Project
Olga Potanina
2024-01-26
Предобработка данных
Чтение, слияние, редактирование исходных датасетов
- Загрузка датасетов с информацией о здоровых людях
(
info_healthy) и пациентах с СРК (info_ibs)
info_healthy <- read_xlsx ("data/raw/final_health_statistic.xlsx")
info_ibs <- read_xlsx ("data/raw/final_ibs_141_statistic.xlsx")- Сравнение переменных в
info_healthyиinfo_ibs
## Уникальные переменные в info_ibs:
## Main_Disease
## Weight_kg
## Height_cm
## BMI
## Diet_type
## Diet_duration
## Additive_usage
## Уникальные переменные в info_healthy:
## Drugscombined_info
- Объединение
info_healthyиinfo_ibsв единый датасетcombined_infoc редактированием содержимого
combined_info <- info_healthy %>%
bind_rows(info_ibs) %>%
mutate (
BMI_min = ifelse (is.na (BMI_min), round (Weight_min /(Height_max/100 * Height_max/100), 2), BMI_min),
BMI_max = ifelse (is.na (BMI_max), round (Weight_max /(Height_min/100 * Height_min/100), 2), BMI_max)
) %>%
unite("BMI_range", BMI_min, BMI_max, sep = "-", na.rm = TRUE) %>%
unite ("Age_range", Age_min, Age_max, sep = "-", na.rm = TRUE) %>%
mutate(
Age_range = case_when(
Age_range == "18-40" | Age_range == "23-28" | Age_range == "16-42" | Age_range == "21-43" ~ "16-43",
Age <= 43 ~ "16-43",
Age > 43 ~ "> 43",
TRUE ~ NA_character_), #удалена группа 28-54
research_ID = sub ("research_", "", research_ID),
research_ID = case_when(
research_ID == 0 ~ 1,
research_ID == 1 ~ 2,
research_ID == 2 ~ 3,
research_ID == 3 ~ 4,
research_ID == 4 ~ 5,
research_ID == 6 ~ 6,
research_ID == 7 ~ 7),
patient_ID = row_number(),
Sex = ifelse (Sex == "mixed", NA, Sex),
Smoking = sub ("never", "Never", Smoking),
Smoking = case_when(
Smoking == "No" ~ "No",
Smoking == "Never" ~ "No",
Smoking == "Rarely (a few times/month)" ~ "Yes", #5 чел.
Smoking == "Occasionally (1-2 times/week)" ~ "Yes", #3 чел.
Smoking == "Regularly (3-5 times/week)" ~ "Yes", #1 чел.
Smoking == "Daily" ~ "Yes"), #7 чел.
Alcohol = sub ("rarely", "Rarely", Alcohol),
Alcohol = ifelse(Alcohol == "Regularly (3-5 times/week)"|
Alcohol == "Daily", #3 чел.
"Regularly (3-7 times/week)", Alcohol),
Antibiotics_usage = case_when(
Antibiotics_usage == "Month" | Antibiotics_usage == ~ "3 months" |
Antibiotics_usage == "6 months" ~ "1-6 months",
#2 чел. больных Month, 0 чел. здоровых 3 months, 0 чел. здоровых для 6 months
Antibiotics_usage == "Year" | Antibiotics_usage == "Not use" ~
"12 months/Not use"), # 0 чел. из здоровых для 6-12 months, 0 чел. больных для Not use
Hygiene = case_when(
Hygiene == "Occasionally (1-2 times/week) cosmetics" ~ "Occasionally cosmetics (1-2 times/week)",
Hygiene == "Rarely (a few times/month) cosmetics" ~ "Rarely cosmetics (a few times/month)",
TRUE ~ Hygiene),
Hygiene = case_when(
Hygiene == "Daily cosmetics"|Hygiene == "Regularly cosmetics (3-5 times/week)" ~ "Regularly (3-7 times/week)", #0 чел. больных для 3-5 times/week
Hygiene == "Occasionally cosmetics (1-2 times/week)" | Hygiene == "Rarely cosmetics (a few times/month)" ~ "Occasionally (a few-8 times/month)",
#только 2 чел. больных для 1-2 times/week
Hygiene == "Never cosmetics" ~ "Never"),
Physical_activity = sub ("regularly", "Regularly", Smoking),
BMI = ifelse (is.na(Weight_kg), BMI, Weight_kg/ (Height_cm/100 * Height_cm/100)),
BMI_range = ifelse(BMI_range == "", NA, BMI_range),
BMI_category = case_when(
BMI_range == "18-25" ~ "normal/overweight",
BMI_range == "19.21-29.29" ~ "normal/overweight",
BMI_range == "20.6-29.6" ~ "normal/overweight",
BMI_range == "21.74-28.38" ~ "normal/overweight",
BMI_range == "18.5-30.8" ~ "normal/overweight", #немного больше 30
BMI < 18.5 ~ "underweight",
BMI >= 18.5 & BMI < 30 ~ "normal/overweight",
BMI >= 30 ~ "obese")
) %>%
rename ("Cosmetics" = Hygiene ) %>%
mutate_if (is.character, as.factor) %>%
select(-c(
Instrument, # unique (combined_info$Instrument) = "Illumina MiSeq"
Isolation_source, # unique (combined_info$Isolation_source) = "faeces"
Assay_type, # unique (combined_info$Assay_type) = "AMPLICON"
Target_gene, # unique (combined_info$Target_gene) = "16S"
Main_Disease, # unique (combined_info$Main_Disease) = NA (for healthy), 141 (for ibs)
Drugs, # unique (combined_info$Drugs) = NA
Social_status, # unique (combined_info$Social_status) = NA, urban
Weight_kg, Height_cm, Weight_min, Weight_max, Height_min, Height_max, BMI_range, #использованы для создания BMI_category, уменьшения количества NA в BMI
BMI, # NA у всех здоровых
Birth_Year, # имеются значения только в тех случаях, где возраст уже известен
Pets_type # только cat и NA
))
rm (info_healthy, info_ibs)
summary (combined_info)## research_ID patient_ID Seq_region Seq_date Health_state
## Min. :1.000 Min. : 1 V3-V4:106 Min. :2015 Disease:170
## 1st Qu.:3.000 1st Qu.: 96 V4 :229 1st Qu.:2017 Health :211
## Median :4.000 Median :191 V5-V6: 46 Median :2018
## Mean :4.194 Mean :191 Mean :2019
## 3rd Qu.:6.000 3rd Qu.:286 3rd Qu.:2021
## Max. :7.000 Max. :381 Max. :2023
##
## Age Age_range Sex Country
## Min. :19.00 > 43 : 44 female: 79 Spain :95
## 1st Qu.:27.25 16-43:242 male :112 Poland :70
## Median :34.00 NA's : 95 NA's :190 Belgium:46
## Mean :38.71 Germany:45
## 3rd Qu.:47.00 Italy :37
## Max. :76.00 Austria:28
## NA's :247 (Other):60
## Race Smoking Alcohol
## African American : 1 No :187 Never : 12
## Asian or Pacific Islander: 1 Yes : 16 Occasionally (1-2 times/week): 24
## Caucasian :116 NA's:178 Rarely (a few times/month) : 36
## Hispanic : 1 Regularly (3-7 times/week) : 15
## Other : 11 NA's :294
## NA's :251
##
## Antibiotics_usage Physical_activity Travel_period
## 1-6 months : 48 No :187 3 months: 18
## 12 months/Not use:129 Yes : 16 6 months: 10
## NA's :204 NA's:178 Month : 13
## Year : 45
## NA's :295
##
##
## Education_level Cosmetics
## Bachelor's level: 31 Never : 44
## Master's level : 28 Occasionally (a few-8 times/month): 17
## School Level : 25 Regularly (3-7 times/week) : 25
## NA's :297 NA's :295
##
##
##
## Sleep_duration Diet_type Diet_duration Additive_usage
## > 8 hours: 9 10.0: 13 3.0 : 8 22.0: 1
## 4-6 hours: 9 5.0 : 5 6.0 : 5 23.0: 1
## 6-7 hours: 31 NA's:363 NA's:368 4.0 : 9
## 7-8 hours: 38 NA's:370
## NA's :294
##
##
## BMI_category
## normal/overweight:287
## obese : 5
## underweight : 1
## NA's : 88
##
##
## - Таблица с количеством субъектов (n) в зависимости от исследования, даты, наличия/отсутствия СРК
combined_info %>%
select (research_ID, Country, Seq_date, Health_state) %>%
group_by(research_ID, Country, Seq_date, Health_state) %>%
summarise(n = n()) %>%
flextable() %>% theme_box() %>%
merge_v(c ("research_ID", "Country", "Seq_date", "Health_state")) %>%
align(align = "center", part = "all")research_ID | Country | Seq_date | Health_state | n |
|---|---|---|---|---|
1 | Belgium | 2,018 | Health | 46 |
2 | Italy | 36 | ||
3 | Poland | 2,023 | 70 | |
4 | Australia | 2,021 | 6 | |
Austria | 2,020 | 3 | ||
Germany | 33 | |||
2,021 | 12 | |||
Greece | 1 | |||
Hungary | 2 | |||
Ireland | Disease | 1 | ||
Israel | Health | 1 | ||
Italy | 1 | |||
Norway | 2,018 | Disease | 1 | |
UK | 7 | |||
2,020 | 2 | |||
2,021 | 3 | |||
USA | 2,018 | 6 | ||
2,020 | 1 | |||
2,021 | 5 | |||
2,022 | 1 | |||
2,023 | 1 | |||
5 | Austria | 2,017 | 25 | |
6 | Israel | 2,022 | 22 | |
7 | Spain | 2,015 | 95 |
tbl_summary of combined_info
library(gtsummary)
combined_info %>%
select(! c(patient_ID,
Diet_duration, Additive_usage, Diet_type #у всех здоровых данные переменные = NA
)) %>%
tbl_summary(digits = list(all_continuous() ~ c(0, 0),
all_categorical() ~ c(0, 0)),
by = Health_state) %>%
add_p()| Characteristic | Disease, N = 1701 | Health, N = 2111 | p-value2 |
|---|---|---|---|
| research_ID | <0.001 | ||
| 1 | 0 (0%) | 46 (22%) | |
| 2 | 0 (0%) | 36 (17%) | |
| 3 | 0 (0%) | 70 (33%) | |
| 4 | 28 (16%) | 59 (28%) | |
