(Destroy = ifelse(is.na (Destroy), "produce", "destroy")) %>% 
  unique() %>%
  pivot_wider(names_from = Neuromediator, values_from = Destroy)

probiotics <- read_xlsx (path, 3) %>% 
  add_column(probiotics = 1)

special_properties <- read_xlsx (path, 4) %>% 
  add_column(special_properties = 1)

vitamins <- read_xlsx (path, 5) %>% 
  pivot_wider (names_from = Vitamin, values_from = Vitamin,
               values_fn = function(x) ifelse(is.na (x), NA, 1))

habbits <- read_xlsx (path, 7) %>%
  unique() %>% #удаление повторяющихся строк 
  pivot_wider(names_from = Habbit, values_from = Habit_state)

bac_functions <- read_xlsx (path, 1) %>% #Патогены и нежелательные
  full_join(neuromediators, by = taxon) %>% #Нейромедиаторы
  full_join(probiotics, by = taxon) %>% #Пробиотики
  full_join(special_properties, by = taxon) %>% #С особыми свойствами
  full_join(vitamins, by = taxon) %>%  #Витамины
  full_join(read_xlsx (path, 6), by = taxon) %>% #Продуценты КЦДК
  full_join(habbits, by = taxon) %>% #Вредные привычки
  
  unite("Taxon", TaxonName, Rank, sep = "_") %>% 
  filter (Taxon != "Blautia obeum_S") %>% #для данного таксона противоречивая информация в Продуценты КЦЖК
  mutate_all(as.factor)

rm (path, taxon, neuromediators, probiotics, special_properties, vitamins, habbits)

data_long

  • Перевод data_wide в длинный формат (data_long), объединение data_long и bac_functions
# Создание датасета в длинном формате
data_long <- data_wide %>% 
  pivot_longer(ends_with(c("_D", "_P", "_O", "_C", "_F", "_G")),
               names_to = "Taxon", values_to = "Percentage")

#Перезапись data_long с добавлением функций бактерий
data_long <- data_long %>% 
  left_join (bac_functions, by = "Taxon")

#Сохранение data_long.rds
write_rds(data_long, 
          file = "data/originals/data_long.rds",
          compress = "gz") 
  • Создание отдельных длинных датасетов для каждого таксона
G_long <- data_long %>% subset(grepl("_G", Taxon)) 
# %>% select (where (function(x) sum (is.na(x))/ nrow(.) * 100 < threshold_percent))
F_long <- data_long %>% subset(grepl("_F", Taxon))
C_long <- data_long %>% subset(grepl("_C", Taxon))
O_long <- data_long %>% subset(grepl("_O", Taxon))
P_long <- data_long %>% subset(grepl("_P", Taxon))

write_rds(G_long, 
          file = "data/originals/G_long.rds", "gz") 
write_rds(F_long, 
          file = "data/originals/F_long.rds", "gz") 
write_rds(C_long, 
          file = "data/originals/C_long.rds", "gz") 
write_rds(O_long, 
          file = "data/originals/O_long.rds", "gz") 
write_rds(P_long, 
          file = "data/originals/P_long.rds", "gz") 

Анализ

Факторный анализ

  • Проведем множественное сравнение каждого таксона из combined_bacteria с по группе Health_state из combined_info без учета таксономического уровня.
# Создание нового датасета для сохранения результатов
result_dataset <- data.frame(
  Variable_Name = character(),
  Test_Type = character(),
  P_Value = numeric(),
  Normal_Distribution = character(),
  stringsAsFactors = FALSE
)

alpha = 0.05

# Объединяем датасеты по patient_id 
combined_data <- data_wide %>%
  select(Health_state,
    ends_with(c("_D", "_P", "_O", "_C", "_F", "_G")))

combined_bacteria_clean <- combined_data

# Получаем список переменных из датасета combined_bacteria, исключая "patient_ID"
values_to_exclude <- c("patient_ID", "Seq_date", "Age")
variable_names <- setdiff(names(combined_bacteria_clean), values_to_exclude)

# Проходим по каждой переменной
for (variable in variable_names) {
  # Фильтрация данных (исключаем строки с NA и 0 в текущей переменной)
  filtered_data <- combined_data[!is.na(combined_data[[variable]]) & combined_data[[variable]] != 0, ]
  #print(variable)
  #print(filtered_data)

  # Проверим что датасет filtered_data не пустой и что количество групп сравнения более 1, в нашем случае их 2 :)
  if (nrow(filtered_data) > 0 & length(unique(filtered_data$Health_state)) > 1) {
    
  # Check if there is sufficient variability in the data
  if (length(unique(filtered_data$Health_state)) > 1) {
    # Проверка на нормальность
    shapiro_test_result <- try(shapiro.test(filtered_data[[variable]]), silent = TRUE)
    if (inherits(shapiro_test_result, "try-error")) {
      warning(paste("Skipping Shapiro-Wilk test for variable", variable, "due to an error."))
      next
    }
    p_value_shapiro <- shapiro_test_result$p.value

    # Выбор соответствующего статистического теста
    if (p_value_shapiro > 0.05) {
      # Если нормальное распределение, провести дисперсионный анализ
      model <- aov(filtered_data[[variable]] ~ Health_state, data = filtered_data)
      summary_list <- summary(model)
      test_type <- "ANOVA"
    } else {
      # Если не нормальное распределение, использовать тест Краскела-Уоллиса
      tryCatch({
        model <- kruskal.test(filtered_data[[variable]] ~ Health_state, data = filtered_data)
        test_type <- "Kruskal-Wallis"
      }, error = function(e) {
        warning(paste("Skipping Kruskal-Wallis test for variable", variable, "due to an error:", conditionMessage(e)))
        next
      })
    }

    # Добавление результатов выбранного теста в датасет
    result_dataset <- rbind(result_dataset, 
                            data.frame(Variable_Name = variable,
                                       Test_Type = test_type,
                                       P_Value = ifelse(test_type == "ANOVA", summary_list[[1]]$"Pr(>F)"[1], model$p.value),
                                       Normal_Distribution = ifelse(p_value_shapiro > 0.05, "Yes", "No")))
  } else {
    # If there is no variability, skip the tests
    warning(paste("Skipping tests for variable", variable, "as there is not enough variability in the data."))
  }
  }}
## Warning: Skipping Shapiro-Wilk test for variable Health_state due to an error.
# Добавление столбца с поправкой Бонферрони
result_dataset$Adjusted_P_Value_Bonferroni <- p.adjust(result_dataset$P_Value, method = "bonferroni")

# Добавление столбца с поправкой Холма
result_dataset$Adjusted_P_Value_Holm <- p.adjust(result_dataset$P_Value, method = "holm")

# Добавление столбца с поправкой Бенджамини-Хохберга
result_dataset$Adjusted_P_Value_BH <- p.adjust(result_dataset$P_Value, method = "BH")

result_dataset$test_pass = ifelse(result_dataset$Adjusted_P_Value_Bonferroni < alpha & result_dataset$Adjusted_P_Value_Holm < alpha & result_dataset$Adjusted_P_Value_BH < alpha, "Y", "N")

result_dataset_pass <- result_dataset %>% filter(test_pass == "Y")