| 5 | 25 (15%) | 0 (0%) | |
| 6 | 22 (13%) | 0 (0%) | |
| 7 | 95 (56%) | 0 (0%) | |
| Seq_region | <0.001 | ||
| V3-V4 | 0 (0%) | 106 (50%) | |
| V4 | 170 (100%) | 59 (28%) | |
| V5-V6 | 0 (0%) | 46 (22%) | |
| Seq_date | <0.001 | ||
| 2015 | 95 (56%) | 0 (0%) | |
| 2017 | 25 (15%) | 0 (0%) | |
| 2018 | 14 (8%) | 82 (39%) | |
| 2020 | 3 (2%) | 36 (17%) | |
| 2021 | 9 (5%) | 23 (11%) | |
| 2022 | 23 (14%) | 0 (0%) | |
| 2023 | 1 (1%) | 70 (33%) | |
| Age | 42 (32, 50) | 28 (26, 37) | <0.001 |
| Unknown | 95 | 152 | |
| Age_range | <0.001 | ||
| > 43 | 34 (45%) | 10 (5%) | |
| 16-43 | 41 (55%) | 201 (95%) | |
| Unknown | 95 | 0 | |
| Sex | 0.15 | ||
| female | 35 (48%) | 44 (37%) | |
| male | 38 (52%) | 74 (63%) | |
| Unknown | 97 | 93 | |
| Country | |||
| Australia | 0 (0%) | 6 (3%) | |
| Austria | 25 (15%) | 3 (1%) | |
| Belgium | 0 (0%) | 46 (22%) | |
| Germany | 0 (0%) | 45 (21%) | |
| Greece | 0 (0%) | 1 (0%) | |
| Hungary | 0 (0%) | 2 (1%) | |
| Ireland | 1 (1%) | 0 (0%) | |
| Israel | 22 (13%) | 1 (0%) | |
| Italy | 0 (0%) | 37 (18%) | |
| Norway | 1 (1%) | 0 (0%) | |
| Poland | 0 (0%) | 70 (33%) | |
| Spain | 95 (56%) | 0 (0%) | |
| UK | 12 (7%) | 0 (0%) | |
| USA | 14 (8%) | 0 (0%) | |
| Race | 0.4 | ||
| African American | 0 (0%) | 1 (1%) | |
| Asian or Pacific Islander | 0 (0%) | 1 (1%) | |
| Caucasian | 27 (100%) | 89 (86%) | |
| Hispanic | 0 (0%) | 1 (1%) | |
| Other | 0 (0%) | 11 (11%) | |
| Unknown | 143 | 108 | |
| Smoking | 4 (14%) | 12 (7%) | 0.2 |
| Unknown | 142 | 36 | |
| Alcohol | 0.002 | ||
| Never | 4 (14%) | 8 (14%) | |
| Occasionally (1-2 times/week) | 4 (14%) | 20 (34%) | |
| Rarely (a few times/month) | 9 (32%) | 27 (46%) | |
| Regularly (3-7 times/week) | 11 (39%) | 4 (7%) | |
| Unknown | 142 | 152 | |
| Antibiotics_usage | 0.020 | ||
| 1-6 months | 2 (8%) | 46 (30%) | |
| 12 months/Not use | 23 (92%) | 106 (70%) | |
| Unknown | 145 | 59 | |
| Physical_activity | 4 (14%) | 12 (7%) | 0.2 |
| Unknown | 142 | 36 | |
| Travel_period | 0.066 | ||
| 3 months | 3 (11%) | 15 (26%) | |
| 6 months | 1 (4%) | 9 (16%) | |
| Month | 4 (14%) | 9 (16%) | |
| Year | 20 (71%) | 25 (43%) | |
| Unknown | 142 | 153 | |
| Education_level | <0.001 | ||
| Bachelor's level | 5 (18%) | 26 (46%) | |
| Master's level | 18 (64%) | 10 (18%) | |
| School Level | 5 (18%) | 20 (36%) | |
| Unknown | 142 | 155 | |
| Cosmetics | 0.6 | ||
| Never | 15 (56%) | 29 (49%) | |
| Occasionally (a few-8 times/month) | 6 (22%) | 11 (19%) | |
| Regularly (3-7 times/week) | 6 (22%) | 19 (32%) | |
| Unknown | 143 | 152 | |
| Sleep_duration | 0.2 | ||
| > 8 hours | 4 (14%) | 5 (8%) | |
| 4-6 hours | 4 (14%) | 5 (8%) | |
| 6-7 hours | 12 (43%) | 19 (32%) | |
| 7-8 hours | 8 (29%) | 30 (51%) | |
| Unknown | 142 | 152 | |
| BMI_category | 0.012 | ||
| normal/overweight | 135 (96%) | 152 (100%) | |
| obese | 5 (4%) | 0 (0%) | |
| underweight | 1 (1%) | 0 (0%) | |
| Unknown | 29 | 59 | |
| 1 n (%); Median (IQR) | |||
| 2 Pearson’s Chi-squared test; Wilcoxon rank sum test; Fisher’s exact test | |||
- Загрузка датасетов с данными о микробиоме здоровых людей
(
bacteria_healthy) и пациентов с СРК (bacteria_ibs) и их объединение вcombined_bacteria
bacteria_healthy <- read_csv("data/raw/final_bacteria_health.csv")
bacteria_ibs <- read_csv("data/raw/final_bacteria_ibs_141.csv")
combined_bacteria <- bacteria_healthy %>%
bind_rows (bacteria_ibs) %>%
mutate(patient_ID = row_number())
rm (bacteria_healthy, bacteria_ibs)- Объединение
combined_bacteriaиcombined_infoвdata_wide
data_wide <- combined_info %>%
left_join (combined_bacteria)
Оценка доли NA и нулевых значений
- Оценка доли NA в переменных
data_wide
data_wide %>%
select (where (function(x) sum (is.na(x))/ nrow(data_wide) * 100 > 0)) %>%
sapply (function(x) sum (is.na(x))/ nrow(data_wide) * 100) %>% round(1) %>%
as.data.frame() %>%
rename(NA_percentage = ".") %>%
mutate (
"Number of people with known data" = round (nrow(data_wide) - NA_percentage/100 * nrow(data_wide)),
NA_percentage = paste (NA_percentage, "%", sep = " ")
) %>%
arrange(desc (NA_percentage)) %>%
rownames_to_column() %>%
as_tibble() %>% flextable()rowname | NA_percentage | Number of people with known data |
|---|---|---|
Additive_usage | 97.1 % | 11 |
Diet_duration | 96.6 % | 13 |
Diet_type | 95.3 % | 18 |
Education_level | 78 % | 84 |
Travel_period | 77.4 % | 86 |
Cosmetics | 77.4 % | 86 |
Alcohol | 77.2 % | 87 |
Sleep_duration | 77.2 % | 87 |
Race | 65.9 % | 130 |
Age | 64.8 % | 134 |
Antibiotics_usage | 53.5 % | 177 |
Sex | 49.9 % | 191 |
Smoking | 46.7 % | 203 |
Physical_activity | 46.7 % | 203 |
Age_range | 24.9 % | 286 |
BMI_category | 23.1 % | 293 |
- Рассчитаем процент не NA и не 0 данных по колонкам широкого формата
# Устанавливаем порог процента
threshold_percent <- 95
# Функция для вычисления процента записей, не равных NA и не равных 0, для каждой колонки
calculate_percentage <- function(col) {
sum(!is.na(col) & col != 0) / length(col) * 100
}
# Применяем функцию к каждой колонке в датасете
percentage_non_zero_non_na <- sapply(data_wide[, -1], calculate_percentage)
# Создаем датафрейм с результатами
result_df_sort <- data.frame(
column = names(percentage_non_zero_non_na),
percentage = round(100 - percentage_non_zero_non_na, 2) # percentage означает пропущенные или 0 значения
) %>%
arrange(desc(percentage))
# Отфильтровываем колонки, у которых процент записей менее threshold_percent%
filtered_columns <- result_df_sort[result_df_sort$percentage < threshold_percent, ]
# Сохраним датасет в excel для дальнейшего анализа
write.xlsx(filtered_columns,
file = "data/originals/percentage_by_vars.xlsx")
# Перезапись data_wide с выбором колонок с процентом NA/0 менее threshold_percent
data_wide <- data_wide %>%
select (row.names(filtered_columns), research_ID)
rm (calculate_percentage, result_df_sort)- Рассчитаем процент не NA и не 0 данных по форматированному
patient_ID
# Устанавливаем порог процента
threshold_percent <- 95
# Рассчитываем процент значений, не являющихся NA и не равных 0, для каждого пациента
percentage_non_zero_non_na <- rowMeans(!is.na(data_wide) & data_wide != 0, na.rm = TRUE) * 100
# Создаем датафрейм с результатами
result_df_sort <- data.frame(
patient_id = data_wide$patient_ID,
percentage = round(100 - percentage_non_zero_non_na, 2) # percentage означает пропущенные или 0 значения
) %>% arrange(desc(percentage))
# Отфильтровываем пациентов, у которых процент значений менее threshold_percent%
filtered_patients <- result_df_sort[result_df_sort$percentage < threshold_percent, ]
# Сохраним датасет в excel для дальнейшего анализа
write.xlsx(filtered_patients,
file = "data/originals/percentage_by_patient.xlsx")
# Перезапись data_wide с удалением строк с процентом NA/0 более threshold_percent
data_wide <- data_wide %>%
slice (filtered_patients$patient_id) #при threshold_percent = 95%, изменения data_wide не происходит, так как нет пациентов с процентом NA/0 более 95%
rm (percentage_non_zero_non_na, result_df_sort)- Удалениe из
data_wideколонок и строк с процентом NA/0 более threshold_percent
data_wide <- data_wide %>%
select (patient_ID, any_of (colnames(combined_info)), everything()) %>%
arrange(patient_ID)
Поиск “таксонов одного исследования”
Среднее содержание G_таксонов, которые были обнаружены только в одном исследовании
G_only_one <- data_wide %>%
select (research_ID, ends_with("_G")) %>%
add_column(n = 1) %>% #колонка для дальнейшего подсчёта количества субъектов в исследовании
group_by(research_ID) %>%
summarise_each (sum) %>%
select (research_ID, n, where (function(x) sum (x!=0) == 1)) %>% #выбираем таксоны, которые обнаружены только в одном исследовании
mutate (across(-c(1:2),
function(x) x/n))## Warning: `summarise_each_()` was deprecated in dplyr 0.7.0.
## ℹ Please use `across()` instead.
## ℹ The deprecated feature was likely used in the dplyr package.
## Please report the issue at <https://github.com/tidyverse/dplyr/issues>.
## This warning is displayed once every 8 hours.
## Call `lifecycle::last_lifecycle_warnings()` to see where this warning was
## generated.G_only_one## # A tibble: 7 × 15
## research_ID n CM1G08_G Cladosporium_G Lentimonas_G Micromonospora_G
## <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
## 1 1 46 0 0 0.0500 0.0331
## 2 2 36 0 0.00811 0 0
## 3 3 70 0 0 0 0
## 4 4 87 0.00550 0 0 0
## 5 5 25 0 0 0 0
## 6 6 22 0 0 0 0
## 7 7 95 0 0 0 0
## # ℹ 9 more variables: Pseudosphingobacterium_G <dbl>,
## # `Schizothrix LEGE 07164_G` <dbl>, Talaromyces_G <dbl>,
## # `Rs-D38 termite group_G` <dbl>, Kabatiella_G <dbl>,
## # `Anaerolineaceae UCG-001_G` <dbl>, Iamia_G <dbl>, Thiohalocapsa_G <dbl>,
## # Ellin517_G <dbl>- Определение процента людей, у которых данные таксоны не обнаружены ()
Среднее содержание F_таксонов, которые были обнаружены только в одном исследовании
data_wide %>%
select (research_ID, ends_with("_F")) %>%
add_column(n = 1) %>% #колонка для дальнейшего подсчёта количества субъектов в исследовании
group_by(research_ID) %>%
summarise_each (sum) %>%
select (research_ID, n, where (function(x) sum (x!=0) == 1)) %>% #выбираем таксоны, которые обнаружены только в одном исследовании
mutate (across(-c(1:2),
function(x) x/n))## # A tibble: 7 × 9
## research_ID n Didymellaceae_F Cladosporiaceae_F Trichocomaceae_F
## <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
## 1 1 46 0 0 0
## 2 2 36 0.0213 0.00811 0.0143
## 3 3 70 0 0 0
## 4 4 87 0 0 0
## 5 5 25 0 0 0
## 6 6 22 0 0 0
## 7 7 95 0 0 0
## # ℹ 4 more variables: `type III_F` <dbl>, `09D2Z48_F` <dbl>,
## # Aureobasidiaceae_F <dbl>, Iamiaceae_F <dbl>- Определение процента людей, у которых данные таксоны не обнаружены ()
Среднее содержание O_таксонов, которые были обнаружены только в одном исследовании
data_wide %>%
select (research_ID, ends_with("_O")) %>%
add_column(n = 1) %>% #колонка для дальнейшего подсчёта количества субъектов в исследовании
group_by(research_ID) %>%
summarise_each (sum) %>%
select (research_ID, n, where (function(x) sum (x!=0) == 1)) %>% #выбираем таксоны, которые обнаружены только в одном исследовании
mutate (across(-c(1:2),
function(x) x/n))## # A tibble: 7 × 12
## research_ID n Hypocreales_O Pleosporales_O `Candidatus Abawacabacteria_O`
## <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
## 1 1 46 0 0 0.00892
## 2 2 36 0.0622 0.0367 0
## 3 3 70 0 0 0
## 4 4 87 0 0 0
## 5 5 25 0 0 0
## 6 6 22 0 0 0
## 7 7 95 0 0 0
## # ℹ 7 more variables: `Candidatus Peregrinibacteria_O` <dbl>,
## # Capnodiales_O <dbl>, `Candidatus Terrybacteria_O` <dbl>,
## # Eurotiales_O <dbl>, Dothideales_O <dbl>, eub62A3_O <dbl>,
## # `LD1-PA32_O` <dbl>- Определение процента людей, у которых данные таксоны не обнаружены ()
Среднее содержание C_таксонов, которые были обнаружены только в одном исследовании
data_wide %>%
select (research_ID, ends_with("_C")) %>%
add_column(n = 1) %>% #колонка для дальнейшего подсчёта количества субъектов в исследовании
group_by(research_ID) %>%
summarise_each (sum) %>%
select (research_ID, n, where (function(x) sum (x!=0) == 1)) %>% #выбираем таксоны, которые обнаружены только в одном исследовании
mutate (across(-c(1:2),
function(x) x/n))## # A tibble: 7 × 5
## research_ID n WWE3_C Eurotiomycetes_C Dothideomycetes_C
## <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
## 1 1 46 0 0 0
## 2 2 36 0 0.0229 0.102
## 3 3 70 0 0 0
## 4 4 87 0.0135 0 0
## 5 5 25 0 0 0
## 6 6 22 0 0 0
## 7 7 95 0 0 0- Определение процента людей, у которых данные таксоны не обнаружены ()
Среднее содержание P_таксонов, которые были обнаружены только в одном исследовании
P_таксонов, которые были обнаружены только в одном исследовании, нет
## data_wide (not batched) `
data_wide <- data_wide %>%
select (!colnames (G_only_one) [- c (1,2)]) #удаление G_таксонов, которые обнаружены только в одном исследовании (все они в этом исследовании встречались редко - до 25% людей)
data_wide_not_batched <- data_wide
write_rds(data_wide,
file = "data/originals/data_wide_not_batched.rds")Кластеризация
Кластеризация родов (G-таксонов)
AGNES (agglomerative clustering)
clusters_number <- 4 #количество кластеров
library(cluster)
library(factoextra)
G_scaled <- data_wide %>%
mutate(patient_ID = paste0("patient_", patient_ID)) %>%
column_to_rownames("patient_ID") %>%
select (ends_with("_G")) %>% #выбираем только G-таксоны
scale () #нормируем данные
agnes <- G_scaled %>%
dist (method = "euclidean") %>% #cоздаём матрицу дистанций
as.matrix() %>%
agnes( #выбираем Agglomerative clustering (иерархическая кластеризация снизу вверх)
diss = TRUE, #на вход подана dissimilarity matrix
method = "ward")
fviz_dend(agnes,
k = clusters_number,
rect = TRUE,
k_colors = "jco",
show_labels = TRUE,
label_cols = ifelse (data_wide[agnes$order,]$Health_state == "Health", "green", "red"),#цвет лейблов определяется по Health_state
cex = 0.2, #размер шрифта лейблов
main = "Дендрограмма кластеризации субъектов по количеству G-таксонов",
ylab = "Высота")
- Сравнение полученных кластеров по основным переменным
data_wide %>%
add_column("Cluster" = cutree(agnes, k = clusters_number)) %>% # Создаём новый столбец - вектор принадлежности к кластерам
select(any_of(colnames (combined_info)), Cluster, - patient_ID) %>%
tbl_summary(digits = list(all_continuous() ~ c(0, 0),
all_categorical() ~ c(0, 0)),
by = Cluster) %>%
add_p()| Characteristic | 1, N = 461 | 2, N = 961 | 3, N = 2141 | 4, N = 251 | p-value2 |
|---|---|---|---|---|---|
| research_ID | |||||
| 1 | 46 (100%) | 0 (0%) | 0 (0%) | 0 (0%) | |
| 2 | 0 (0%) | 31 (32%) | 5 (2%) | 0 (0%) | |
| 3 | 0 (0%) | 65 (68%) | 5 (2%) | 0 (0%) | |
| 4 | 0 (0%) | 0 (0%) | 87 (41%) | 0 (0%) | |
| 5 | 0 (0%) | 0 (0%) | 0 (0%) | 25 (100%) | |
| 6 | 0 (0%) | 0 (0%) | 22 (10%) | 0 (0%) | |
| 7 | 0 (0%) | 0 (0%) | 95 (44%) | 0 (0%) | |
| Seq_region | |||||
| V3-V4 | 0 (0%) | 96 (100%) | 10 (5%) | 0 (0%) | |
| V4 | 0 (0%) | 0 (0%) | 204 (95%) | 25 (100%) | |
| V5-V6 | 46 (100%) | 0 (0%) | 0 (0%) | 0 (0%) | |
| Seq_date | |||||
| 2015 | 0 (0%) | 0 (0%) | 95 (44%) | 0 (0%) | |
| 2017 | 0 (0%) | 0 (0%) | 0 (0%) | 25 (100%) | |
| 2018 | 46 (100%) | 31 (32%) | 19 (9%) | 0 (0%) | |
| 2020 | 0 (0%) | 0 (0%) | 39 (18%) | 0 (0%) | |
| 2021 | 0 (0%) | 0 (0%) | 32 (15%) | 0 (0%) | |
| 2022 | 0 (0%) | 0 (0%) | 23 (11%) | 0 (0%) | |
| 2023 | 0 (0%) | 65 (68%) | 6 (3%) | 0 (0%) | |
| Health_state | <0.001 | ||||
| Disease | 0 (0%) | 0 (0%) | 145 (68%) | 25 (100%) | |
| Health | 46 (100%) | 96 (100%) | 69 (32%) | 0 (0%) | |
| Age | NA (NA, NA) | NA (NA, NA) | 33 (27, 47) | 39 (28, 49) | 0.5 |
| Unknown | 46 | 96 | 105 | 0 | |
| Age_range | <0.001 | ||||
| > 43 | 0 (0%) | 0 (0%) | 34 (29%) | 10 (40%) | |
| 16-43 | 46 (100%) | 96 (100%) | 85 (71%) | 15 (60%) | |
| Unknown | 0 | 0 | 95 | 0 | |
| Sex | 0.042 | ||||
| female | 0 (NA%) | 38 (40%) | 25 (36%) | 16 (64%) | |
| male | 0 (NA%) | 58 (60%) | 45 (64%) | 9 (36%) | |
| Unknown | 46 | 0 | 144 | 0 | |
| Country | |||||
| Australia | 0 (0%) | 0 (0%) | 6 (3%) | 0 (0%) | |
| Austria | 0 (0%) | 0 (0%) | 3 (1%) | 25 (100%) | |
| Belgium | 46 (100%) | 0 (0%) | 0 (0%) | 0 (0%) | |
| Germany | 0 (0%) | 0 (0%) | 45 (21%) | 0 (0%) | |
| Greece | 0 (0%) | 0 (0%) | 1 (0%) | 0 (0%) | |
| Hungary | 0 (0%) | 0 (0%) | 2 (1%) | 0 (0%) | |
| Ireland | 0 (0%) | 0 (0%) | 1 (0%) | 0 (0%) | |
| Israel | 0 (0%) | 0 (0%) | 23 (11%) | 0 (0%) | |
| Italy | 0 (0%) | 31 (32%) | 6 (3%) | 0 (0%) | |
| Norway | 0 (0%) | 0 (0%) | 1 (0%) | 0 (0%) | |
| Poland | 0 (0%) | 65 (68%) | 5 (2%) | 0 (0%) | |
| Spain | 0 (0%) | 0 (0%) | 95 (44%) | 0 (0%) | |
| UK | 0 (0%) | 0 (0%) | 12 (6%) | 0 (0%) | |
| USA | 0 (0%) | 0 (0%) | 14 (7%) | 0 (0%) | |
| Race | 0.015 | ||||
| African American | 0 (0%) | 0 (NA%) | 1 (1%) | 0 (NA%) | |
| Asian or Pacific Islander | 0 (0%) | 0 (NA%) | 1 (1%) | 0 (NA%) | |
| Caucasian | 46 (100%) | 0 (NA%) | 70 (83%) | 0 (NA%) | |
| Hispanic | 0 (0%) | 0 (NA%) | 1 (1%) | 0 (NA%) | |