# Вывод результатов
print(result_dataset_pass)
##                               Variable_Name      Test_Type      P_Value
## 1                               Eukaryota_D Kruskal-Wallis 3.641890e-07
## 2                         Acidobacteriota_P Kruskal-Wallis 4.931868e-06
## 3                        Actinobacteriota_P Kruskal-Wallis 5.956848e-07
## 4                          Armatimonadota_P Kruskal-Wallis 5.555616e-10
## 5                        Bdellovibrionota_P Kruskal-Wallis 1.102695e-09
## 6                        Campylobacterota_P Kruskal-Wallis 4.120866e-06
## 7                           Cyanobacteria_P Kruskal-Wallis 2.162075e-22
## 8                        Desulfobacterota_P Kruskal-Wallis 2.250375e-08
## 9                          Fibrobacterota_P Kruskal-Wallis 9.167248e-08
## 10                             Firmicutes_P Kruskal-Wallis 3.498944e-16
## 11                         Fusobacteriota_P Kruskal-Wallis 2.304884e-12
## 12                           Nitrospirota_P Kruskal-Wallis 7.764816e-07
## 13                         Proteobacteria_P Kruskal-Wallis 1.121119e-31
## 14                      Verrucomicrobiota_P Kruskal-Wallis 1.976683e-08
## 15                             Bacillales_O Kruskal-Wallis 1.093474e-12
## 16                      Bdellovibrionales_O Kruskal-Wallis 2.180046e-12
## 17                        Burkholderiales_O Kruskal-Wallis 2.874918e-05
## 18                     Clostridia UCG-014_O Kruskal-Wallis 3.732801e-19
## 19             Clostridia vadinBB60 group_O Kruskal-Wallis 3.209141e-28
## 20                          Clostridiales_O Kruskal-Wallis 1.067999e-26
## 21                                 DTU014_O Kruskal-Wallis 1.461310e-07
## 22                   Desulfitobacteriales_O Kruskal-Wallis 1.646832e-05
## 23                      Desulfobacterales_O Kruskal-Wallis 3.271719e-07
## 24                     Desulfovibrionales_O Kruskal-Wallis 4.598530e-08
## 25                       Enterobacterales_O Kruskal-Wallis 3.493634e-43
## 26                        Fibrobacterales_O Kruskal-Wallis 1.952118e-11
## 27                        Fusobacteriales_O Kruskal-Wallis 2.304884e-12
## 28                    Gastranaerophilales_O Kruskal-Wallis 1.784014e-33
## 29                       Izemoplasmatales_O Kruskal-Wallis 3.915759e-32
## 30                        Lactobacillales_O Kruskal-Wallis 1.933468e-09
## 31                             Opitutales_O Kruskal-Wallis 5.646650e-07
## 32                        Oscillospirales_O Kruskal-Wallis 6.906239e-11
## 33                         Pedosphaerales_O Kruskal-Wallis 1.302641e-15
## 34    Peptostreptococcales-Tissierellales_O Kruskal-Wallis 1.840308e-26
## 35                           Pirellulales_O Kruskal-Wallis 3.196572e-09
## 36                    Propionibacteriales_O Kruskal-Wallis 1.267265e-13
## 37                        Pseudomonadales_O Kruskal-Wallis 3.208077e-12
## 38                                   RF39_O Kruskal-Wallis 1.317623e-08
## 39                        Rhodobacterales_O Kruskal-Wallis 9.110302e-22
## 40                       Rhodospirillales_O Kruskal-Wallis 9.132432e-06
## 41                          Rickettsiales_O Kruskal-Wallis 2.020389e-16
## 42                                SBR1031_O Kruskal-Wallis 1.172360e-06
## 43                       Staphylococcales_O Kruskal-Wallis 3.046562e-07
## 44         Veillonellales-Selenomonadales_O Kruskal-Wallis 1.606580e-11
## 45                     Verrucomicrobiales_O Kruskal-Wallis 7.214817e-30
## 46                          Victivallales_O Kruskal-Wallis 1.262006e-43
## 47                        Xanthomonadales_O Kruskal-Wallis 2.298532e-35
## 48                        Bdellovibrionia_C Kruskal-Wallis 1.961073e-08
## 49                        Campylobacteria_C Kruskal-Wallis 4.506978e-06
## 50                           Chloroflexia_C Kruskal-Wallis 1.333103e-52
## 51                             Clostridia_C Kruskal-Wallis 2.869853e-19
## 52                        Dehalococcoidia_C Kruskal-Wallis 1.999580e-05
## 53                     Desulfitobacteriia_C Kruskal-Wallis 1.646832e-05
## 54                        Desulfobacteria_C Kruskal-Wallis 2.570935e-06
## 55                       Desulfovibrionia_C Kruskal-Wallis 4.598530e-08
## 56                          Fibrobacteria_C Kruskal-Wallis 1.952118e-11
## 57                          Fusobacteriia_C Kruskal-Wallis 2.304884e-12
## 58                    Gammaproteobacteria_C Kruskal-Wallis 5.052401e-24
## 59                        Gracilibacteria_C Kruskal-Wallis 3.949566e-09
## 60                          Lentisphaeria_C Kruskal-Wallis 1.437163e-32
## 61                         Microgenomatia_C Kruskal-Wallis 2.221509e-05
## 62                          Negativicutes_C Kruskal-Wallis 1.630876e-10
## 63                          Parcubacteria_C Kruskal-Wallis 4.142854e-11
## 64                          Phycisphaerae_C Kruskal-Wallis 3.006549e-07
## 65                       Vampirivibrionia_C Kruskal-Wallis 1.714190e-17
## 66                       Verrucomicrobiae_C Kruskal-Wallis 5.551747e-20
## 67                              vadinHA49_C Kruskal-Wallis 4.885983e-06
## 68                                    A4b_F Kruskal-Wallis 5.664201e-18
## 69                          Aerococcaceae_F Kruskal-Wallis 1.005536e-10
## 70                        Akkermansiaceae_F Kruskal-Wallis 1.680017e-29
## 71                       Alteromonadaceae_F Kruskal-Wallis 5.510037e-25
## 72                            Bacillaceae_F Kruskal-Wallis 2.467063e-12
## 73                     Bdellovibrionaceae_F Kruskal-Wallis 2.180046e-12
## 74                       Burkholderiaceae_F Kruskal-Wallis 4.981468e-21
## 75                       Caloramatoraceae_F Kruskal-Wallis 2.538328e-21
## 76                      Carnobacteriaceae_F Kruskal-Wallis 1.039051e-05
## 77                         Clostridiaceae_F Kruskal-Wallis 8.902870e-27
## 78                         Comamonadaceae_F Kruskal-Wallis 6.571902e-11
## 79                      Coriobacteriaceae_F Kruskal-Wallis 4.658545e-12
## 80                     Corynebacteriaceae_F Kruskal-Wallis 1.917933e-06
## 81                    Desulfovibrionaceae_F Kruskal-Wallis 9.189183e-09
## 82               Dethiosulfatibacteraceae_F Kruskal-Wallis 3.006610e-48
## 83                     Enterobacteriaceae_F Kruskal-Wallis 2.753246e-45
## 84                            Erwiniaceae_F Kruskal-Wallis 1.426000e-46
## 85                              Family XI_F Kruskal-Wallis 1.732333e-07
## 86                        Fusibacteraceae_F Kruskal-Wallis 1.175304e-12
## 87                       Fusobacteriaceae_F Kruskal-Wallis 1.130697e-06
## 88                            Gemellaceae_F Kruskal-Wallis 3.263173e-17
## 89                       Leptotrichiaceae_F Kruskal-Wallis 3.156349e-20
## 90                ML635J-40 aquatic group_F Kruskal-Wallis 1.343215e-06
## 91                         Micrococcaceae_F Kruskal-Wallis 3.198537e-28
## 92                          Moraxellaceae_F Kruskal-Wallis 3.150003e-27
## 93                         Morganellaceae_F Kruskal-Wallis 2.198451e-15
## 94                          Neisseriaceae_F Kruskal-Wallis 4.802029e-38
## 95                       Oxalobacteraceae_F Kruskal-Wallis 1.372032e-12
## 96                        Pasteurellaceae_F Kruskal-Wallis 1.032882e-24
## 97                        Pedosphaeraceae_F Kruskal-Wallis 1.302641e-15
## 98                  Peptostreptococcaceae_F Kruskal-Wallis 7.392404e-35
## 99                          Pirellulaceae_F Kruskal-Wallis 3.196572e-09
## 100                        Planococcaceae_F Kruskal-Wallis 3.691366e-18
## 101                  Propionibacteriaceae_F Kruskal-Wallis 6.631706e-09
## 102                      Pseudomonadaceae_F Kruskal-Wallis 3.996889e-22
## 103                      Rhodobacteraceae_F Kruskal-Wallis 9.110302e-22
## 104                        Rhodocyclaceae_F Kruskal-Wallis 7.399735e-20
## 105                       Ruminococcaceae_F Kruskal-Wallis 1.582549e-08
## 106                                  SB-5_F Kruskal-Wallis 3.298360e-07
## 107                        Shewanellaceae_F Kruskal-Wallis 5.652343e-08
## 108                        Sutterellaceae_F Kruskal-Wallis 1.095159e-05
## 109                               UCG-010_F Kruskal-Wallis 1.173862e-23
## 110                       Veillonellaceae_F Kruskal-Wallis 2.025402e-12
## 111                          Vibrionaceae_F Kruskal-Wallis 1.133000e-19
## 112                        Victivallaceae_F Kruskal-Wallis 3.983873e-47
## 113                         Weeksellaceae_F Kruskal-Wallis 7.658696e-15
## 114                      Xanthomonadaceae_F Kruskal-Wallis 1.867012e-05
## 115                          Yersiniaceae_F Kruskal-Wallis 1.036265e-37
## 116 [Eubacterium] coprostanoligenes group_F Kruskal-Wallis 1.838722e-27
## 117                   Acetanaerobacterium_G Kruskal-Wallis 7.477478e-29
## 118                       Acidaminococcus_G Kruskal-Wallis 2.000921e-05
## 119                         Acinetobacter_G Kruskal-Wallis 7.548236e-30
## 120                        Actinobacillus_G Kruskal-Wallis 9.404740e-23
## 121                             Aeromonas_G Kruskal-Wallis 5.221036e-06
## 122                           Akkermansia_G Kruskal-Wallis 1.680017e-29
## 123                          Anaerococcus_G Kruskal-Wallis 1.600133e-09
## 124                         Anaerocolumna_G Kruskal-Wallis 3.200634e-07
## 125                           Anaerofilum_G Kruskal-Wallis 1.254379e-11
## 126                     Anaerosporobacter_G Kruskal-Wallis 3.218415e-05
## 127                          Anaerostipes_G Kruskal-Wallis 1.316182e-06
## 128                              Bacillus_G Kruskal-Wallis 1.174276e-11
## 129                               CAG-352_G Kruskal-Wallis 8.685810e-06
## 130                                CAG-56_G Kruskal-Wallis 1.266937e-11
## 131                              CHKCI001_G Kruskal-Wallis 6.501996e-06
## 132                              CHKCI002_G Kruskal-Wallis 2.413639e-05
## 133                Candidatus Phytoplasma_G Kruskal-Wallis 7.466909e-06
## 134               Candidatus Stoquefichus_G Kruskal-Wallis 4.657966e-17
## 135                     Caproiciproducens_G Kruskal-Wallis 1.982204e-06
## 136                       Catenibacterium_G Kruskal-Wallis 5.744837e-07
## 137                       Christensenella_G Kruskal-Wallis 4.540380e-13
## 138                           Citrobacter_G Kruskal-Wallis 3.269696e-08
## 139                        Cloacibacillus_G Kruskal-Wallis 2.656491e-19
## 140          Clostridium sensu stricto 13_G Kruskal-Wallis 1.765588e-33
## 141           Clostridium sensu stricto 1_G Kruskal-Wallis 1.001200e-29
## 142                           Collinsella_G Kruskal-Wallis 1.584679e-11
## 143                                DTU089_G Kruskal-Wallis 1.469309e-07
## 144                         Desulfovibrio_G Kruskal-Wallis 8.406321e-18
## 145                   Dethiosulfatibacter_G Kruskal-Wallis 3.006610e-48
## 146                           Eggerthella_G Kruskal-Wallis 1.512409e-07
## 147                          Enterobacter_G Kruskal-Wallis 4.283633e-49
## 148                          Epulopiscium_G Kruskal-Wallis 4.252884e-05
## 149                  Escherichia-Shigella_G Kruskal-Wallis 1.211205e-45
## 150                      Faecalibacterium_G Kruskal-Wallis 1.487630e-10
## 151                        Fastidiosipila_G Kruskal-Wallis 1.336125e-06
## 152                         Fermentimonas_G Kruskal-Wallis 2.441946e-07
## 153                            Fusibacter_G Kruskal-Wallis 1.175304e-12
## 154                         Fusobacterium_G Kruskal-Wallis 1.088967e-09
## 155                         GCA-900066575_G Kruskal-Wallis 6.399238e-14
## 156                         GCA-900066755_G Kruskal-Wallis 7.629800e-39
## 157                               Gemella_G Kruskal-Wallis 3.263173e-17
## 158                           Geobacillus_G Kruskal-Wallis 2.557631e-41
## 159                        Granulicatella_G Kruskal-Wallis 2.758976e-05
## 160                          Halobacillus_G Kruskal-Wallis 4.880366e-05
## 161                          Harryflintia_G Kruskal-Wallis 3.870844e-22
## 162                             Hespellia_G Kruskal-Wallis 1.148969e-05
## 163                          Holdemanella_G Kruskal-Wallis 2.340090e-13
## 164                        Intestinimonas_G Kruskal-Wallis 9.422743e-07
## 165                            Klebsiella_G Kruskal-Wallis 1.636362e-24
## 166          Lachnospiraceae NC2004 group_G Kruskal-Wallis 1.126652e-05
## 167           Lachnospiraceae NK4B4 group_G Kruskal-Wallis 3.406312e-05
## 168               Lachnospiraceae UCG-001_G Kruskal-Wallis 3.250466e-05
## 169               Lachnospiraceae UCG-002_G Kruskal-Wallis 2.994427e-09
## 170               Lachnospiraceae UCG-006_G Kruskal-Wallis 3.057389e-05
## 171               Lachnospiraceae UCG-008_G Kruskal-Wallis 3.008204e-05
## 172               Lachnospiraceae UCG-010_G Kruskal-Wallis 1.108805e-05
## 173                    Lacticaseibacillus_G Kruskal-Wallis 9.016788e-11
## 174                        Lysinibacillus_G Kruskal-Wallis 4.843857e-30
## 175                    Macellibacteroides_G Kruskal-Wallis 8.252963e-10
## 176                             Megamonas_G Kruskal-Wallis 2.480778e-05
## 177                              Moryella_G Kruskal-Wallis 1.698210e-05
## 178                      Negativibacillus_G Kruskal-Wallis 3.505090e-12
## 179                            OM27 clade_G Kruskal-Wallis 2.689783e-40
## 180                             Olsenella_G Kruskal-Wallis 6.665175e-09
## 181                          Paludibacter_G Kruskal-Wallis 7.121028e-06
## 182                               Pantoea_G Kruskal-Wallis 1.357796e-40
## 183                       Paraclostridium_G Kruskal-Wallis 2.973228e-10
## 184                        Paraprevotella_G Kruskal-Wallis 3.160620e-10
## 185                            Parvimonas_G Kruskal-Wallis 4.199992e-28
## 186                         Peptoniphilus_G Kruskal-Wallis 1.264624e-13
## 187                    Peptostreptococcus_G Kruskal-Wallis 1.711585e-35
## 188                         Porphyromonas_G Kruskal-Wallis 1.328965e-07
## 189                          Prevotella_7_G Kruskal-Wallis 1.519248e-07
## 190                            Prevotella_G Kruskal-Wallis 5.583780e-06
## 191           Prevotellaceae NK3B31 group_G Kruskal-Wallis 1.352145e-08
## 192                Prevotellaceae UCG-001_G Kruskal-Wallis 3.947135e-08
## 193                         Robinsoniella_G Kruskal-Wallis 7.475667e-08
## 194                            Romboutsia_G Kruskal-Wallis 2.498546e-34
## 195                     Ruminiclostridium_G Kruskal-Wallis 8.539573e-14
## 196                            Salmonella_G Kruskal-Wallis 3.407245e-50
## 197                              Serratia_G Kruskal-Wallis 9.170091e-39
## 198                            Shewanella_G Kruskal-Wallis 6.216394e-14
## 199                           Sporobacter_G Kruskal-Wallis 8.346727e-13
## 200                         Streptococcus_G Kruskal-Wallis 4.895500e-05
## 201                       Subdoligranulum_G Kruskal-Wallis 1.307132e-12
## 202                            Sutterella_G Kruskal-Wallis 3.585245e-19
## 203                          Turicibacter_G Kruskal-Wallis 9.040827e-35
## 204                               UCG-002_G Kruskal-Wallis 1.932637e-09
## 205                               UCG-004_G Kruskal-Wallis 2.840630e-48
## 206                               UCG-005_G Kruskal-Wallis 9.285072e-10
## 207                               UCG-012_G Kruskal-Wallis 3.913332e-05
## 208                           Veillonella_G Kruskal-Wallis 2.021157e-43
## 209                                Vibrio_G Kruskal-Wallis 1.439854e-15
## 210                               XBB1006_G Kruskal-Wallis 4.544741e-06
## 211       [Eubacterium] fissicatena group_G Kruskal-Wallis 6.453837e-08
## 212           [Ruminococcus] gnavus group_G Kruskal-Wallis 2.739855e-11
##     Normal_Distribution Adjusted_P_Value_Bonferroni Adjusted_P_Value_Holm
## 1                    No                3.084681e-04          2.498337e-04
## 2                    No                4.177292e-03          3.294488e-03
## 3                    No                5.045450e-04          4.068527e-04
## 4                    No                4.705606e-07          4.038933e-07
## 5                    No                9.339824e-07          7.972483e-07
## 6                    No                3.490373e-03          2.769222e-03
## 7                    No                1.831277e-19          1.721012e-19
## 8                    No                1.906068e-05          1.591015e-05
## 9                    No                7.764659e-05          6.407906e-05
## 10                   No                2.963605e-13          2.704683e-13
## 11                   No                1.952236e-09          1.730968e-09
## 12                   No                6.576800e-04          5.295605e-04
## 13                   No                9.495882e-29          9.170757e-29
## 14                   No                1.674250e-05          1.399491e-05
## 15                   No                9.261728e-10          8.299471e-10
## 16                   No                1.846499e-09          1.641574e-09
## 17                   No                2.435056e-02          1.854322e-02
## 18                   No                3.161683e-16          2.919051e-16
## 19                   No                2.718142e-25          2.596195e-25
## 20                   No                9.045952e-24          8.586712e-24
## 21                   No                1.237729e-04          1.018533e-04
## 22                   No                1.394866e-02          1.078675e-02
## 23                   No                2.771146e-04          2.250943e-04
## 24                   No                3.894955e-05          3.237365e-05
## 25                   No                2.959108e-40          2.917185e-40
## 26                   No                1.653444e-08          1.442615e-08
## 27                   No                1.952236e-09          1.730968e-09
## 28                   No                1.511060e-30          1.464676e-30
## 29                   No                3.316648e-29          3.207007e-29
## 30                   No                1.637647e-06          1.393432e-06
## 31                   No                4.782713e-04          3.867955e-04
## 32                   No                5.849585e-08          5.069179e-08
## 33                   No                1.103337e-12          1.005639e-12
## 34                   No                1.558741e-23          1.477767e-23
## 35                   No                2.707496e-06          2.295138e-06
## 36                   No                1.073374e-10          9.669235e-11
## 37                   No                2.717241e-09          2.396434e-09
## 38                   No                1.116026e-05          9.381473e-06
## 39                   No                7.716426e-19          7.224470e-19
## 40                   No                7.735170e-03          6.036538e-03
## 41                   No                1.711270e-13          1.563781e-13
## 42                   No                9.929892e-04          7.960327e-04
## 43                   No                2.580438e-04          2.102128e-04
## 44                   No                1.360773e-08          1.188869e-08
## 45                   No                6.110950e-27          5.887291e-27
## 46                   No                1.068919e-40          1.056299e-40
## 47                   No                1.946857e-32          1.898588e-32
## 48                   No                1.661029e-05          1.390401e-05
## 49                   No                3.817410e-03          3.024182e-03
## 50                   No                1.129138e-49          1.129138e-49
## 51                   No                2.430765e-16          2.249965e-16
## 52                   No                1.693644e-02          1.301727e-02
## 53                   No                1.394866e-02          1.078675e-02
## 54                   No                2.177582e-03          1.730239e-03
## 55                   No                3.894955e-05          3.237365e-05
## 56                   No                1.653444e-08          1.442615e-08
## 57                   No                1.952236e-09          1.730968e-09
## 58                   No                4.279384e-21          4.036868e-21
## 59                   No                3.345282e-06          2.827889e-06
## 60                   No                1.217277e-29          1.178474e-29
## 61                   No                1.881618e-02          1.441759e-02
## 62                   No                1.381352e-07          1.190540e-07
## 63                   No                3.508997e-08          3.049140e-08
## 64                   No                2.546547e-04          2.077525e-04
## 65                   No                1.451919e-14          1.333640e-14
## 66                   No                4.702330e-17          4.374777e-17
## 67                   No                4.138427e-03          3.268722e-03
## 68                   No                4.797578e-15          4.418077e-15
## 69                   No                8.516894e-08          7.360527e-08
## 70                   No                1.422975e-26          1.365854e-26
## 71                   No                4.667001e-22          4.419049e-22
## 72                   No                2.089602e-09          1.845363e-09
## 73                   No                1.846499e-09          1.641574e-09
## 74                   No                4.219303e-18          3.935360e-18
## 75                   No                2.149964e-18          2.007817e-18
## 76                   No                8.800762e-03          6.857737e-03
## 77                   No                7.540731e-24          7.166811e-24
## 78                   No                5.566401e-08          4.830348e-08
## 79                   No                3.945788e-09          3.470616e-09
## 80                   No                1.624490e-03          1.294605e-03
## 81                   No                7.783238e-06          6.551888e-06
## 82                   No                2.546599e-45          2.534572e-45
## 83                   No                2.331999e-42          2.307220e-42
## 84                   No                1.207822e-43          1.197840e-43
## 85                   No                1.467286e-04          1.200507e-04
## 86                   No                9.954821e-10          8.908801e-10
## 87                   No                9.577005e-04          7.688741e-04
## 88                   No                2.763908e-14          2.535486e-14
## 89                   No                2.673428e-17          2.490360e-17
## 90                   No                1.137703e-03          9.080131e-04
## 91                   No                2.709161e-25          2.590815e-25
## 92                   No                2.668053e-24          2.538902e-24
## 93                   No                1.862088e-12          1.690609e-12
## 94                   No                4.067318e-35          3.980882e-35
## 95                   No                1.162111e-09          1.035884e-09
## 96                   No                8.748511e-22          8.273385e-22
## 97                   No                1.103337e-12          1.005639e-12
## 98                   No                6.261366e-32          6.098733e-32
## 99                   No                2.707496e-06          2.295138e-06
## 100                  No                3.126587e-15          2.882957e-15
## 101                  No                5.617055e-06          4.741670e-06
## 102                  No                3.385365e-19          3.173530e-19
## 103                  No                7.716426e-19          7.224470e-19
## 104                  No                6.267575e-17          5.823591e-17
## 105                  No                1.340419e-05          1.123610e-05
## 106                  No                2.793711e-04          2.265974e-04
## 107                  No                4.787535e-05          3.967945e-05
## 108                  No                9.275996e-03          7.217097e-03
## 109                  No                9.942614e-21          9.367421e-21
## 110                  No                1.715515e-09          1.527153e-09
## 111                  No                9.596507e-17          8.905378e-17
## 112                  No                3.374340e-44          3.350437e-44
## 113                  No                6.486915e-12          5.881878e-12
## 114                  No                1.581359e-02          1.217292e-02
## 115                  No                8.777168e-35          8.580277e-35
## 116                  No                1.557397e-24          1.483849e-24
## 117                  No                6.333424e-26          6.064235e-26
## 118                  No                1.694780e-02          1.301727e-02
## 119                  No                6.393356e-27          6.151812e-27
## 120                  No                7.965815e-20          7.495578e-20
## 121                  No                4.422218e-03          3.482431e-03
## 122                  No                1.422975e-26          1.365854e-26
## 123                  No                1.355312e-06          1.155296e-06
## 124                  No                2.710937e-04          2.205237e-04
## 125                  No                1.062459e-08          9.320033e-09
## 126                  No                2.725998e-02          2.066223e-02
## 127                  No                1.114807e-03          8.923717e-04
## 128                  No                9.946116e-09          8.736612e-09
## 129                  No                7.356881e-03          5.750006e-03
## 130                  No                1.073095e-08          9.400671e-09
## 131                  No                5.507190e-03          4.323827e-03
## 132                  No                2.044352e-02          1.564038e-02
## 133                  No                6.324472e-03          4.950561e-03
## 134                  No                3.945297e-14          3.609923e-14
## 135                  No                1.678927e-03          1.336006e-03
## 136                  No                4.865877e-04          3.929469e-04
## 137                  No                3.845702e-10          3.455229e-10
## 138                  No                2.769433e-05          2.308406e-05
## 139                  No                2.250048e-16          2.085346e-16
## 140                  No                1.495453e-30          1.451313e-30
## 141                  No                8.480166e-27          8.149770e-27
## 142                  No                