| Other | 0 (0%) | 0 (NA%) | 11 (13%) | 0 (NA%) | |
| Unknown | 0 | 96 | 130 | 25 | |
| Smoking | 0 (0%) | 0 (0%) | 16 (17%) | 0 (NA%) | <0.001 |
| Unknown | 0 | 31 | 122 | 25 | |
| Alcohol | >0.9 | ||||
| Never | 0 (NA%) | 0 (NA%) | 12 (14%) | 0 (NA%) | |
| Occasionally (1-2 times/week) | 0 (NA%) | 0 (NA%) | 24 (28%) | 0 (NA%) | |
| Rarely (a few times/month) | 0 (NA%) | 0 (NA%) | 36 (41%) | 0 (NA%) | |
| Regularly (3-7 times/week) | 0 (NA%) | 0 (NA%) | 15 (17%) | 0 (NA%) | |
| Unknown | 46 | 96 | 127 | 25 | |
| Antibiotics_usage | <0.001 | ||||
| 1-6 months | 46 (100%) | 0 (0%) | 2 (6%) | 0 (NA%) | |
| 12 months/Not use | 0 (0%) | 96 (100%) | 33 (94%) | 0 (NA%) | |
| Unknown | 0 | 0 | 179 | 25 | |
| Physical_activity | 0 (0%) | 0 (0%) | 16 (17%) | 0 (NA%) | <0.001 |
| Unknown | 0 | 31 | 122 | 25 | |
| Travel_period | >0.9 | ||||
| 3 months | 0 (NA%) | 0 (NA%) | 18 (21%) | 0 (NA%) | |
| 6 months | 0 (NA%) | 0 (NA%) | 10 (12%) | 0 (NA%) | |
| Month | 0 (NA%) | 0 (NA%) | 13 (15%) | 0 (NA%) | |
| Year | 0 (NA%) | 0 (NA%) | 45 (52%) | 0 (NA%) | |
| Unknown | 46 | 96 | 128 | 25 | |
| Education_level | >0.9 | ||||
| Bachelor's level | 0 (NA%) | 0 (NA%) | 31 (37%) | 0 (NA%) | |
| Master's level | 0 (NA%) | 0 (NA%) | 28 (33%) | 0 (NA%) | |
| School Level | 0 (NA%) | 0 (NA%) | 25 (30%) | 0 (NA%) | |
| Unknown | 46 | 96 | 130 | 25 | |
| Cosmetics | >0.9 | ||||
| Never | 0 (NA%) | 0 (NA%) | 44 (51%) | 0 (NA%) | |
| Occasionally (a few-8 times/month) | 0 (NA%) | 0 (NA%) | 17 (20%) | 0 (NA%) | |
| Regularly (3-7 times/week) | 0 (NA%) | 0 (NA%) | 25 (29%) | 0 (NA%) | |
| Unknown | 46 | 96 | 128 | 25 | |
| Sleep_duration | >0.9 | ||||
| > 8 hours | 0 (NA%) | 0 (NA%) | 9 (10%) | 0 (NA%) | |
| 4-6 hours | 0 (NA%) | 0 (NA%) | 9 (10%) | 0 (NA%) | |
| 6-7 hours | 0 (NA%) | 0 (NA%) | 31 (36%) | 0 (NA%) | |
| 7-8 hours | 0 (NA%) | 0 (NA%) | 38 (44%) | 0 (NA%) | |
| Unknown | 46 | 96 | 127 | 25 | |
| BMI_category | 0.2 | ||||
| normal/overweight | 46 (100%) | 96 (100%) | 145 (96%) | 0 (NA%) | |
| obese | 0 (0%) | 0 (0%) | 5 (3%) | 0 (NA%) | |
| underweight | 0 (0%) | 0 (0%) | 1 (1%) | 0 (NA%) | |
| Unknown | 0 | 0 | 63 | 25 | |
| 1 n (%); Median (IQR) | |||||
| 2 Pearson’s Chi-squared test; Kruskal-Wallis rank sum test; Fisher’s exact test | |||||
kMeans
kmeans <- G_scaled %>%
kmeans(centers = clusters_number, # Кол-во кластеров
iter.max = 20, # Максимальное кол-во итераций
nstart = 35) # Кол-во центройдов в начале
fviz_cluster(kmeans,data = G_scaled,
ellipse = FALSE,
show.clust.cent = FALSE,
geom = "point",
main = "Кластеризация субъектов по содержанию G-таксонов до batch-коррекции")
Определение оптимального количества кластеров
- методом локтя
G_scaled %>%
fviz_nbclust(FUN = hcut, method = "wss") 
- с помощью коэффициента силуэта
G_scaled %>%
fviz_nbclust(FUN = hcut, method = "silhouette") 
DBSCAN
- определением оптимального размера радиуса (eps)
G_scaled %>%
dbscan::kNNdistplot(minPts = 20) # мин. количество субъектов в кластере
abline(h=37, col = "red", lty = 2)
G_scaled %>%
dbscan::dbscan(eps = 37, # радиус
minPts = 20) %>% # мин. количество субъектов в кластере
fviz_cluster(
data = G_scaled,
stand = TRUE,
ellipse = FALSE,
show.clust.cent = FALSE,
geom = "point",
palette = "jco",
ggtheme = theme_classic())
AGNES (несходство Брея - Кертиса)
- с матрицей-дистанций с показателями несходства Брея — Кертиса
agnes2 <- data_wide %>%
column_to_rownames("patient_ID") %>%
select (ends_with("_G")) %>%
vegdist(method = "bray") %>% #cоздаём матрицу дистанций, рассчитывая показатель несходства Брея — Кертиса (Bray-Curtis dissimilarity, 0 - полное совпадение пациентов по составу микробиоты, 1 - полное несовпадение
as.matrix() %>%
agnes( #выбираем Agglomerative clustering (иерархическая кластеризация снизу вверх)
diss = TRUE, #на вход подана dissimilarity matrix
method = "ward")
fviz_dend(agnes2,
cex = 0.2, k = 3,
rect = TRUE,
k_colors = "jco",
color_labels_by_k = FALSE,
label_cols = ifelse (data_wide[agnes2$order,]$Health_state == "Health", "green", "red"),
main = "Дендрограмма кластеризации субъектов по количеству G-таксонов",
ylab = "Высота",)
- Сравнение полученных кластеров по основным переменным
fisher.test.simulate.p.values <- function(data, variable, by, ...) {
result <- list()
test_results <- stats::fisher.test(data[[variable]], data[[by]], simulate.p.value = TRUE)
result$p <- test_results$p.value
result$test <- test_results$method
result
}
data_wide %>%
add_column("Cluster" = cutree(agnes2, k = 3)) %>% # Создаём новый столбец - вектор принадлежности к кластерам
select(any_of(colnames (combined_info)), Cluster, - patient_ID) %>%
tbl_summary(digits = list(all_continuous() ~ c(0, 0),
all_categorical() ~ c(0, 0)),
by = Cluster) %>%
add_p(test = list(all_categorical() ~ "fisher.test.simulate.p.values")) # this applies the custom test to all categorical variables| Characteristic | 1, N = 821 | 2, N = 2531 | 3, N = 461 | p-value2 |
|---|---|---|---|---|
| research_ID | <0.001 | |||
| 1 | 46 (56%) | 0 (0%) | 0 (0%) | |
| 2 | 0 (0%) | 33 (13%) | 3 (7%) | |
| 3 | 2 (2%) | 59 (23%) | 9 (20%) | |
| 4 | 16 (20%) | 62 (25%) | 9 (20%) | |
| 5 | 13 (16%) | 12 (5%) | 0 (0%) | |
| 6 | 2 (2%) | 16 (6%) | 4 (9%) | |
| 7 | 3 (4%) | 71 (28%) | 21 (46%) | |
| Seq_region | <0.001 | |||
| V3-V4 | 2 (2%) | 92 (36%) | 12 (26%) | |
| V4 | 34 (41%) | 161 (64%) | 34 (74%) | |
| V5-V6 | 46 (56%) | 0 (0%) | 0 (0%) | |
| Seq_date | <0.001 | |||
| 2015 | 3 (4%) | 71 (28%) | 21 (46%) | |
| 2017 | 13 (16%) | 12 (5%) | 0 (0%) | |
| 2018 | 47 (57%) | 44 (17%) | 5 (11%) | |
| 2020 | 10 (12%) | 24 (9%) | 5 (11%) | |
| 2021 | 5 (6%) | 25 (10%) | 2 (4%) | |
| 2022 | 2 (2%) | 17 (7%) | 4 (9%) | |
| 2023 | 2 (2%) | 60 (24%) | 9 (20%) | |
| Health_state | <0.001 | |||
| Disease | 20 (24%) | 121 (48%) | 29 (63%) | |
| Health | 62 (76%) | 132 (52%) | 17 (37%) | |
| Age | 31 (26, 41) | 39 (28, 49) | 32 (29, 38) | 0.11 |
| Unknown | 51 | 163 | 33 | |
| Age_range | 0.11 | |||
| > 43 | 7 (9%) | 34 (19%) | 3 (12%) | |
| 16-43 | 72 (91%) | 148 (81%) | 22 (88%) | |
| Unknown | 3 | 71 | 21 | |
| Sex | >0.9 | |||
| female | 8 (40%) | 64 (42%) | 7 (37%) | |
| male | 12 (60%) | 88 (58%) | 12 (63%) | |
| Unknown | 62 | 101 | 27 | |
| Country | <0.001 | |||
| Australia | 1 (1%) | 5 (2%) | 0 (0%) | |
| Austria | 14 (17%) | 14 (6%) | 0 (0%) | |
| Belgium | 46 (56%) | 0 (0%) | 0 (0%) | |
| Germany | 12 (15%) | 28 (11%) | 5 (11%) | |
| Greece | 0 (0%) | 1 (0%) | 0 (0%) | |
| Hungary | 0 (0%) | 2 (1%) | 0 (0%) | |
| Ireland | 0 (0%) | 1 (0%) | 0 (0%) | |
| Israel | 2 (2%) | 17 (7%) | 4 (9%) | |
| Italy | 0 (0%) | 34 (13%) | 3 (7%) | |
| Norway | 0 (0%) | 1 (0%) | 0 (0%) | |
| Poland | 2 (2%) | 59 (23%) | 9 (20%) | |
| Spain | 3 (4%) | 71 (28%) | 21 (46%) | |
| UK | 1 (1%) | 7 (3%) | 4 (9%) | |
| USA | 1 (1%) | 13 (5%) | 0 (0%) | |
| Race | 0.2 | |||
| African American | 0 (0%) | 1 (2%) | 0 (0%) | |
| Asian or Pacific Islander | 0 (0%) | 0 (0%) | 1 (11%) | |
| Caucasian | 55 (92%) | 54 (89%) | 7 (78%) | |
| Hispanic | 1 (2%) | 0 (0%) | 0 (0%) | |
| Other | 4 (7%) | 6 (10%) | 1 (11%) | |
| Unknown | 22 | 192 | 37 | |
| Smoking | 3 (5%) | 12 (10%) | 1 (6%) | 0.5 |
| Unknown | 18 | 132 | 28 | |
| Alcohol | 0.6 | |||
| Never | 1 (6%) | 10 (16%) | 1 (11%) | |
| Occasionally (1-2 times/week) | 6 (38%) | 17 (27%) | 1 (11%) | |
| Rarely (a few times/month) | 8 (50%) | 24 (39%) | 4 (44%) | |
| Regularly (3-7 times/week) | 1 (6%) | 11 (18%) | 3 (33%) | |
| Unknown | 66 | 191 | 37 | |
| Antibiotics_usage | <0.001 | |||
| 1-6 months | 47 (94%) | 1 (1%) | 0 (0%) | |
| 12 months/Not use | 3 (6%) | 110 (99%) | 16 (100%) | |
| Unknown | 32 | 142 | 30 | |
| Physical_activity | 3 (5%) | 12 (10%) | 1 (6%) | 0.5 |
| Unknown | 18 | 132 | 28 | |
| Travel_period | 0.3 | |||
| 3 months | 2 (13%) | 15 (25%) | 1 (11%) | |
| 6 months | 1 (6%) | 8 (13%) | 1 (11%) | |
| Month | 6 (38%) | 6 (10%) | 1 (11%) | |
| Year | 7 (44%) | 32 (52%) | 6 (67%) | |
| Unknown | 66 | 192 | 37 | |
| Education_level | 0.2 | |||
| Bachelor's level | 10 (63%) | 18 (31%) | 3 (33%) | |
| Master's level | 3 (19%) | 21 (36%) | 4 (44%) | |
| School Level | 3 (19%) | 20 (34%) | 2 (22%) | |
| Unknown | 66 | 194 | 37 | |
| Cosmetics | 0.5 | |||
| Never | 7 (44%) | 33 (53%) | 4 (50%) | |
| Occasionally (a few-8 times/month) | 4 (25%) | 10 (16%) | 3 (38%) | |
| Regularly (3-7 times/week) | 5 (31%) | 19 (31%) | 1 (13%) | |
| Unknown | 66 | 191 | 38 | |
| Sleep_duration | 0.7 | |||
| > 8 hours | 1 (6%) | 7 (11%) | 1 (11%) | |
| 4-6 hours | 2 (13%) | 6 (10%) | 1 (11%) | |
| 6-7 hours | 7 (44%) | 23 (37%) | 1 (11%) | |
| 7-8 hours | 6 (38%) | 26 (42%) | 6 (67%) | |
| Unknown | 66 | 191 | 37 | |
| BMI_category | 0.15 | |||
| normal/overweight | 55 (100%) | 193 (97%) | 39 (98%) | |
| obese | 0 (0%) | 5 (3%) | 0 (0%) | |
| underweight | 0 (0%) | 0 (0%) | 1 (3%) | |
| Unknown | 27 | 55 | 6 | |
| 1 n (%); Median (IQR) | ||||
| 2 Fisher’s Exact Test for Count Data with simulated p-value (based on 2000 replicates); Kruskal-Wallis rank sum test | ||||
Кластеризация семейств (F-таксонов)
AGNES (agglomerative clustering)
clusters_number <- 2 #количество кластеров
F_scaled <- data_wide %>%
mutate(patient_ID = paste0("patient_", patient_ID)) %>%
column_to_rownames("patient_ID") %>%
select (ends_with("_F")) %>% #выбираем только G-таксоны
scale () #нормируем данные
agnes <- F_scaled %>%
dist (method = "euclidean") %>% #cоздаём матрицу дистанций
as.matrix() %>%
agnes(
diss = TRUE, #на вход подана dissimilarity matrix
method = "ward")
fviz_dend(agnes,
k = clusters_number,
rect = TRUE,
k_colors = "jco",
show_labels = TRUE,
label_cols = ifelse (data_wide[agnes$order,]$Health_state == "Health", "green", "red"),#цвет лейблов определяется по Health_state
cex = 0.2, #размер шрифта лейблов
main = "Кластеризация субъектов по содержанию G-таксонов до коррекции batch-эффекта",
ylab = "Высота")
- Сравнение полученных кластеров по основным переменным
data_wide %>%
add_column("Cluster" = cutree(agnes, k = clusters_number)) %>% #Создаём новый столбец - вектор принадлежности к кластерам
select(any_of(colnames (combined_info)), Cluster, - patient_ID) %>%
tbl_summary(digits = list(all_continuous() ~ c(0, 0),
all_categorical() ~ c(0, 0)),
by = Cluster) %>%
add_p()| Characteristic | 1, N = 461 | 2, N = 3351 | p-value2 |
|---|---|---|---|
| research_ID | <0.001 | ||
| 1 | 46 (100%) | 0 (0%) | |
| 2 | 0 (0%) | 36 (11%) | |
| 3 | 0 (0%) | 70 (21%) | |
| 4 | 0 (0%) | 87 (26%) | |
| 5 | 0 (0%) | 25 (7%) | |
| 6 | 0 (0%) | 22 (7%) | |
| 7 | 0 (0%) | 95 (28%) | |
| Seq_region | <0.001 | ||
| V3-V4 | 0 (0%) | 106 (32%) | |
| V4 | 0 (0%) | 229 (68%) | |
| V5-V6 | 46 (100%) | 0 (0%) | |
| Seq_date | |||
| 2015 | 0 (0%) | 95 (28%) | |
| 2017 | 0 (0%) | 25 (7%) | |
| 2018 | 46 (100%) | 50 (15%) | |
| 2020 | 0 (0%) | 39 (12%) | |
| 2021 | 0 (0%) | 32 (10%) | |
| 2022 | 0 (0%) | 23 (7%) | |
| 2023 | 0 (0%) | 71 (21%) | |
| Health_state | <0.001 | ||
| Disease | 0 (0%) | 170 (51%) | |
| Health | 46 (100%) | 165 (49%) | |
| Age | NA (NA, NA) | 34 (27, 47) | |
| Unknown | 46 | 201 | |
| Age_range | 0.002 | ||
| > 43 | 0 (0%) | 44 (18%) | |
| 16-43 | 46 (100%) | 196 (82%) | |
| Unknown | 0 | 95 | |
| Sex | >0.9 | ||
| female | 0 (NA%) | 79 (41%) | |
| male | 0 (NA%) | 112 (59%) | |
| Unknown | 46 | 144 | |
| Country | <0.001 | ||
| Australia | 0 (0%) | 6 (2%) | |
| Austria | 0 (0%) | 28 (8%) | |
| Belgium | 46 (100%) | 0 (0%) | |
| Germany | 0 (0%) | 45 (13%) | |
| Greece | 0 (0%) | 1 (0%) | |
| Hungary | 0 (0%) | 2 (1%) | |
| Ireland | 0 (0%) | 1 (0%) | |
| Israel | 0 (0%) | 23 (7%) | |
| Italy | 0 (0%) | 37 (11%) | |
| Norway | 0 (0%) | 1 (0%) | |
| Poland | 0 (0%) | 70 (21%) | |
| Spain | 0 (0%) | 95 (28%) | |
| UK | 0 (0%) | 12 (4%) | |
| USA | 0 (0%) | 14 (4%) | |
| Race | 0.015 | ||
| African American | 0 (0%) | 1 (1%) | |
| Asian or Pacific Islander | 0 (0%) | 1 (1%) | |
| Caucasian | 46 (100%) | 70 (83%) | |
| Hispanic | 0 (0%) | 1 (1%) | |
| Other | 0 (0%) | 11 (13%) | |
| Unknown | 0 | 251 | |
| Smoking | 0 (0%) | 16 (10%) | 0.025 |
| Unknown | 0 | 178 | |
| Alcohol | >0.9 | ||
| Never | 0 (NA%) | 12 (14%) | |
| Occasionally (1-2 times/week) | 0 (NA%) | 24 (28%) | |
| Rarely (a few times/month) | 0 (NA%) | 36 (41%) | |
| Regularly (3-7 times/week) | 0 (NA%) | 15 (17%) | |
| Unknown | 46 | 248 | |
| Antibiotics_usage | <0.001 | ||
| 1-6 months | 46 (100%) | 2 (2%) | |
| 12 months/Not use | 0 (0%) | 129 (98%) | |
| Unknown | 0 | 204 | |
| Physical_activity | 0 (0%) | 16 (10%) | 0.025 |
| Unknown | 0 | 178 | |
| Travel_period | >0.9 | ||
| 3 months | 0 (NA%) | 18 (21%) | |
| 6 months | 0 (NA%) | 10 (12%) | |
| Month | 0 (NA%) | 13 (15%) | |
| Year | 0 (NA%) | 45 (52%) | |
| Unknown | 46 | 249 | |
| Education_level | >0.9 | ||
| Bachelor's level | 0 (NA%) | 31 (37%) | |
| Master's level | 0 (NA%) | 28 (33%) | |
| School Level | 0 (NA%) | 25 (30%) | |
| Unknown | 46 | 251 | |
| Cosmetics | >0.9 | ||
| Never | 0 (NA%) | 44 (51%) | |
| Occasionally (a few-8 times/month) | 0 (NA%) | 17 (20%) | |
| Regularly (3-7 times/week) | 0 (NA%) | 25 (29%) | |
| Unknown | 46 | 249 | |
| Sleep_duration | >0.9 | ||
| > 8 hours | 0 (NA%) | 9 (10%) | |
| 4-6 hours | 0 (NA%) | 9 (10%) | |
| 6-7 hours | 0 (NA%) | 31 (36%) | |
| 7-8 hours | 0 (NA%) | 38 (44%) | |
| Unknown | 46 | 248 | |
| BMI_category | >0.9 | ||
| normal/overweight | 46 (100%) | 241 (98%) | |
| obese | 0 (0%) | 5 (2%) | |
| underweight | 0 (0%) | 1 (0%) | |
| Unknown | 0 | 88 | |
| 1 n (%); Median (IQR) | |||
| 2 Fisher’s exact test; Pearson’s Chi-squared test | |||
kMeans
kmeans <- F_scaled %>%
kmeans(centers = clusters_number, # Кол-во кластеров
iter.max = 20, # Максимальное кол-во итераций
nstart = 35) # Кол-во центройдов в начале
fviz_cluster(kmeans,data = F_scaled,
ellipse = FALSE,
show.clust.cent = FALSE,
geom = "point",
main = "Кластеризация субъектов по F_таксонам")
DBSCAN
- определением оптимального размера радиуса (eps)
F_scaled %>%
dbscan::kNNdistplot(minPts = 20) # мин. количество субъектов в кластере
abline(h=25, col = "red", lty = 2)
F_scaled %>%
dbscan::dbscan(eps = 25, # радиус
minPts = 20) %>% # мин. количество субъектов в кластере
fviz_cluster(
data = F_scaled,
stand = TRUE,
ellipse = FALSE,
show.clust.cent = FALSE,
geom = "point",
palette = "jco",
ggtheme = theme_classic())
Кластеризация порядков (O-таксонов)
AGNES (agglomerative clustering)
clusters_number <- 2 #количество кластеров
O_scaled <- data_wide %>%
mutate(patient_ID = paste0("patient_", patient_ID)) %>%
column_to_rownames("patient_ID") %>%
select (ends_with("_O")) %>% #выбираем только G-таксоны
scale () #нормируем данные
agnes <- O_scaled %>%
dist (method = "euclidean") %>% #cоздаём матрицу дистанций
as.matrix() %>%
agnes(
diss = TRUE, #на вход подана dissimilarity matrix
method = "ward")
fviz_dend(agnes,
k = clusters_number,
rect = TRUE,
k_colors = "jco",
show_labels = TRUE,
label_cols = ifelse (data_wide[agnes$order,]$Health_state == "Health", "green", "red"),#цвет лейблов определяется по Health_state
cex = 0.2, #размер шрифта лейблов
main = "Дендрограмма кластеризации субъектов по количеству G-таксонов",
ylab = "Высота")
- Сравнение полученных кластеров по основным переменным
data_wide %>%
add_column("Cluster" = cutree(agnes, k = clusters_number)) %>% #Создаём новый столбец - вектор принадлежности к кластерам
select(any_of(colnames (combined_info)), Cluster, - patient_ID) %>%
tbl_summary(digits = list(all_continuous() ~ c(0, 0),
all_categorical() ~ c(0, 0)),
by = Cluster) %>%
add_p()| Characteristic | 1, N = 461 | 2, N = 3351 | p-value2 |
|---|---|---|---|
| research_ID | <0.001 | ||
| 1 | 46 (100%) | 0 (0%) | |
| 2 | 0 (0%) | 36 (11%) | |
| 3 | 0 (0%) | 70 (21%) | |
| 4 | 0 (0%) | 87 (26%) | |
| 5 | 0 (0%) | 25 (7%) | |
| 6 | 0 (0%) | 22 (7%) | |
| 7 | 0 (0%) | 95 (28%) | |
| Seq_region | <0.001 | ||
| V3-V4 | 0 (0%) | 106 (32%) | |
| V4 | 0 (0%) | 229 (68%) | |
| V5-V6 | 46 (100%) | 0 (0%) | |
| Seq_date | |||
| 2015 | 0 (0%) | 95 (28%) | |
| 2017 | 0 (0%) | 25 (7%) | |
| 2018 | 46 (100%) | 50 (15%) | |
| 2020 | 0 (0%) | 39 (12%) | |
| 2021 | 0 (0%) | 32 (10%) | |
| 2022 | 0 (0%) | 23 (7%) | |
| 2023 | 0 (0%) | 71 (21%) | |
| Health_state | <0.001 | ||
| Disease | 0 (0%) | 170 (51%) | |
| Health | 46 (100%) | 165 (49%) | |