1.342223e-08          1.174247e-08
## 143                  No                1.244504e-04          1.022639e-04
## 144                  No                7.120154e-15          6.548524e-15
## 145                  No                2.546599e-45          2.534572e-45
## 146                  No                1.281011e-04          1.051124e-04
## 147                  No                3.628237e-46          3.619670e-46
## 148                  No                3.602192e-02          2.713340e-02
## 149                  No                1.025891e-42          1.016201e-42
## 150                  No                1.260022e-07          1.087457e-07
## 151                  No                1.131698e-03          9.045564e-04
## 152                  No                2.068329e-04          1.689827e-04
## 153                  No                9.954821e-10          8.908801e-10
## 154                  No                9.223555e-07          7.884125e-07
## 155                  No                5.420155e-11          4.901816e-11
## 156                  No                6.462441e-36          6.340364e-36
## 157                  No                2.763908e-14          2.535486e-14
## 158                  No                2.166313e-38          2.133064e-38
## 159                  No                2.336852e-02          1.782298e-02
## 160                  No                4.133670e-02          3.108793e-02
## 161                  No                3.278605e-19          3.077321e-19
## 162                  No                9.731768e-03          7.537237e-03
## 163                  No                1.982056e-10          1.783148e-10
## 164                  No                7.981063e-04          6.416888e-04
## 165                  No                1.385999e-21          1.309090e-21
## 166                  No                9.542746e-03          7.402106e-03
## 167                  No                2.885146e-02          2.180039e-02
## 168                  No                2.753145e-02          2.083549e-02
## 169                  No                2.536280e-06          2.152993e-06
## 170                  No                2.589609e-02          1.965901e-02
## 171                  No                2.547949e-02          1.937284e-02
## 172                  No                9.391580e-03          7.295938e-03
## 173                  No                7.637220e-08          6.609306e-08
## 174                  No                4.102747e-27          3.957431e-27
## 175                  No                6.990259e-07          5.991651e-07
## 176                  No                2.101219e-02          1.605064e-02
## 177                  No                1.438384e-02          1.108931e-02
## 178                  No                2.968811e-09          2.614797e-09
## 179                  No                2.278247e-37          2.237900e-37
## 180                  No                5.645403e-06          4.758935e-06
## 181                  No                6.031510e-03          4.728362e-03
## 182                  No                1.150053e-37          1.131044e-37
## 183                  No                2.518324e-07          2.167483e-07
## 184                  No                2.677045e-07          2.300931e-07
## 185                  No                3.557393e-25          3.393594e-25
## 186                  No                1.071137e-10          9.661731e-11
## 187                  No                1.449712e-32          1.415481e-32
## 188                  No                1.125633e-04          9.276176e-05
## 189                  No                1.286803e-04          1.054358e-04
## 190                  No                4.729462e-03          3.718798e-03
## 191                  No                1.145267e-05          9.613751e-06
## 192                  No                3.343223e-05          2.782730e-05
## 193                  No                6.331890e-05          5.232967e-05
## 194                  No                2.116268e-31          2.056303e-31
## 195                  No                7.233018e-11          6.532773e-11
## 196                  No                2.885937e-47          2.882530e-47
## 197                  No                7.767067e-36          7.611175e-36
## 198                  No                5.265285e-11          4.767974e-11
## 199                  No                7.069677e-10          6.343512e-10
## 200                  No                4.146488e-02          3.113538e-02
## 201                  No                1.107141e-09          9.881918e-10
## 202                  No                3.036703e-16          2.807247e-16
## 203                  No                7.657580e-32          7.449641e-32
## 204                  No                1.636944e-06          1.393432e-06
## 205                  No                2.406013e-45          2.397492e-45
## 206                  No                7.864456e-07          6.731678e-07
## 207                  No                3.314592e-02          2.500619e-02
## 208                  No                1.711920e-40          1.689688e-40
## 209                  No                1.219556e-12          1.108687e-12
## 210                  No                3.849396e-03          3.044977e-03
## 211                  No                5.466400e-05          4.524140e-05
## 212                  No                2.320657e-08          2.019273e-08
##     Adjusted_P_Value_BH test_pass
## 1          1.904124e-06         Y
## 2          2.320718e-05         Y
## 3          3.057848e-06         Y
## 4          3.888931e-09         Y
## 5          7.471859e-09         Y
## 6          1.983167e-05         Y
## 7          3.521687e-21         Y
## 8          1.351821e-07         Y
## 9          5.211180e-07         Y
## 10         3.951474e-15         Y
## 11         1.971956e-11         Y
## 12         3.961927e-06         Y
## 13         3.165294e-30         Y
## 14         1.195893e-07         Y
## 15         1.040644e-11         Y
## 16         1.923436e-11         Y
## 17         1.199535e-04         Y
## 18         4.790429e-18         Y
## 19         6.969596e-27         Y
## 20         2.055898e-25         Y
## 21         8.187529e-07         Y
## 22         7.190032e-05         Y
## 23         1.731966e-06         Y
## 24         2.686176e-07         Y
## 25         2.276237e-41         Y
## 26         1.503131e-10         Y
## 27         1.971956e-11         Y
## 28         5.596519e-32         Y
## 29         1.143672e-30         Y
## 30         1.279412e-08         Y
## 31         2.934179e-06         Y
## 32         5.131214e-10         Y
## 33         1.432905e-14         Y
## 34         3.463868e-25         Y
## 35         2.066791e-08         Y
## 36         1.262793e-12         Y
## 37         2.690338e-11         Y
## 38         8.206076e-08         Y
## 39         1.377933e-20         Y
## 40         4.136455e-05         Y
## 41         2.312527e-15         Y
## 42         5.875676e-06         Y
## 43         1.633189e-06         Y
## 44         1.259975e-10         Y
## 45         1.909672e-28         Y
## 46         9.717447e-42         Y
## 47         8.849349e-34         Y
## 48         1.194985e-07         Y
## 49         2.156729e-05         Y
## 50         1.129138e-49         Y
## 51         3.798071e-18         Y
## 52         8.559495e-05         Y
## 53         7.190032e-05         Y
## 54         1.244332e-05         Y
## 55         2.686176e-07         Y
## 56         1.503131e-10         Y
## 57         1.971956e-11         Y
## 58         8.733436e-23         Y
## 59         2.534305e-08         Y
## 60         4.347418e-31         Y
## 61         9.455367e-05         Y
## 62         1.170637e-09         Y
## 63         3.133033e-10         Y
## 64         1.622004e-06         Y
## 65         2.074170e-16         Y
## 66         7.837216e-19         Y
## 67         2.311971e-05         Y
## 68         7.055262e-17         Y
## 69         7.342150e-10         Y
## 70         3.952707e-28         Y
## 71         1.014565e-23         Y
## 72         2.089602e-11         Y
## 73         1.923436e-11         Y
## 74         7.274661e-20         Y
## 75         3.771866e-20         Y
## 76         4.681256e-05         Y
## 77         1.753658e-25         Y
## 78         4.926019e-10         Y
## 79         3.830862e-11         Y
## 80         9.390114e-06         Y
## 81         5.765362e-08         Y
## 82         4.244331e-46         Y
## 83         2.331999e-43         Y
## 84         1.509777e-44         Y
## 85         9.466363e-07         Y
## 86         1.093936e-11         Y
## 87         5.700598e-06         Y
## 88         3.838761e-16         Y
## 89         4.531234e-19         Y
## 90         6.614551e-06         Y
## 91         6.969596e-27         Y
## 92         6.352506e-26         Y
## 93         2.357074e-14         Y
## 94         2.140694e-36         Y
## 95         1.249581e-11         Y
## 96         1.861385e-23         Y
## 97         1.432905e-14         Y
## 98         2.722333e-33         Y
## 99         2.066791e-08         Y
## 100        4.666547e-17         Y
## 101        4.212988e-08         Y
## 102        6.269195e-21         Y
## 103        1.377933e-20         Y
## 104        1.027471e-18         Y
## 105        9.713180e-08         Y
## 106        1.735224e-06         Y
## 107        3.279133e-07         Y
## 108        4.907935e-05         Y
## 109        1.988523e-22         Y
## 110        1.825016e-11         Y
## 111        1.547824e-18         Y
## 112        4.820486e-45         Y
## 113        8.108644e-14         Y
## 114        8.068160e-05         Y
## 115        4.388584e-36         Y
## 116        3.798530e-26         Y
## 117        1.711736e-27         Y
## 118        8.559495e-05         Y
## 119        1.937381e-28         Y
## 120        1.561925e-21         Y
## 121        2.443214e-05         Y
## 122        3.952707e-28         Y
## 123        1.075645e-08         Y
## 124        1.704992e-06         Y
## 125        1.011865e-10         Y
## 126        1.323300e-04         Y
## 127        6.557686e-06         Y
## 128        9.563573e-11         Y
## 129        3.955312e-05         Y
## 130        1.012354e-10         Y
## 131        3.009394e-05         Y
## 132        1.022176e-04         Y
## 133        3.418633e-05         Y
## 134        5.404516e-16         Y
## 135        9.649006e-06         Y
## 136        2.966998e-06         Y
## 137        4.420347e-12         Y
## 138        1.950305e-07         Y
## 139        3.571505e-18         Y
## 140        5.596519e-32         Y
## 141        2.494167e-28         Y
## 142        1.254414e-10         Y
## 143        8.187529e-07         Y
## 144        1.031906e-16         Y
## 145        4.244331e-46         Y
## 146        8.355864e-07         Y
## 147        1.209412e-46         Y
## 148        1.715330e-04         Y
## 149        1.139878e-43         Y
## 150        1.076942e-09         Y
## 151        6.614551e-06         Y
## 152        1.325852e-06         Y
## 153        1.093936e-11         Y
## 154        7.438351e-09         Y
## 155        6.609945e-13         Y
## 156        3.801436e-37         Y
## 157        3.838761e-16         Y
## 158        1.547366e-39         Y
## 159        1.156858e-04         Y
## 160        1.955891e-04         Y
## 161        6.186047e-21         Y
## 162        5.068629e-05         Y
## 163        2.304716e-12         Y
## 164        4.779080e-06         Y
## 165        2.887497e-23         Y
## 166        4.996202e-05         Y
## 167        1.387089e-04         Y
## 168        1.330022e-04         Y
## 169        1.966108e-08         Y
## 170        1.263224e-04         Y
## 171        1.248995e-04         Y
## 172        4.942937e-05         Y
## 173        6.641061e-10         Y
## 174        1.323467e-28         Y
## 175        5.729721e-09         Y
## 176        1.045383e-04         Y
## 177        7.376328e-05         Y
## 178        2.910599e-11         Y
## 179        1.423904e-38         Y
## 180        4.212988e-08         Y
## 181        3.277995e-05         Y
## 182        7.667023e-39         Y
## 183        2.116239e-09         Y
## 184        2.230871e-09         Y
## 185        8.893484e-27         Y
## 186        1.262793e-12         Y
## 187        6.903392e-34         Y
## 188        7.504222e-07         Y
## 189        8.355864e-07         Y
## 190        2.598605e-05         Y
## 191        8.359612e-08         Y
## 192        2.337918e-07         Y
## 193        4.278304e-07         Y
## 194        8.465073e-33         Y
## 195        8.714480e-13         Y
## 196        1.442968e-47         Y
## 197        4.315037e-37         Y
## 198        6.500352e-13         Y
## 199        8.033724e-12         Y
## 200        1.955891e-04         Y
## 201        1.203414e-11         Y
## 202        4.671850e-18         Y
## 203        3.190658e-33         Y
## 204        1.279412e-08         Y
## 205        4.244331e-46         Y
## 206        6.393867e-09         Y
## 207        1.585929e-04         Y
## 208        1.426600e-41         Y
## 209        1.563533e-14         Y
## 210        2.162582e-05         Y
## 211        3.718639e-07         Y
## 212        2.090682e-10         Y
  • Посмотрим на данные здоровых людей и людей с СРК как на многомерный вектор по всем таксонам и группам
combined_bacteria_G <- combined_bacteria_clean %>%
  select(Health_state, ends_with("_G"))