| Age | NA (NA, NA) | 34 (27, 47) | |
| Unknown | 46 | 201 | |
| Age_range | 0.002 | ||
| > 43 | 0 (0%) | 44 (18%) | |
| 16-43 | 46 (100%) | 196 (82%) | |
| Unknown | 0 | 95 | |
| Sex | >0.9 | ||
| female | 0 (NA%) | 79 (41%) | |
| male | 0 (NA%) | 112 (59%) | |
| Unknown | 46 | 144 | |
| Country | <0.001 | ||
| Australia | 0 (0%) | 6 (2%) | |
| Austria | 0 (0%) | 28 (8%) | |
| Belgium | 46 (100%) | 0 (0%) | |
| Germany | 0 (0%) | 45 (13%) | |
| Greece | 0 (0%) | 1 (0%) | |
| Hungary | 0 (0%) | 2 (1%) | |
| Ireland | 0 (0%) | 1 (0%) | |
| Israel | 0 (0%) | 23 (7%) | |
| Italy | 0 (0%) | 37 (11%) | |
| Norway | 0 (0%) | 1 (0%) | |
| Poland | 0 (0%) | 70 (21%) | |
| Spain | 0 (0%) | 95 (28%) | |
| UK | 0 (0%) | 12 (4%) | |
| USA | 0 (0%) | 14 (4%) | |
| Race | 0.015 | ||
| African American | 0 (0%) | 1 (1%) | |
| Asian or Pacific Islander | 0 (0%) | 1 (1%) | |
| Caucasian | 46 (100%) | 70 (83%) | |
| Hispanic | 0 (0%) | 1 (1%) | |
| Other | 0 (0%) | 11 (13%) | |
| Unknown | 0 | 251 | |
| Smoking | 0 (0%) | 16 (10%) | 0.025 |
| Unknown | 0 | 178 | |
| Alcohol | >0.9 | ||
| Never | 0 (NA%) | 12 (14%) | |
| Occasionally (1-2 times/week) | 0 (NA%) | 24 (28%) | |
| Rarely (a few times/month) | 0 (NA%) | 36 (41%) | |
| Regularly (3-7 times/week) | 0 (NA%) | 15 (17%) | |
| Unknown | 46 | 248 | |
| Antibiotics_usage | <0.001 | ||
| 1-6 months | 46 (100%) | 2 (2%) | |
| 12 months/Not use | 0 (0%) | 129 (98%) | |
| Unknown | 0 | 204 | |
| Physical_activity | 0 (0%) | 16 (10%) | 0.025 |
| Unknown | 0 | 178 | |
| Travel_period | >0.9 | ||
| 3 months | 0 (NA%) | 18 (21%) | |
| 6 months | 0 (NA%) | 10 (12%) | |
| Month | 0 (NA%) | 13 (15%) | |
| Year | 0 (NA%) | 45 (52%) | |
| Unknown | 46 | 249 | |
| Education_level | >0.9 | ||
| Bachelor's level | 0 (NA%) | 31 (37%) | |
| Master's level | 0 (NA%) | 28 (33%) | |
| School Level | 0 (NA%) | 25 (30%) | |
| Unknown | 46 | 251 | |
| Cosmetics | >0.9 | ||
| Never | 0 (NA%) | 44 (51%) | |
| Occasionally (a few-8 times/month) | 0 (NA%) | 17 (20%) | |
| Regularly (3-7 times/week) | 0 (NA%) | 25 (29%) | |
| Unknown | 46 | 249 | |
| Sleep_duration | >0.9 | ||
| > 8 hours | 0 (NA%) | 9 (10%) | |
| 4-6 hours | 0 (NA%) | 9 (10%) | |
| 6-7 hours | 0 (NA%) | 31 (36%) | |
| 7-8 hours | 0 (NA%) | 38 (44%) | |
| Unknown | 46 | 248 | |
| BMI_category | >0.9 | ||
| normal/overweight | 46 (100%) | 241 (98%) | |
| obese | 0 (0%) | 5 (2%) | |
| underweight | 0 (0%) | 1 (0%) | |
| Unknown | 0 | 88 | |
| 1 n (%); Median (IQR) | |||
| 2 Fisher’s exact test; Pearson’s Chi-squared test | |||
kMeans
kmeans <- O_scaled %>%
kmeans(centers = clusters_number, # Кол-во кластеров
iter.max = 20, # Максимальное кол-во итераций
nstart = 35) # Кол-во центройдов в начале
fviz_cluster(kmeans,data = O_scaled,
ellipse = FALSE,
show.clust.cent = FALSE,
geom = "point",
main = "Кластеризация субъектов по O_таксонам")
DBSCAN
- определением оптимального размера радиуса (eps)
O_scaled %>%
dbscan::kNNdistplot(minPts = 20) # мин. количество субъектов в кластере
abline(h=18, col = "red", lty = 2)
O_scaled %>%
dbscan::dbscan(eps = 18, #радиус
minPts = 20) %>% #мин. количество субъектов в кластере
fviz_cluster(
data = O_scaled,
stand = TRUE,
ellipse = FALSE,
show.clust.cent = FALSE,
geom = "point",
palette = "jco",
ggtheme = theme_classic())
Batch-effects correction
- использовался пакет MBECS, пошаговое описание действий доступно по ссылке https://github.com/rmolbrich/MBECS
Подготовлен Preliminary report (data/originals/).
- сравнение batch-эффектов от research_ID и Seq_region по их процентному вкладу в вариацию данных
mbecModelVariance(
input.obj=mbec.obj,
model.vars=c('research_ID', 'Health_state'),
method="pvca",type="otu") %>%
mbecPVCAStatsPlot() 
mbecModelVariance(
input.obj=mbec.obj,
model.vars=c('Seq_region', 'Health_state'),
method="pvca",type="otu") %>%
mbecPVCAStatsPlot()
коррекция batch-эффекта (research_ID)
Извлечение скорректированных данных
library (datawizard)
#Retrieve corrrected data
ps.cor.bat <- mbecGetPhyloseq(mbec.obj,
type="cor",
label="bat") #which type of data to add (correction)
combined_bacteria_batched <- ps.cor.bat@otu_table %>%
as.data.frame() %>%
data_rotate (rownames = "patient_ID") %>%
mutate (patient_ID = sub ("S", "", patient_ID),
patient_ID = as.numeric(patient_ID))
data_wide_batched <- combined_info %>%
select (where (function(x)
sum (!is.na(x))/ nrow(.) * 100 >= 5)) %>% #выбор переменных, у которых менее 95% NA
left_join(combined_bacteria_batched)
rm (combined_bacteria_batched)####Principal Component Analysis
- Principal Component Analysis до коррекции batch-эффекта (research_ID)
plot <- mbecPCA(input.obj=mbec.obj,
model.vars=c('research_ID', 'Health_state'),
type="otu", pca.axes=c(1,2), return.data = FALSE) 
ggsave("data/pictures/PCA_befor_batching.jpeg", plot = plot)- Principal Component Analysis после коррекции batch-эффекта (research_ID)
plot <- mbecPCA(input.obj=mbec.obj,
model.vars=c('research_ID', 'Health_state'),
type="cor", label = "bat",
pca.axes=c(1,2), return.data = FALSE) 
ggsave("data/pictures/PCA_after_batching.jpeg", plot = plot)####Heatmap
- Heatmap содержания 10-ти наиболее вариабельных таксонов до коррекции batch-эффекта (research_ID)
mbecHeat(input.obj=mbec.obj, method = "TOP", n = 10,
model.vars=c('research_ID', 'Health_state'),
center = TRUE, scale = TRUE,
type="otu",
return.data = FALSE)
- Heatmap содержания 10-ти наиболее вариабельных таксонов после коррекции batch-эффекта (research_ID)
mbecHeat(input.obj=mbec.obj, method = "TOP", n = 10,
model.vars=c('research_ID', 'Health_state'),
center = TRUE, scale = TRUE,
type="cor", label = "bat",
return.data = FALSE)
Кластеризация родов (G-таксонов) после коррекции batch-эффекта (research_ID)
AGNES (agglomerative clustering)
clusters_number <- 4 #количество кластеров
library(cluster)
library(factoextra)
G_scaled <- data_wide_batched %>%
mutate(patient_ID = paste0("patient_", patient_ID)) %>%
column_to_rownames("patient_ID") %>%
select (ends_with("_G")) %>% #выбираем только G-таксоны
scale () #нормируем данные
agnes <- G_scaled %>%
dist (method = "euclidean") %>% #cоздаём матрицу дистанций
as.matrix() %>%
agnes( #выбираем Agglomerative clustering (иерархическая кластеризация снизу вверх)
diss = TRUE, #на вход подана dissimilarity matrix
method = "ward")
fviz_dend(agnes,
k = clusters_number,
rect = TRUE,
k_colors = "jco",
show_labels = TRUE,
label_cols = ifelse (data_wide_batched[agnes$order,]$Health_state == "Health", "green", "red"),#цвет лейблов определяется по Health_state
cex = 0.2, #размер шрифта лейблов
main = "Кластеризация субъектов по содержанию G-таксонов после batch-коррекции",
ylab = "Высота")
- Сравнение полученных кластеров по основным переменным
data_wide %>%
add_column("Cluster" = cutree(agnes, k = clusters_number)) %>% # Создаём новый столбец - вектор принадлежности к кластерам
select(any_of(colnames (combined_info)), Cluster, - patient_ID) %>%
tbl_summary(digits = list(all_continuous() ~ c(0, 0),
all_categorical() ~ c(0, 0)),
by = Cluster) %>%
add_p()| Characteristic | 1, N = 461 | 2, N = 2881 | 3, N = 221 | 4, N = 251 | p-value2 |
|---|---|---|---|---|---|
| research_ID | |||||
| 1 | 46 (100%) | 0 (0%) | 0 (0%) | 0 (0%) | |
| 2 | 0 (0%) | 35 (12%) | 1 (5%) | 0 (0%) | |
| 3 | 0 (0%) | 66 (23%) | 4 (18%) | 0 (0%) | |
| 4 | 0 (0%) | 69 (24%) | 16 (73%) | 2 (8%) | |
| 5 | 0 (0%) | 2 (1%) | 0 (0%) | 23 (92%) | |
| 6 | 0 (0%) | 22 (8%) | 0 (0%) | 0 (0%) | |
| 7 | 0 (0%) | 94 (33%) | 1 (5%) | 0 (0%) | |
| Seq_region | |||||
| V3-V4 | 0 (0%) | 101 (35%) | 5 (23%) | 0 (0%) | |
| V4 | 0 (0%) | 187 (65%) | 17 (77%) | 25 (100%) | |
| V5-V6 | 46 (100%) | 0 (0%) | 0 (0%) | 0 (0%) | |
| Seq_date | |||||
| 2015 | 0 (0%) | 94 (33%) | 1 (5%) | 0 (0%) | |
| 2017 | 0 (0%) | 2 (1%) | 0 (0%) | 23 (92%) | |
| 2018 | 46 (100%) | 43 (15%) | 6 (27%) | 1 (4%) | |
| 2020 | 0 (0%) | 36 (13%) | 2 (9%) | 1 (4%) | |
| 2021 | 0 (0%) | 23 (8%) | 9 (41%) | 0 (0%) | |
| 2022 | 0 (0%) | 23 (8%) | 0 (0%) | 0 (0%) | |
| 2023 | 0 (0%) | 67 (23%) | 4 (18%) | 0 (0%) | |
| Health_state | <0.001 | ||||
| Disease | 0 (0%) | 137 (48%) | 9 (41%) | 24 (96%) | |
| Health | 46 (100%) | 151 (52%) | 13 (59%) | 1 (4%) | |
| Age | NA (NA, NA) | 32 (27, 46) | 48 (42, 51) | 34 (28, 48) | 0.010 |
| Unknown | 46 | 195 | 6 | 0 | |
| Age_range | <0.001 | ||||
| > 43 | 0 (0%) | 24 (12%) | 11 (52%) | 9 (36%) | |
| 16-43 | 46 (100%) | 170 (88%) | 10 (48%) | 16 (64%) | |
| Unknown | 0 | 94 | 1 | 0 | |
| Sex | 0.11 | ||||
| female | 0 (NA%) | 60 (41%) | 5 (26%) | 14 (58%) | |
| male | 0 (NA%) | 88 (59%) | 14 (74%) | 10 (42%) | |
| Unknown | 46 | 140 | 3 | 1 | |
| Country | |||||
| Australia | 0 (0%) | 3 (1%) | 3 (14%) | 0 (0%) | |
| Austria | 0 (0%) | 2 (1%) | 2 (9%) | 24 (96%) | |
| Belgium | 46 (100%) | 0 (0%) | 0 (0%) | 0 (0%) | |
| Germany | 0 (0%) | 45 (16%) | 0 (0%) | 0 (0%) | |
| Greece | 0 (0%) | 1 (0%) | 0 (0%) | 0 (0%) | |
| Hungary | 0 (0%) | 0 (0%) | 2 (9%) | 0 (0%) | |
| Ireland | 0 (0%) | 0 (0%) | 1 (5%) | 0 (0%) | |
| Israel | 0 (0%) | 23 (8%) | 0 (0%) | 0 (0%) | |
| Italy | 0 (0%) | 35 (12%) | 2 (9%) | 0 (0%) | |
| Norway | 0 (0%) | 1 (0%) | 0 (0%) | 0 (0%) | |
| Poland | 0 (0%) | 66 (23%) | 4 (18%) | 0 (0%) | |
| Spain | 0 (0%) | 94 (33%) | 1 (5%) | 0 (0%) | |
| UK | 0 (0%) | 8 (3%) | 3 (14%) | 1 (4%) | |
| USA | 0 (0%) | 10 (3%) | 4 (18%) | 0 (0%) | |
| Race | 0.029 | ||||
| African American | 0 (0%) | 1 (2%) | 0 (0%) | 0 (0%) | |
| Asian or Pacific Islander | 0 (0%) | 1 (2%) | 0 (0%) | 0 (0%) | |
| Caucasian | 46 (100%) | 52 (79%) | 16 (100%) | 2 (100%) | |
| Hispanic | 0 (0%) | 1 (2%) | 0 (0%) | 0 (0%) | |
| Other | 0 (0%) | 11 (17%) | 0 (0%) | 0 (0%) | |
| Unknown | 0 | 222 | 6 | 23 | |
| Smoking | 0 (0%) | 15 (11%) | 1 (5%) | 0 (0%) | 0.060 |
| Unknown | 0 | 153 | 2 | 23 | |
| Alcohol | >0.9 | ||||
| Never | 0 (NA%) | 10 (14%) | 2 (13%) | 0 (0%) | |
| Occasionally (1-2 times/week) | 0 (NA%) | 20 (29%) | 4 (25%) | 0 (0%) | |
| Rarely (a few times/month) | 0 (NA%) | 26 (38%) | 8 (50%) | 2 (100%) | |
| Regularly (3-7 times/week) | 0 (NA%) | 13 (19%) | 2 (13%) | 0 (0%) | |
| Unknown | 46 | 219 | 6 | 23 | |
| Antibiotics_usage | <0.001 | ||||
| 1-6 months | 46 (100%) | 1 (1%) | 1 (9%) | 0 (0%) | |
| 12 months/Not use | 0 (0%) | 118 (99%) | 10 (91%) | 1 (100%) | |
| Unknown | 0 | 169 | 11 | 24 | |
| Physical_activity | 0 (0%) | 15 (11%) | 1 (5%) | 0 (0%) | 0.060 |
| Unknown | 0 | 153 | 2 | 23 | |
| Travel_period | 0.016 | ||||
| 3 months | 0 (NA%) | 13 (19%) | 5 (33%) | 0 (0%) | |
| 6 months | 0 (NA%) | 10 (14%) | 0 (0%) | 0 (0%) | |
| Month | 0 (NA%) | 7 (10%) | 4 (27%) | 2 (100%) | |
| Year | 0 (NA%) | 39 (57%) | 6 (40%) | 0 (0%) | |
| Unknown | 46 | 219 | 7 | 23 | |
| Education_level | 0.070 | ||||
| Bachelor's level | 0 (NA%) | 26 (39%) | 5 (33%) | 0 (0%) | |
| Master's level | 0 (NA%) | 18 (27%) | 8 (53%) | 2 (100%) | |
| School Level | 0 (NA%) | 23 (34%) | 2 (13%) | 0 (0%) | |
| Unknown | 46 | 221 | 7 | 23 | |
| Cosmetics | 0.4 | ||||
| Never | 0 (NA%) | 32 (47%) | 11 (69%) | 1 (50%) | |
| Occasionally (a few-8 times/month) | 0 (NA%) | 16 (24%) | 1 (6%) | 0 (0%) | |
| Regularly (3-7 times/week) | 0 (NA%) | 20 (29%) | 4 (25%) | 1 (50%) | |
| Unknown | 46 | 220 | 6 | 23 | |
| Sleep_duration | 0.14 | ||||
| > 8 hours | 0 (NA%) | 7 (10%) | 2 (13%) | 0 (0%) | |
| 4-6 hours | 0 (NA%) | 5 (7%) | 4 (25%) | 0 (0%) | |
| 6-7 hours | 0 (NA%) | 23 (33%) | 7 (44%) | 1 (50%) | |
| 7-8 hours | 0 (NA%) | 34 (49%) | 3 (19%) | 1 (50%) | |
| Unknown | 46 | 219 | 6 | 23 | |
| BMI_category | 0.063 | ||||
| normal/overweight | 46 (100%) | 229 (98%) | 11 (85%) | 1 (100%) | |
| obese | 0 (0%) | 3 (1%) | 2 (15%) | 0 (0%) | |
| underweight | 0 (0%) | 1 (0%) | 0 (0%) | 0 (0%) | |
| Unknown | 0 | 55 | 9 | 24 | |
| 1 n (%); Median (IQR) | |||||
| 2 Pearson’s Chi-squared test; Kruskal-Wallis rank sum test; Fisher’s exact test | |||||
kMeans
kmeans <- G_scaled %>%
kmeans(centers = clusters_number, # Кол-во кластеров
iter.max = 20, # Максимальное кол-во итераций
nstart = 35) # Кол-во центройдов в начале
fviz_cluster(kmeans,data = G_scaled,
ellipse = FALSE,
show.clust.cent = FALSE,
geom = "point",
main = "Кластеризация субъектов по содержанию G-таксонов до коррекции batch-эффекта")
AGNES (несходство Брея — Кертиса)
- с матрицей-дистанций с показателями несходства Брея — Кертиса
agnes2 <- data_wide_batched %>%
column_to_rownames("patient_ID") %>%
select (ends_with("_G")) %>%
vegdist(method = "bray") %>% #cоздаём матрицу дистанций, рассчитывая показатель несходства Брея — Кертиса (Bray-Curtis dissimilarity, 0 - полное совпадение пациентов по составу микробиоты, 1 - полное несовпадение
as.matrix() %>%
agnes( #выбираем Agglomerative clustering (иерархическая кластеризация снизу вверх)
diss = TRUE, #на вход подана dissimilarity matrix
method = "ward")
fviz_dend(agnes2,
cex = 0.2, k = clusters_number,
rect = TRUE,
k_colors = "jco",
color_labels_by_k = FALSE,
label_cols = case_when (data_wide_batched[agnes2$order,]$Age_range == "> 43" ~ "red",
data_wide_batched[agnes2$order,]$Age_range == "16-43" ~ "green",
TRUE ~ "white"),
main = "Дендрограмма кластеризации субъектов по количеству G-таксонов",
ylab = "Высота")
- Сравнение полученных кластеров по основным переменным
data_wide %>%
add_column("Cluster" = cutree(agnes2, k = clusters_number)) %>% # Создаём новый столбец - вектор принадлежности к кластерам
select(any_of(colnames (combined_info)), Cluster, - patient_ID) %>%
tbl_summary(digits = list(all_continuous() ~ c(0, 0),
all_categorical() ~ c(0, 0)),
by = Cluster) %>%
add_p()| Characteristic | 1, N = 2091 | 2, N = 401 | 3, N = 581 | 4, N = 741 | p-value2 |
|---|---|---|---|---|---|
| research_ID | |||||
| 1 | 25 (12%) | 3 (8%) | 11 (19%) | 7 (9%) | |
| 2 | 20 (10%) | 1 (3%) | 3 (5%) | 12 (16%) | |
| 3 | 43 (21%) | 3 (8%) | 11 (19%) | 13 (18%) | |
| 4 | 47 (22%) | 16 (40%) | 9 (16%) | 15 (20%) | |
| 5 | 12 (6%) | 9 (23%) | 2 (3%) | 2 (3%) | |
| 6 | 13 (6%) | 3 (8%) | 4 (7%) | 2 (3%) | |
| 7 | 49 (23%) | 5 (13%) | 18 (31%) | 23 (31%) | |
| Seq_region | |||||
| V3-V4 | 63 (30%) | 4 (10%) | 14 (24%) | 25 (34%) | |
| V4 | 121 (58%) | 33 (83%) | 33 (57%) | 42 (57%) | |
| V5-V6 | 25 (12%) | 3 (8%) | 11 (19%) | 7 (9%) | |
| Seq_date | |||||
| 2015 | 49 (23%) | 5 (13%) | 18 (31%) | 23 (31%) | |
| 2017 | 12 (6%) | 9 (23%) | 2 (3%) | 2 (3%) | |
| 2018 | 50 (24%) | 8 (20%) | 16 (28%) | 22 (30%) | |
| 2020 | 24 (11%) | 3 (8%) | 5 (9%) | 7 (9%) | |
| 2021 | 16 (8%) | 9 (23%) | 2 (3%) | 5 (7%) | |
| 2022 | 14 (7%) | 3 (8%) | 4 (7%) | 2 (3%) | |
| 2023 | 44 (21%) | 3 (8%) | 11 (19%) | 13 (18%) | |
| Health_state | 0.3 | ||||
| Disease | 88 (42%) | 23 (58%) | 28 (48%) | 31 (42%) | |
| Health | 121 (58%) | 17 (43%) | 30 (52%) | 43 (58%) | |
| Age | 35 (28, 47) | 38 (31, 49) | 32 (28, 41) | 28 (26, 46) | 0.5 |
| Unknown | 137 | 12 | 43 | 55 | |
| Age_range | 0.002 | ||||
| > 43 | 21 (13%) | 13 (37%) | 4 (10%) | 6 (12%) | |
| 16-43 | 139 (87%) | 22 (63%) | 36 (90%) | 45 (88%) | |
| Unknown | 49 | 5 | 18 | 23 | |
| Sex | 0.015 | ||||
| female | 54 (51%) | 9 (31%) | 8 (35%) | 8 (24%) | |
| male | 51 (49%) | 20 (69%) | 15 (65%) | 26 (76%) | |
| Unknown | 104 | 11 | 35 | 40 | |
| Country | |||||
| Australia | 2 (1%) | 3 (8%) | 0 (0%) | 1 (1%) | |
| Austria | 12 (6%) | 12 (30%) | 2 (3%) | 2 (3%) | |
| Belgium | 25 (12%) | 3 (8%) | 11 (19%) | 7 (9%) | |
| Germany | 29 (14%) | 1 (3%) | 5 (9%) | 10 (14%) | |
| Greece | 1 (0%) | 0 (0%) | 0 (0%) | 0 (0%) | |
| Hungary | 0 (0%) | 2 (5%) | 0 (0%) | 0 (0%) | |
| Ireland | 1 (0%) | 0 (0%) | 0 (0%) | 0 (0%) | |
| Israel | 14 (7%) | 3 (8%) | 4 (7%) | 2 (3%) | |
| Italy | 20 (10%) | 2 (5%) | 3 (5%) | 12 (16%) | |
| Norway | 0 (0%) | 0 (0%) | 0 (0%) | 1 (1%) | |
| Poland | 43 (21%) | 3 (8%) | 11 (19%) | 13 (18%) | |
| Spain | 49 (23%) | 5 (13%) | 18 (31%) | 23 (31%) | |
| UK | 2 (1%) | 4 (10%) | 4 (7%) | 2 (3%) | |
| USA | 11 (5%) | 2 (5%) | 0 (0%) | 1 (1%) | |
| Race | 0.6 | ||||
| African American | 1 (1%) | 0 (0%) | 0 (0%) | 0 (0%) | |
| Asian or Pacific Islander | 0 (0%) | 0 (0%) | 1 (5%) | 0 (0%) | |
| Caucasian | 60 (87%) | 19 (100%) | 18 (90%) | 19 (86%) | |
| Hispanic | 1 (1%) | 0 (0%) | 0 (0%) | 0 (0%) | |
| Other | 7 (10%) | 0 (0%) | 1 (5%) | 3 (14%) | |
| Unknown | 140 | 21 | 38 | 52 | |