d <- dist(combined_bacteria_G) # euclidean distances between the rows
fit <- cmdscale(d,eig=TRUE, k=2) # k is the number of dim

df_mds <- data.frame(
  x = fit$points[,1],
  y = fit$points[,2]
  )  

df_full <- cbind(df_mds, combined_info) %>% mutate(Health_state_n = case_when(Health_state == "Health"  ~ 0,
                                                                              Health_state == "Disease" ~ 1))

ggplot(df_full, aes(x = x, y = y, color = Health_state)) +
  geom_point() +
  theme_bw() +
  ggtitle("Распределение вектора таксонов в зависимости от группы пациентов")

  • Используя метод пермутаций проверим отличаются ли группы в зависимомти от Health_state
adonis2(d ~ Health_state_n, data = df_full)
## Permutation test for adonis under reduced model
## Terms added sequentially (first to last)
## Permutation: free
## Number of permutations: 999
## 
## adonis2(formula = d ~ Health_state_n, data = df_full)
##                 Df SumOfSqs     R2      F Pr(>F)   
## Health_state_n   1     1046 0.0122 4.6817  0.004 **
## Residual       379    84659 0.9878                 
## Total          380    85705 1.0000                 
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1

Тест Манна-Уитни для сравнения каждого таксона между больными и здоровыми

  • после округления всех значений до целого
Wilcox_comparison_round_0 <- data_wide %>% 
  select(Health_state, Archaea, Bacteria,
         ends_with(c("_D", "_P", "_O", "_C", "_F", "_G"))) %>% 
  mutate(across (where (is.numeric), function (x) round (x,0))) %>% 
  summarise_if (is.numeric, function (x) (wilcox.test(x ~ .$Health_state)$p.value)) %>% 
  pivot_longer(everything()) %>% 
  rename (Taxon = name, p_value = value) %>% 
  filter (p_value <= 0.05 ) %>% 
  arrange(p_value) %>% 
  add_column(p_value_holm = p.adjust(.$p_value, "holm")) %>% 
  add_column(p_value_BH = p.adjust(.$p_value, "BH"))

 rbind (
   "Количество значимо различающихся таксонов по p_value" = nrow (Wilcox_comparison_round_0),
 "Количество значимо различающихся таксонов по p_value_holm" = nrow (Wilcox_comparison_round_0 %>% filter (p_value_holm <= 0.05 )),
 "Количество значимо различающихся таксонов по p_value_BH" = nrow (Wilcox_comparison_round_0 %>% filter (p_value_BH <= 0.05 ))
 )
##                                                           [,1]
## Количество значимо различающихся таксонов по p_value       100
## Количество значимо различающихся таксонов по p_value_holm   54
## Количество значимо различающихся таксонов по p_value_BH    100
  • после округления всех значений до десятых
Wilcox_comparison_round_1 <- data_wide %>% 
  select(Health_state, Archaea, Bacteria,
         ends_with(c("_D", "_P", "_O", "_C", "_F", "_G"))) %>% 
  mutate(across (where (is.numeric), function (x) round (x,1))) %>% 
  summarise_if (is.numeric, function (x) (wilcox.test(x ~ .$Health_state)$p.value)) %>% 
  pivot_longer(everything()) %>% 
  rename (Taxon = name, p_value = value) %>% 
  filter (p_value <= 0.05 ) %>% 
  arrange(p_value) %>% 
  add_column(p_value_holm = p.adjust(.$p_value, "holm")) %>% 
  add_column(p_value_BH = p.adjust(.$p_value, "BH"))

 rbind (
   "Количество значимо различающихся таксонов по p_value" = nrow (Wilcox_comparison_round_1),
 "Количество значимо различающихся таксонов по p_value_holm" = nrow (Wilcox_comparison_round_1 %>% filter (p_value_holm <= 0.05 )),
 "Количество значимо различающихся таксонов по p_value_BH" = nrow (Wilcox_comparison_round_1 %>% filter (p_value_BH <= 0.05 ))
 )
##                                                           [,1]
## Количество значимо различающихся таксонов по p_value       273
## Количество значимо различающихся таксонов по p_value_holm  155
## Количество значимо различающихся таксонов по p_value_BH    273
  • после округления всех значений до сотых
Wilcox_comparison_round_2 <- data_wide %>% 
  select(Health_state, Archaea, Bacteria,
         ends_with(c("_D", "_P", "_O", "_C", "_F", "_G"))) %>% 
  mutate(across (where (is.numeric), function (x) round (x,2))) %>% 
  summarise_if (is.numeric, function (x) (wilcox.test(x ~ .$Health_state)$p.value)) %>% 
  pivot_longer(everything()) %>% 
  rename (Taxon = name, p_value = value) %>% 
  filter (p_value <= 0.05 ) %>% 
  arrange(p_value) %>% 
  add_column(p_value_holm = p.adjust(.$p_value, "holm")) %>% 
  add_column(p_value_BH = p.adjust(.$p_value, "BH"))

 rbind (
   "Количество значимо различающихся таксонов по p_value" = nrow (Wilcox_comparison_round_2),
 "Количество значимо различающихся таксонов по p_value_holm" = nrow (Wilcox_comparison_round_2 %>% filter (p_value_holm <= 0.05 )),
 "Количество значимо различающихся таксонов по p_value_BH" = nrow (Wilcox_comparison_round_2 %>% filter (p_value_BH <= 0.05 ))
 )
##                                                           [,1]
## Количество значимо различающихся таксонов по p_value       599
## Количество значимо различающихся таксонов по p_value_holm  374
## Количество значимо различающихся таксонов по p_value_BH    599

GLM метод для нулей

library("haven")
library("ResourceSelection")  ## Package to perform the Hosmer-Lemeshow GOF test
library("survey")
library("prediction")
library("margins")
library("ggeffects")
library("sjPlot")
library("statmod")
#devtools::install_github("strengejacke/strengejacke")
#install.packages(c("haven", "ResourceSelection", "survey", "prediction", "margins", "ggeffects", "sjPlot", "statmod"))
options(survey.lonely.psu = 'adjust')
start_values <- c(0, 0, 1)

G - Genus (Род)

analyze_taxon <- function(taxon_name, data) {
  tryCatch(
    {
      data_filtered <- data %>%
        filter(Taxon == taxon_name) %>%
        select(patient_ID, Health_state, Percentage, Age_range, research_ID) %>%
        mutate(Health_state_num = ifelse(Health_state == "Health", 0, 1)) # для упрацения интерпритации процентов
      
      mepsdsgn = svydesign(
        id = ~patient_ID,
        strata = ~research_ID,
        weights = NULL,
        data = data_filtered,
        nest = TRUE)
      
      start_values <- c(0, 0, 1)
      
      model <- svyglm(Percentage ~ Health_state_num + research_ID,
                      mepsdsgn,
                      family = tweedie(var.power = 2, link.power = 1),
                      start = start_values)
      
      summary_table <- summary(model)
      
      tidy_output <- tidy(model)
      
      result_table1 <- tidy_output %>%
        filter(term == "Health_state_num") %>%
        select(estimate, p.value)
      
      result_table2 <- as.data.frame(confint(model)["Health_state_num", ])
      
      result_table2_transposed <- t(result_table2)
      
      final_result_table_transposed <- bind_cols(result_table1, result_table2_transposed) %>%
        select(estimate, `2.5 %`, `97.5 %`, p.value)
      
      final_result_table_transposed$Taxon <- taxon_name
      
      return(final_result_table_transposed)
    },
    error = function(e) {
      # Обработка ошибки (можно добавить сообщение или просто вернуть NULL)
      cat("Error in analyze_taxon for Taxon:", taxon_name, "\n")
      return(NULL)
    }
  )
}

# Применение функции ко всем таксонам
unique_taxa <- unique(G_long$Taxon)

result_list <- lapply(unique_taxa, function(taxon) {
  analyze_result <- analyze_taxon(taxon, G_long)
  if (!is.null(analyze_result)) {
    return(analyze_result)
  } else {
    return(data.frame())  # Вернуть пустой data.frame, чтобы не влиять на bind_rows
  }
})
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: A2_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Acetanaerobacterium_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Acetitomaculum_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Acetobacterium_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Acidaminococcus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Acidovorax_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Acinetobacter_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Actinobacillus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Actinomyces_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Aeromonas_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Agathobacter_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Akkermansia_G
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся

## Warning: созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Alcanivorax_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Alistipes_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Alloprevotella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Anaerococcus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Anaerocolumna_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Anaerofilum_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Anaerofustis_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Anaerosporobacter_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Anaerostipes_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Anaerotruncus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Anaerovorax_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью

## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью

## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: BCf9-17 termite group_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Bacillus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Bacteroides_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Barnesiella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Bifidobacterium_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Bilophila_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Blautia_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью

## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Burkholderia-Caballeronia-Paraburkholderia_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Butyricicoccus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Butyricimonas_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Butyrivibrio_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: CAG-352_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: CAG-56_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: CHKCI001_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: CHKCI002_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Caldalkalibacillus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью

## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью

## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью

## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью

## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Candidatus Omnitrophus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Candidatus Phytoplasma_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Candidatus Soleaferrea_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Candidatus Stoquefichus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Candidatus Vestibaculum_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Caproiciproducens_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Catalinimonas_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Catenibacterium_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Catonella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Christensenella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Christensenellaceae R-7 group_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Citrobacter_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Cloacibacillus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Clostridioides_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Clostridium sensu stricto 11_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Clostridium sensu stricto 12_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Clostridium sensu stricto 13_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Clostridium sensu stricto 1_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Colidextribacter_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Collinsella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Coprobacillus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Coprobacter_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Coprococcus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Corynebacterium_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Cupriavidus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: DTU089_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Dechloromonas_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Defluviitaleaceae UCG-011_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Delftia_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Desulfovibrio_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Dethiosulfatibacter_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Dialister_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Dielma_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Dysgonomonas_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Eggerthella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Eisenbergiella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Enterobacter_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Enterococcus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Enterorhabdus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Epulopiscium_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Erysipelatoclostridium_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Erysipelotrichaceae UCG-003_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Escherichia-Shigella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Ezakiella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Faecalibacterium_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Faecalibaculum_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Family XIII AD3011 group_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Family XIII UCG-001_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Fastidiosipila_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Fermentimonas_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Fournierella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Frisingicoccus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Fusibacter_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Fusicatenibacter_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Fusobacterium_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: GCA-900066575_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: GCA-900066755_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Gemella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Geobacillus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Granulicatella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Haemophilus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Harryflintia_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся

## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Herbinix_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Holdemanella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Holdemania_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Howardella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Hungatella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью

## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Intestinibacter_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Intestinimonas_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Johnsonella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Klebsiella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnoanaerobaculum_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnoclostridium_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospira_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae AC2044 group_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae FCS020 group_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae FE2018 group_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae NC2004 group_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae ND3007 group_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae NK3A20 group_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae NK4A136 group_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae UCG-001_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae UCG-002_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae UCG-004_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae UCG-006_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae UCG-008_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae UCG-009_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae UCG-010_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae XPB1014 group_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Lacticaseibacillus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Lactobacillus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Lactococcus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Limnohabitans_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Limosilactobacillus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Lutispora_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Lysinibacillus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Magnetococcus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Mailhella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью

## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Marvinbryantia_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Massilia_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Megasphaera_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Methylomonas_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Error in analyze_taxon for Taxon: Microbacterium_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Mogibacterium_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Monoglobus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Moryella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся

## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: NK4A214 group_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью

## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью

## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Negativibacillus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: OM27 clade_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Odoribacter_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Olsenella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Oribacterium_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Oscillibacter_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Oscillospira_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Paenibacillus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Paludicola_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Pantoea_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Papillibacter_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Parabacteroides_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Paraclostridium_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Paraprevotella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Parasutterella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Parvimonas_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Peptoclostridium_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Peptococcus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Peptoniphilus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Peptostreptococcus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Phascolarctobacterium_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Phocea_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Photobacterium_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Porphyromonas_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Prevotella_7_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Prevotella_9_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Prevotella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Prevotellaceae NK3B31 group_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Prevotellaceae UCG-001_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Prevotellaceae UCG-003_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Prevotellaceae UCG-004_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Proteiniclasticum_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Proteiniphilum_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Pseudobutyrivibrio_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Pseudomonas_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Ralstonia_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Rhodoferax_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Rikenellaceae RC9 gut group_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Robinsoniella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Romboutsia_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Roseburia_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Ruminiclostridium_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Ruminococcus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Saccharofermentans_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Salmonella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Sarcina_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Selenomonas_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Sellimonas_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Serratia_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Shewanella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Shuttleworthia_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Slackia_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Spirosoma_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Sporacetigenium_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Sporobacter_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Staphylococcus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Stenotrophomonas_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Stomatobaculum_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Streptococcus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Streptomyces_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Subdoligranulum_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Succiniclasticum_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Sutterella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Syntrophococcus_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Tannerella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Terrisporobacter_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Turicibacter_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Tuzzerella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Tyzzerella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: UBA1819_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: UCG-002_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: UCG-003_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: UCG-004_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: UCG-005_G
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся

## Warning: созданы NaN

## Warning: созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: UCG-008_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: UCG-009_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: UCG-012_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: V9D2013 group_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью

## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Veillonella_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Vibrio_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: Victivallis_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: [Bacteroides] pectinophilus group_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: [Eubacterium] brachy group_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: [Eubacterium] eligens group_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: [Eubacterium] fissicatena group_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: [Eubacterium] hallii group_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: [Eubacterium] nodatum group_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: [Eubacterium] oxidoreducens group_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: [Eubacterium] ruminantium group_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: [Eubacterium] siraeum group_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: [Eubacterium] ventriosum group_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: [Eubacterium] xylanophilum group_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: [Ruminococcus] gauvreauii group_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: [Ruminococcus] gnavus group_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN

## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Error in analyze_taxon for Taxon: [Ruminococcus] torques group_G
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
# Объединение результатов в один dataframe
final_result_df <- bind_rows(result_list) %>%
  mutate(estimate = round(estimate, 3),
         `2.5 %` = round(`2.5 %`, 4),
         `97.5 %` = round(`97.5 %`, 4)
         )

# Коррекция на множественные сравнения по методу Холма
final_result_df$p.adjusted <- p.adjust(final_result_df$p.value, method = "holm")

# Фильтрация только статистически значимых результатов
significant_results_G <- final_result_df %>%
  filter(p.adjusted < 0.05)

# Вывод статистически значимых результатов
cat("Статистически значимые результаты:\n")
## Статистически значимые результаты:
significant_results_G
##    estimate   2.5 %  97.5 %      p.value                             Taxon
## 1    -0.002 -0.0031 -0.0015 5.575959e-08                 Acetoanaerobium_G
## 2     0.004  0.0024  0.0058 2.241619e-06                    Acholeplasma_G
## 3    -0.003 -0.0036 -0.0016 4.349645e-07                   Achromobacter_G
## 4     0.058  0.0444  0.0707 2.274454e-16                 Acidaminobacter_G
## 5    -0.001 -0.0020 -0.0008 4.047637e-06                   Aeriscardovia_G
## 6    -0.050 -0.0664 -0.0329 1.150352e-08                    Alkaliflexus_G
## 7     0.002  0.0011  0.0023 5.803507e-08                     Anaerospora_G
## 8     0.009  0.0068  0.0113 8.355986e-14                   Anaerostignum_G
## 9     0.010  0.0062  0.0129 4.466792e-08                   Anoxybacillus_G
## 10    0.003  0.0013  0.0041 1.600273e-04             Antarcticibacterium_G
## 11   -0.001 -0.0013 -0.0006 1.358989e-06                       Arcicella_G
## 12   -0.001 -0.0020 -0.0009 8.420553e-07 Blvii28 wastewater-sludge group_G
## 13   -0.007 -0.0101 -0.0038 2.012172e-05         Candidatus Armantifilum_G
## 14   -0.002 -0.0026 -0.0010 1.074295e-05                  Chthoniobacter_G
## 15   -0.001 -0.0014 -0.0006 1.996290e-06            Clostridiisalibacter_G
## 16    0.007  0.0057  0.0084 7.905729e-22                       Colwellia_G
## 17   -0.003 -0.0047 -0.0019 3.622570e-06       Coriobacteriaceae UCG-002_G
## 18   -0.004 -0.0046 -0.0029 9.515334e-17                    Crocinitomix_G
## 19   -0.003 -0.0037 -0.0016 8.885081e-07                  Desulfurispora_G
## 20   -0.009 -0.0113 -0.0075 4.495532e-20     Erysipelotrichaceae UCG-002_G
## 21    0.050  0.0277  0.0724 1.410394e-05                    Faecalitalea_G
## 22   -0.107 -0.1274 -0.0869 2.191088e-22                  Flavobacterium_G
## 23    0.013  0.0071  0.0197 3.381871e-05                  Flavonifractor_G
## 24   -0.003 -0.0031 -0.0021 1.774451e-24                         Formosa_G
## 25    0.003  0.0015  0.0040 1.023083e-05                    Halobacillus_G
## 26    0.009  0.0071  0.0104 3.042978e-22                  Halochromatium_G
## 27    0.003  0.0022  0.0046 4.125348e-08                       Hassallia_G
## 28    0.006  0.0047  0.0079 1.163144e-13                       Hespellia_G
## 29   -0.003 -0.0043 -0.0014 1.026609e-04                  Hydrogenispora_G
## 30   -0.001 -0.0021 -0.0008 1.941392e-05                     Izimaplasma_G
## 31    0.009  0.0063  0.0127 9.174004e-09     Lachnospiraceae NK4B4 group_G
## 32   -0.003 -0.0035 -0.0023 2.073960e-17                     Lachnotalea_G
## 33    0.018  0.0117  0.0242 3.406944e-08             Lactiplantibacillus_G
## 34   -0.001 -0.0021 -0.0007 4.283525e-05                      Lawsonella_G
## 35    0.004  0.0022  0.0052 2.133461e-06              Lentilactobacillus_G
## 36   -0.003 -0.0036 -0.0016 4.664252e-07            Leptococcus JA-3-3Ab_G
## 37    0.001  0.0008  0.0017 4.907282e-08                     Leucobacter_G
## 38   -0.004 -0.0062 -0.0024 9.792366e-06              Macellibacteroides_G
## 39   -0.003 -0.0045 -0.0016 3.336594e-05                     Marinifilum_G
## 40    0.007  0.0036  0.0112 1.342625e-04                    Marinobacter_G
## 41    0.114  0.0529  0.1743 2.664571e-04              Methanobrevibacter_G
## 42    0.002  0.0010  0.0028 7.425223e-05                        Nocardia_G
## 43    0.013  0.0082  0.0178 1.991548e-07                     Oxalobacter_G
## 44   -0.003 -0.0037 -0.0021 7.131965e-12                       Oxobacter_G
## 45   -0.003 -0.0039 -0.0022 6.501018e-12              Paramaledivibacter_G
## 46    0.013  0.0095  0.0173 6.604233e-11                  Porphyrobacter_G
## 47   -0.006 -0.0087 -0.0025 4.268308e-04      Prevotellaceae Ga6A1 group_G
## 48    0.004  0.0030  0.0047 6.993651e-18               Pseudarthrobacter_G
## 49   -0.001 -0.0014 -0.0006 2.909338e-06               Pseudoclostridium_G
## 50   -0.003 -0.0042 -0.0016 1.093742e-05                   Pygmaiobacter_G
## 51    0.003  0.0012  0.0040 1.788832e-04                            RB41_G
## 52   -0.006 -0.0086 -0.0030 6.662858e-05                       Rikenella_G
## 53    0.004  0.0019  0.0054 6.310511e-05                     Rubrobacter_G
## 54   -0.003 -0.0046 -0.0017 2.144453e-05                    Salinibacter_G
## 55   -0.006 -0.0077 -0.0052 1.327532e-21                 Sedimentibacter_G
## 56    0.086  0.0564  0.1152 2.015036e-08                Senegalimassilia_G
## 57   -0.003 -0.0033 -0.0021 5.274500e-17                 Serpentinicella_G
## 58    0.065  0.0375  0.0929 5.236525e-06                   Solobacterium_G
## 59    0.002  0.0012  0.0038 1.601488e-04                   Spirochaeta 2_G
## 60    0.001  0.0007  0.0017 3.115478e-06                Sporanaerobacter_G
## 61   -0.003 -0.0032 -0.0023 3.065788e-26                Subsaximicrobium_G
## 62    0.004  0.0032  0.0048 3.216253e-19                  Syntrophomonas_G
## 63   -0.016 -0.0198 -0.0116 4.044468e-13                Thermacetogenium_G
## 64    0.002  0.0012  0.0023 1.096515e-09                        Truepera_G
## 65   -0.001 -0.0018 -0.0007 1.169751e-05                   Virgibacillus_G
## 66   -0.003 -0.0040 -0.0013 8.050199e-05                         XBB1006_G
## 67   -0.001 -0.0015 -0.0007 1.499675e-07       [Eubacterium] yurii group_G
##      p.adjusted
## 1  8.642736e-06
## 2  3.227932e-04
## 3  6.567964e-05
## 4  3.866572e-14
## 5  5.666692e-04
## 6  1.852067e-06
## 7  8.937401e-06
## 8  1.412162e-11
## 9  7.012863e-06
## 10 1.920328e-02
## 11 1.997715e-04
## 12 1.254662e-04
## 13 2.635945e-03
## 14 1.461041e-03
## 15 2.914583e-04
## 16 1.407220e-19
## 17 5.107823e-04
## 18 1.627122e-14
## 19 1.314992e-04
## 20 7.912135e-18
## 21 1.875825e-03
## 22 3.943958e-20
## 23 4.328795e-03
## 24 3.211755e-22
## 25 1.401624e-03
## 26 5.446931e-20
## 27 6.518049e-06
## 28 1.954081e-11
## 29 1.252463e-02
## 30 2.562637e-03
## 31 1.486189e-06
## 32 3.587950e-15
## 33 5.417042e-06
## 34 5.440077e-03
## 35 3.093519e-04
## 36 6.996378e-05
## 37 7.655360e-06
## 38 1.351347e-03
## 39 4.304206e-03
## 40 1.624576e-02
## 41 3.117548e-02
## 42 9.207277e-03
## 43 3.027153e-05
## 44 1.176774e-09
## 45 1.079169e-09
## 46 1.083094e-08
## 47 4.951237e-02
## 48 1.216895e-15
## 49 4.160353e-04
## 50 1.476552e-03
## 51 2.110822e-02
## 52 8.328573e-03
## 53 7.951244e-03
## 54 2.787789e-03
## 55 2.349732e-19
## 56 3.224058e-06
## 57 9.072141e-15
## 58 7.278770e-04
## 59 1.920328e-02
## 60 4.423978e-04
## 61 5.579734e-24
## 62 5.628443e-17
## 63 6.754262e-11
## 64 1.787319e-07
## 65 1.567467e-03
## 66 9.901745e-03
## 67 2.294503e-05

Распределения таксонов G(Genus - Род)

Гистограмма по количеству пациентов (Здоров - СРК)

create_and_plot_taxon_groups <- function(filter_pattern, step_size, dataset_name) {
  
  # Получаем уникальные таксоны, удовлетворяющие условиям
  unique_taxa <- Wilcox_comparison_round_2 %>%
    subset(grepl(filter_pattern, Taxon)) %>%
    filter(p_value_holm < 0.05) %>%
    distinct(Taxon)
  
  # Разбиваем уникальные таксоны на группы по step_size
  taxon_groups <- split(unique_taxa, rep(1:ceiling(nrow(unique_taxa) / step_size), each = step_size, length.out = nrow(unique_taxa)))
  
  # Проходим по группам и строим графики
  for (i in seq_along(taxon_groups)) {
    current_taxa <- taxon_groups[[i]]
    
    current_dataset <- get(dataset_name)  # Получаем датасет по его имени
    
    G_long_filtered <- current_dataset %>%
      filter(Taxon %in% current_taxa$Taxon & Percentage > 0) %>%
      group_by(Health_state, Taxon) %>%
      summarise(Count = n(), .groups = "drop")
    
    bar_plot <- ggplot(G_long_filtered, aes(x = Health_state, y = Count, fill = Health_state == "Disease")) +
      geom_bar(position = "dodge", color = "black", stat = "identity") +
      scale_fill_manual(values = c("skyblue", "red"), guide = FALSE) +
      labs(title = paste("Гистограмма для таксонов", (i - 1) * step_size + 1, "до", min(i * step_size, nrow(unique_taxa)), "в разрезе Health_state"),
           x = "Статус пациента",
           y = "Количество пациентов, у которых обнаружен данный таксон") +
      coord_flip() +
      facet_wrap(~Taxon, scales = "free_y", ncol = 2, shrink = 0.7) +  # Уменьшение пространства между фасетами
      theme(axis.text.x = element_text(angle = 45, hjust = 1, size = 5),  # Поворот текста на оси X и уменьшение шрифта
            axis.text.y = element_text(hjust = 1, size = 5),
            strip.text = element_text(size = 5))  # Уменьшение шрифта для названия фасет
    
    print(bar_plot)  # Отображение графика на экране
    
  }
}

# Пример вызова функции с передачей "_G" в качестве аргумента и названия датасета "G_long"
create_and_plot_taxon_groups("_G", 18, "G_long")
## Warning: The `guide` argument in `scale_*()` cannot be `FALSE`. This was deprecated in
## ggplot2 3.3.4.
## ℹ Please use "none" instead.
## This warning is displayed once every 8 hours.
## Call `lifecycle::last_lifecycle_warnings()` to see where this warning was
## generated.

график солнышко

create_and_plot_circular_diagrams <- function(dataset, filter_pattern, step_size, filename) {
  
  # Получаем уникальные таксоны, удовлетворяющие условиям
  unique_taxa <- Wilcox_comparison_round_2 %>%
    subset(grepl(filter_pattern, Taxon)) %>%
    filter(p_value_holm < 0.05) %>%
    distinct(Taxon)
  
  # Разбиваем уникальные таксоны на группы по step_size
  taxon_groups <- split(unique_taxa, rep(1:ceiling(nrow(unique_taxa) / step_size), each = step_size, length.out = nrow(unique_taxa)))
  
  # Проходим по группам и строим графики
  for (i in seq_along(taxon_groups)) {
    current_taxa <- taxon_groups[[i]]
    
    G_long_filtered <- dataset %>%
      filter(Taxon %in% current_taxa$Taxon & Percentage > 0) %>%
      group_by(Health_state, Taxon) %>%
      summarise(Count = n(), .groups = "drop")
    
    # Добавляем строки с Count = 0 для всех комбинаций Health_state и Taxon
    G_long_filtered <- G_long_filtered %>%
      complete(Health_state, Taxon, fill = list(Count = 0))
    
    data_id <- G_long_filtered %>% filter(G_long_filtered$Health_state == "Disease") %>%
      mutate(id = row_number()) %>% 
      select(Taxon, id)
    
    G_long_filtered <- left_join(G_long_filtered, data_id, by = "Taxon")
    
    labels_data <- G_long_filtered %>% filter(Health_state == "Disease")
    number_of_bars <- nrow(labels_data)
    
    #Вычислим углы для лейбла каждого барра
    labels_data$angel <- 90 - 360 * (labels_data$id-0.5) / number_of_bars
    
    # Добавим горизонтольную регулировку
    labels_data <- labels_data %>%
      mutate(hjust = ifelse(angel < -90, 1, 0))
    
    # Перевернем лейбл в зависимости от "полушария"
    labels_data <- labels_data %>%
      mutate(angel = ifelse(angel < -90, angel + 180, angel))
    
    # Круговая диаграмма для объединенного датасета
    p <- ggplot(data = G_long_filtered, mapping = aes(x = id, y = Count, fill = Health_state)) + 
      geom_bar(stat = "identity", position = "stack") + 
      ylim(-150, 500) +
      
      # Добавляем кастомную тему
      theme_minimal(base_size = 8) +
      theme(axis.text   = element_blank(),
            axis.title  = element_blank(),
            panel.grid  = element_blank(),
            plot.margin = unit(rep(-1, 6), "cm")) +
      coord_polar(start = 0)+
      geom_text(data = labels_data,
                aes(x = id, y = Count,
                    label = Taxon,
                    hjust = hjust),
                color = "black",
                fontface = "bold",
                alpha = 0.9,
                size = 1.5,
                angle = labels_data$angel,
                inherit.aes = FALSE) +
      # Добавляем горизонтальные линии сетки
      geom_hline(yintercept = seq(0, 300, by = 50),
                 linetype = "dotted",
                 color = "gray",
                 size = 0.5) +
      # Добавляем значения рядом с линиями сетки
      annotate("text", x = 1.2, y = seq(0, 300, by = 50),
               label = seq(0, 300, by = 50),
               color = "black",
               size = 3,
               alpha = 40,
               hjust = 0)
    
    p <- p + annotate("text", x = 0.5, y = 490, label = "Сотношение здоровых пациентов и пациентов с СРК",
                      size = 5, color = "black", fontface = "bold", hjust = 0.5)
    
    # Сформируем имя файла для сохранения
    current_filename <- paste0(filename, "_", i, ".png")
    
    # Сохраняем график под уникальным именем
    ggsave(current_filename, p, width = 10, height = 8)
    
    print(p)
  }
}

# Пример вызова функции
create_and_plot_circular_diagrams(G_long, "_G", 40, "output_plot")
## Warning: Using `size` aesthetic for lines was deprecated in ggplot2 3.4.0.
## ℹ Please use `linewidth` instead.
## This warning is displayed once every 8 hours.
## Call `lifecycle::last_lifecycle_warnings()` to see where this warning was
## generated.

Боксплот по возрасту

create_and_plot_boxplots <- function(G_long, filter_pattern, step_size, x_var, title) {
  
  # Получаем уникальные таксоны, удовлетворяющие условиям
  unique_taxa <- Wilcox_comparison_round_2 %>%
    subset(grepl(filter_pattern, Taxon)) %>%
    filter(p_value_holm < 0.05) %>%
    distinct(Taxon)
  
  # Разбиваем уникальные таксоны на группы по step_size
  taxon_groups <- split(unique_taxa, rep(1:ceiling(nrow(unique_taxa) / step_size), each = step_size, length.out = nrow(unique_taxa)))
  
  # Проходим по группам и строим боксплоты
  for (i in seq_along(taxon_groups)) {
    current_taxa <- taxon_groups[[i]]
    
    G_long_filtered <- G_long %>%
      filter(Taxon %in% current_taxa$Taxon & Percentage > 0)
    
    # Создаем формулу для переменной x_var
    formula <- as.formula(paste("Age ~", x_var))
    
    # Строим боксплот
    box_plot <- ggplot(G_long_filtered, aes_string(x = x_var, y = "Age", fill = "Health_state")) +
      geom_boxplot() +
      labs(title = paste(title),
           x = x_var,
           y = "Age") +
      theme(axis.text.x = element_text(angle = 45, hjust = 1, size = 8),  # Уменьшаем размер шрифта для подписей Taxon
            axis.title.x = element_blank(),  # Убираем название оси X
            legend.position = "bottom") +  # Перемещаем легенду вниз
      scale_fill_manual(values = c("red", "skyblue")) +
      facet_grid(~Taxon, scales = "free_y", space = "free")  # Используем facet_grid вместо facet_wrap
    
    # Отображаем график на экране
    print(box_plot)
  }
}

# Пример вызова функции с Health_state в качестве x_var
create_and_plot_boxplots(G_long, "_G", 4, "Health_state", "Боксплоты для таксонов по статусу: Здоров/СРК")
## Warning: `aes_string()` was deprecated in ggplot2 3.0.0.
## ℹ Please use tidy evaluation idioms with `aes()`.
## ℹ See also `vignette("ggplot2-in-packages")` for more information.
## This warning is displayed once every 8 hours.
## Call `lifecycle::last_lifecycle_warnings()` to see where this warning was
## generated.
## Warning: Removed 491 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 653 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 650 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 596 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 504 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 541 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 618 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 389 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 630 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 725 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 449 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 171 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 608 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 419 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 295 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 350 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 278 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 279 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 200 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 338 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 316 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 342 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 564 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 403 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 273 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 53 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 393 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 423 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 146 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 391 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 428 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 505 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 517 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 407 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 463 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 102 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 384 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

Боксплот по возросту и полу

create_and_plot_boxplots(G_long, "_G", 3, "interaction(Health_state, Sex)", "Боксплоты для таксона (Пол + статус заболевания)")
## Warning: Removed 369 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 405 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 509 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 511 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 364 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 447 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 415 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 415 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 434 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 431 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 379 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 393 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 666 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 342 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 200 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 137 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 506 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 314 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 276 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 226 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 316 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 94 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 316 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 181 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 101 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 371 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 123 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 259 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 311 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 111 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 551 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 336 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 106 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 202 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 156 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 255 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 268 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 249 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 165 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 278 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 252 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 444 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 281 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 473 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 320 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 331 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 257 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 64 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 220 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 164 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

Боксплот по возросту и статусу курения

create_and_plot_boxplots(G_long, "_G", 3, "interaction(Health_state, Smoking)", "Боксплоты для таксона (Статус курения + статус заболевания)")
## Warning: Removed 369 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 405 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 509 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 511 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 364 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 447 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 415 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 415 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 434 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 431 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 379 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 393 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 666 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 342 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 200 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 137 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 506 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 314 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 276 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 226 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 316 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 94 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 316 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 181 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 101 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 371 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 123 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 259 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 311 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 111 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 551 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 336 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 106 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 202 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 156 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 255 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 268 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 249 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 165 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 278 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 252 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 444 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 281 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 473 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 320 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 331 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 257 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 64 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 220 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 164 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

Боксплот по возросту и статусу употребления алкоголя

create_and_plot_boxplots(G_long, "_G", 3, "interaction(Health_state, Alcohol)", "Боксплоты для таксона (Статус употребления алкоголя + статус заболевания)")
## Warning: Removed 369 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 405 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 509 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 511 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 364 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 447 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 415 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 415 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 434 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 431 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 379 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 393 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 666 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 342 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 200 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 137 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 506 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 314 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 276 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 226 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 316 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 94 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 316 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 181 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 101 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 371 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 123 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 259 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 311 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 111 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 551 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 336 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 106 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 202 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 156 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 255 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 268 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 249 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 165 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 278 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 252 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 444 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 281 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 473 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 320 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 331 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 257 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 64 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 220 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 164 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

Распределения таксонов F Family(семейство)

Гистограмма по количеству пациентов (Здоров - СРК)

create_and_plot_taxon_groups("_F", 18, "F_long")

Круговая столбчатая диаграмма для отобрадения отношения здоровых пациентов и пациентов с СРК

create_and_plot_circular_diagrams(F_long, "_F", 40, "F_output_plot")

Боксплот по возрасту

create_and_plot_boxplots(F_long, "_F", 4, "Health_state", "Боксплоты для таксонов по статусу: Здоров/СРК")
## Warning: Removed 410 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 614 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 685 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 479 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 636 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 400 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 607 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 383 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 219 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 505 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 243 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 172 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 495 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 427 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 147 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 89 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 267 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 457 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 480 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 117 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 444 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 248 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 325 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 547 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 52 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

Боксплот по возросту и полу

create_and_plot_boxplots(F_long, "_F", 3, "interaction(Health_state, Sex)", "Боксплоты для таксона (Пол + статус заболевания)")
## Warning: Removed 383 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 307 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 463 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 556 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 339 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 497 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 360 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 319 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 482 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 281 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 283 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 163 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 454 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 209 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 131 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 126 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 454 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 238 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 259 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 118 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 61 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 84 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 409 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 259 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 438 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 104 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 122 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 377 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 228 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 98 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 262 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 532 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 52 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

Боксплот по возросту и статусу курения

create_and_plot_boxplots(F_long, "_F", 3, "interaction(Health_state, Smoking)", "Боксплоты для таксона (Статус курения + статус заболевания)")
## Warning: Removed 383 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 307 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 463 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 556 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 339 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 497 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 360 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 319 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 482 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 281 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 283 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 163 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 454 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 209 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 131 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 126 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 454 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 238 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 259 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 118 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 61 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 84 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 409 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 259 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 438 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 104 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 122 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 377 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 228 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 98 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 262 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 532 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 52 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

Боксплот по возросту и статусу употребления алкоголя

create_and_plot_boxplots(F_long, "_F", 3, "interaction(Health_state, Alcohol)", "Боксплоты для таксона (Статус употребления алкоголя + статус заболевания)")
## Warning: Removed 383 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 307 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 463 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 556 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 339 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 497 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 360 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 319 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 482 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 281 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 283 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 163 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 454 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 209 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 131 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 126 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 454 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 238 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 259 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 118 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 61 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 84 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 409 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 259 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 438 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 104 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 122 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 377 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 228 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 98 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 262 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 532 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 52 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

Распределения таксонов C - Class (класс)

Гистограмма по количеству пациентов (Здоров - СРК)

create_and_plot_taxon_groups("_C", 18, "C_long")

Круговая столбчатая диаграмма для отобрадения отношения здоровых пациентов и пациентов с СРК

create_and_plot_circular_diagrams(C_long, "_C", 40, "F_output_plot")

Боксплот по возрасту

create_and_plot_boxplots(C_long, "_C", 4, "Health_state", "Боксплоты для таксонов по статусу: Здоров/СРК")
## Warning: Removed 519 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 628 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 235 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 330 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 292 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 181 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 296 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 117 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 214 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

Боксплот по возросту и полу

create_and_plot_boxplots(C_long, "_C", 3, "interaction(Health_state, Sex)", "Боксплоты для таксона (Пол + статус заболевания)")
## Warning: Removed 327 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 564 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 312 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 179 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 269 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 132 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 297 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 105 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 263 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 95 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 55 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 214 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

Боксплот по возросту и статусу курения

create_and_plot_boxplots(C_long, "_C", 3, "interaction(Health_state, Smoking)", "Боксплоты для таксона (Статус курения + статус заболевания)")
## Warning: Removed 327 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 564 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 312 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 179 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 269 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 132 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 297 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 105 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 263 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 95 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 55 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 214 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

Боксплот по возросту и статусу употребления алкоголя

create_and_plot_boxplots(C_long, "_C", 3, "interaction(Health_state, Alcohol)", "Боксплоты для таксона (Статус употребления алкоголя + статус заболевания)")
## Warning: Removed 327 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 564 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 312 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 179 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 269 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 132 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 297 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 105 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 263 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 95 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 55 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 214 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

Распределения таксонов O - Order (порядок)

Гистограмма по количеству пациентов (Здоров - СРК)

create_and_plot_taxon_groups("_O", 18, "O_long")

Круговая столбчатая диаграмма для отобрадения отношения здоровых пациентов и пациентов с СРК

create_and_plot_circular_diagrams(O_long, "_O", 30, "F_output_plot")

Боксплот по возрасту

create_and_plot_boxplots(O_long, "_O", 4, "Health_state", "Боксплоты для таксонов по статусу: Здоров/СРК")
## Warning: Removed 497 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 705 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 596 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 465 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 604 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 384 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 385 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 284 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 287 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 613 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 168 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 110 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 275 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 376 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 306 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 94 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 269 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 321 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 244 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

Боксплот по возросту и полу

create_and_plot_boxplots(O_long, "_O", 3, "interaction(Health_state, Sex)", "Боксплоты для таксона (Пол + статус заболевания)")
## Warning: Removed 374 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 428 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 621 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 375 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 386 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 284 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 643 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 140 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 342 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 242 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 242 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 130 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 391 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 337 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 81 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 82 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 59 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 282 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 343 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 273 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 73 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 268 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 47 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 296 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 244 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

Боксплот по возросту и статусу курения

create_and_plot_boxplots(O_long, "_O", 3, "interaction(Health_state, Smoking)", "Боксплоты для таксона (Статус курения + статус заболевания)")
## Warning: Removed 374 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 428 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 621 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 375 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 386 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 284 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 643 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 140 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 342 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 242 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 242 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 130 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 391 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 337 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 81 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 82 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 59 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 282 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 343 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 273 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 73 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 268 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 47 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 296 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 244 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

Боксплот по возросту и статусу употребления алкоголя

create_and_plot_boxplots(O_long, "_O", 3, "interaction(Health_state, Alcohol)", "Боксплоты для таксона (Статус употребления алкоголя + статус заболевания)")
## Warning: Removed 374 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 428 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 621 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 375 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 386 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 284 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 643 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 140 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 342 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 242 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 242 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 130 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 391 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 337 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 81 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 82 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 59 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 282 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 343 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 273 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 73 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 268 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 47 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 296 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 244 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

Распределения таксонов P - Phylum (тип)

Гистограмма по количеству пациентов (Здоров - СРК)

create_and_plot_taxon_groups("_P", 18, "P_long")

Круговая столбчатая диаграмма для отобрадения отношения здоровых пациентов и пациентов с СРК

create_and_plot_circular_diagrams(P_long, "_P", 30, "P_output_plot")

Боксплот по возрасту

create_and_plot_boxplots(P_long, "_P", 4, "Health_state", "Боксплоты для таксонов по статусу: Здоров/СРК")
## Warning: Removed 660 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 603 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 496 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 317 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 90 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

Боксплот по возросту и полу

create_and_plot_boxplots(P_long, "_P", 3, "interaction(Health_state, Sex)", "Боксплоты для таксона (Пол + статус заболевания)")
## Warning: Removed 529 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 295 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 617 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 318 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 295 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 112 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

Боксплот по возросту и статусу курения

create_and_plot_boxplots(P_long, "_P", 3, "interaction(Health_state, Smoking)", "Боксплоты для таксона (Статус курения + статус заболевания)")
## Warning: Removed 529 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 295 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 617 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 318 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 295 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 112 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

Боксплот по возросту и статусу употребления алкоголя

create_and_plot_boxplots(P_long, "_P", 3, "interaction(Health_state, Alcohol)", "Боксплоты для таксона (Статус употребления алкоголя + статус заболевания)")
## Warning: Removed 529 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 295 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 617 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 318 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 295 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

## Warning: Removed 112 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).

Посмотрим на данные здоровых людей и людей с СРК как на многомерный вектор по всем таксонам и группам

G - Genus

perform_permutation_test <- function(data, filter_pattern) {
  
  combined_bacteria_G <- data %>%
    select(Health_state, ends_with(filter_pattern))
  
  d <- dist(combined_bacteria_G) # euclidean distances between the rows
  fit <- cmdscale(d, eig=TRUE, k=2) # k is the number of dim
  
  df_mds <- data.frame(
    x = fit$points[,1],
    y = fit$points[,2]
  )  
  
  df_full <- cbind(df_mds, combined_info) %>% 
    mutate(Health_state_n = case_when(Health_state == "Health"  ~ 0,
                                      Health_state == "Disease" ~ 1))
  
  msd_plot <- ggplot(df_full, aes(x = x, y = y, color = Health_state)) +
    geom_point() +
    theme_bw() +
    ggtitle("Распределение вектора таксонов в зависимости от группы пациентов")
  
  print(msd_plot)
  
  print("Используя метод пермутаций проверим отличаются ли группы в зависимости от Health_state")
  
  adonis2(d ~ Health_state_n, data = df_full)
}

# Пример вызова функции с использованием другого фильтра
perform_permutation_test(combined_bacteria_clean, "_G")
## Warning in dist(combined_bacteria_G): в результате преобразования созданы NA

## [1] "Используя метод пермутаций проверим отличаются ли группы в зависимости от Health_state"
## Permutation test for adonis under reduced model
## Terms added sequentially (first to last)
## Permutation: free
## Number of permutations: 999
## 
## adonis2(formula = d ~ Health_state_n, data = df_full)
##                 Df SumOfSqs     R2      F Pr(>F)    
## Health_state_n   1     1046 0.0122 4.6817  0.001 ***
## Residual       379    84659 0.9878                  
## Total          380    85705 1.0000                  
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1

F - Family (семейство)

perform_permutation_test(combined_bacteria_clean, "_F")
## Warning in dist(combined_bacteria_G): в результате преобразования созданы NA

## [1] "Используя метод пермутаций проверим отличаются ли группы в зависимости от Health_state"
## Permutation test for adonis under reduced model
## Terms added sequentially (first to last)
## Permutation: free
## Number of permutations: 999
## 
## adonis2(formula = d ~ Health_state_n, data = df_full)
##                 Df SumOfSqs      R2      F Pr(>F)   
## Health_state_n   1     1919 0.01423 5.4706  0.002 **
## Residual       379   132940 0.98577                 
## Total          380   134859 1.00000                 
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1

C - Class (класс)

perform_permutation_test(combined_bacteria_clean, "_C")
## Warning in dist(combined_bacteria_G): в результате преобразования созданы NA

## [1] "Используя метод пермутаций проверим отличаются ли группы в зависимости от Health_state"
## Permutation test for adonis under reduced model
## Terms added sequentially (first to last)
## Permutation: free
## Number of permutations: 999
## 
## adonis2(formula = d ~ Health_state_n, data = df_full)
##                 Df SumOfSqs      R2      F Pr(>F)    
## Health_state_n   1    32982 0.12662 54.948  0.001 ***
## Residual       379   227490 0.87338                  
## Total          380   260472 1.00000                  
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1

O - Order (порядок)

perform_permutation_test(combined_bacteria_clean, "_O")
## Warning in dist(combined_bacteria_G): в результате преобразования созданы NA

## [1] "Используя метод пермутаций проверим отличаются ли группы в зависимости от Health_state"
## Permutation test for adonis under reduced model
## Terms added sequentially (first to last)
## Permutation: free
## Number of permutations: 999
## 
## adonis2(formula = d ~ Health_state_n, data = df_full)
##                 Df SumOfSqs      R2     F Pr(>F)    
## Health_state_n   1     6923 0.04767 18.97  0.001 ***
## Residual       379   138309 0.95233                 
## Total          380   145232 1.00000                 
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1

P - Phylum (тип)

perform_permutation_test(combined_bacteria_clean, "_P")
## Warning in dist(combined_bacteria_G): в результате преобразования созданы NA

## [1] "Используя метод пермутаций проверим отличаются ли группы в зависимости от Health_state"
## Permutation test for adonis under reduced model
## Terms added sequentially (first to last)
## Permutation: free
## Number of permutations: 999
## 
## adonis2(formula = d ~ Health_state_n, data = df_full)
##                 Df SumOfSqs      R2      F Pr(>F)    
## Health_state_n   1    32728 0.12502 54.155  0.001 ***
## Residual       379   229042 0.87498                  
## Total          380   261770 1.00000                  
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1