| Smoking | 8 (7%) | 2 (9%) | 1 (3%) | 5 (14%) | 0.4 |
| Unknown | 94 | 18 | 27 | 39 | |
| Alcohol | 0.9 | ||||
| Never | 8 (17%) | 2 (13%) | 1 (11%) | 1 (7%) | |
| Occasionally (1-2 times/week) | 15 (32%) | 3 (19%) | 1 (11%) | 5 (33%) | |
| Rarely (a few times/month) | 17 (36%) | 8 (50%) | 4 (44%) | 7 (47%) | |
| Regularly (3-7 times/week) | 7 (15%) | 3 (19%) | 3 (33%) | 2 (13%) | |
| Unknown | 162 | 24 | 49 | 59 | |
| Antibiotics_usage | 0.2 | ||||
| 1-6 months | 25 (25%) | 5 (42%) | 11 (38%) | 7 (19%) | |
| 12 months/Not use | 75 (75%) | 7 (58%) | 18 (62%) | 29 (81%) | |
| Unknown | 109 | 28 | 29 | 38 | |
| Physical_activity | 8 (7%) | 2 (9%) | 1 (3%) | 5 (14%) | 0.4 |
| Unknown | 94 | 18 | 27 | 39 | |
| Travel_period | 0.2 | ||||
| 3 months | 11 (23%) | 4 (27%) | 1 (11%) | 2 (13%) | |
| 6 months | 5 (11%) | 0 (0%) | 1 (11%) | 4 (27%) | |
| Month | 7 (15%) | 5 (33%) | 1 (11%) | 0 (0%) | |
| Year | 24 (51%) | 6 (40%) | 6 (67%) | 9 (60%) | |
| Unknown | 162 | 25 | 49 | 59 | |
| Education_level | 0.8 | ||||
| Bachelor's level | 18 (38%) | 5 (33%) | 3 (33%) | 5 (38%) | |
| Master's level | 14 (30%) | 7 (47%) | 4 (44%) | 3 (23%) | |
| School Level | 15 (32%) | 3 (20%) | 2 (22%) | 5 (38%) | |
| Unknown | 162 | 25 | 49 | 61 | |
| Cosmetics | 0.10 | ||||
| Never | 19 (40%) | 12 (75%) | 4 (50%) | 9 (60%) | |
| Occasionally (a few-8 times/month) | 11 (23%) | 0 (0%) | 3 (38%) | 3 (20%) | |
| Regularly (3-7 times/week) | 17 (36%) | 4 (25%) | 1 (13%) | 3 (20%) | |
| Unknown | 162 | 24 | 50 | 59 | |
| Sleep_duration | 0.092 | ||||
| > 8 hours | 4 (9%) | 2 (13%) | 1 (11%) | 2 (13%) | |
| 4-6 hours | 2 (4%) | 5 (31%) | 1 (11%) | 1 (7%) | |
| 6-7 hours | 19 (40%) | 6 (38%) | 1 (11%) | 5 (33%) | |
| 7-8 hours | 22 (47%) | 3 (19%) | 6 (67%) | 7 (47%) | |
| Unknown | 162 | 24 | 49 | 59 | |
| BMI_category | 0.5 | ||||
| normal/overweight | 158 (98%) | 20 (100%) | 49 (98%) | 60 (98%) | |
| obese | 4 (2%) | 0 (0%) | 0 (0%) | 1 (2%) | |
| underweight | 0 (0%) | 0 (0%) | 1 (2%) | 0 (0%) | |
| Unknown | 47 | 20 | 8 | 13 | |
| 1 n (%); Median (IQR) | |||||
| 2 Pearson’s Chi-squared test; Kruskal-Wallis rank sum test; Fisher’s exact test | |||||
data_wide (batched)
`
data_wide <- data_wide_batched
write_rds(data_wide,
file = "data/originals/data_wide.rds")bac_functions
- загрузка и редактирование
bac_functions
# Чтение листов Excel-файла с функциями бактерий и их объединение
path <- "data/raw/Bacterial group functions.xlsx"
taxon <- c ("TaxonName", "Rank")
neuromediators <- read_xlsx (path, 2) %>%
mutate(Destroy = ifelse(is.na (Destroy), "produce", "destroy")) %>%
unique() %>%
pivot_wider(names_from = Neuromediator, values_from = Destroy)
probiotics <- read_xlsx (path, 3) %>%
add_column(probiotics = 1)
special_properties <- read_xlsx (path, 4) %>%
add_column(special_properties = 1)
vitamins <- read_xlsx (path, 5) %>%
pivot_wider (names_from = Vitamin, values_from = Vitamin,
values_fn = function(x) ifelse(is.na (x), NA, 1))
habbits <- read_xlsx (path, 7) %>%
unique() %>% #удаление повторяющихся строк
pivot_wider(names_from = Habbit, values_from = Habit_state)
bac_functions <- read_xlsx (path, 1) %>% #Патогены и нежелательные
full_join(neuromediators, by = taxon) %>% #Нейромедиаторы
full_join(probiotics, by = taxon) %>% #Пробиотики
full_join(special_properties, by = taxon) %>% #С особыми свойствами
full_join(vitamins, by = taxon) %>% #Витамины
full_join(read_xlsx (path, 6), by = taxon) %>% #Продуценты КЦДК
full_join(habbits, by = taxon) %>% #Вредные привычки
unite("Taxon", TaxonName, Rank, sep = "_") %>%
filter (Taxon != "Blautia obeum_S") %>% #для данного таксона противоречивая информация в Продуценты КЦЖК
mutate_all(as.factor)
rm (path, taxon, neuromediators, probiotics, special_properties, vitamins, habbits)data_long
- Перевод
data_wideв длинный формат (data_long), объединениеdata_longиbac_functions
# Создание датасета в длинном формате
data_long <- data_wide %>%
pivot_longer(ends_with(c("_D", "_P", "_O", "_C", "_F", "_G")),
names_to = "Taxon", values_to = "Percentage")
#Перезапись data_long с добавлением функций бактерий
data_long <- data_long %>%
left_join (bac_functions, by = "Taxon")
#Сохранение data_long.rds
write_rds(data_long,
file = "data/originals/data_long.rds",
compress = "gz") - Создание отдельных длинных датасетов для каждого таксона
G_long <- data_long %>% subset(grepl("_G", Taxon))
# %>% select (where (function(x) sum (is.na(x))/ nrow(.) * 100 < threshold_percent))
F_long <- data_long %>% subset(grepl("_F", Taxon))
C_long <- data_long %>% subset(grepl("_C", Taxon))
O_long <- data_long %>% subset(grepl("_O", Taxon))
P_long <- data_long %>% subset(grepl("_P", Taxon))
write_rds(G_long,
file = "data/originals/G_long.rds", "gz")
write_rds(F_long,
file = "data/originals/F_long.rds", "gz")
write_rds(C_long,
file = "data/originals/C_long.rds", "gz")
write_rds(O_long,
file = "data/originals/O_long.rds", "gz")
write_rds(P_long,
file = "data/originals/P_long.rds", "gz") Анализ
Факторный анализ
- Проведем множественное сравнение каждого таксона из
combined_bacteriaс по группеHealth_stateизcombined_infoбез учета таксономического уровня.
# Создание нового датасета для сохранения результатов
result_dataset <- data.frame(
Variable_Name = character(),
Test_Type = character(),
P_Value = numeric(),
Normal_Distribution = character(),
stringsAsFactors = FALSE
)
alpha = 0.05
# Объединяем датасеты по patient_id
combined_data <- data_wide %>%
select(Health_state,
ends_with(c("_D", "_P", "_O", "_C", "_F", "_G")))
combined_bacteria_clean <- combined_data
# Получаем список переменных из датасета combined_bacteria, исключая "patient_ID"
values_to_exclude <- c("patient_ID", "Seq_date", "Age")
variable_names <- setdiff(names(combined_bacteria_clean), values_to_exclude)
# Проходим по каждой переменной
for (variable in variable_names) {
# Фильтрация данных (исключаем строки с NA и 0 в текущей переменной)
filtered_data <- combined_data[!is.na(combined_data[[variable]]) & combined_data[[variable]] != 0, ]
#print(variable)
#print(filtered_data)
# Проверим что датасет filtered_data не пустой и что количество групп сравнения более 1, в нашем случае их 2 :)
if (nrow(filtered_data) > 0 & length(unique(filtered_data$Health_state)) > 1) {
# Check if there is sufficient variability in the data
if (length(unique(filtered_data$Health_state)) > 1) {
# Проверка на нормальность
shapiro_test_result <- try(shapiro.test(filtered_data[[variable]]), silent = TRUE)
if (inherits(shapiro_test_result, "try-error")) {
warning(paste("Skipping Shapiro-Wilk test for variable", variable, "due to an error."))
next
}
p_value_shapiro <- shapiro_test_result$p.value
# Выбор соответствующего статистического теста
if (p_value_shapiro > 0.05) {
# Если нормальное распределение, провести дисперсионный анализ
model <- aov(filtered_data[[variable]] ~ Health_state, data = filtered_data)
summary_list <- summary(model)
test_type <- "ANOVA"
} else {
# Если не нормальное распределение, использовать тест Краскела-Уоллиса
tryCatch({
model <- kruskal.test(filtered_data[[variable]] ~ Health_state, data = filtered_data)
test_type <- "Kruskal-Wallis"
}, error = function(e) {
warning(paste("Skipping Kruskal-Wallis test for variable", variable, "due to an error:", conditionMessage(e)))
next
})
}
# Добавление результатов выбранного теста в датасет
result_dataset <- rbind(result_dataset,
data.frame(Variable_Name = variable,
Test_Type = test_type,
P_Value = ifelse(test_type == "ANOVA", summary_list[[1]]$"Pr(>F)"[1], model$p.value),
Normal_Distribution = ifelse(p_value_shapiro > 0.05, "Yes", "No")))
} else {
# If there is no variability, skip the tests
warning(paste("Skipping tests for variable", variable, "as there is not enough variability in the data."))
}
}}## Warning: Skipping Shapiro-Wilk test for variable Health_state due to an error.# Добавление столбца с поправкой Бонферрони
result_dataset$Adjusted_P_Value_Bonferroni <- p.adjust(result_dataset$P_Value, method = "bonferroni")
# Добавление столбца с поправкой Холма
result_dataset$Adjusted_P_Value_Holm <- p.adjust(result_dataset$P_Value, method = "holm")
# Добавление столбца с поправкой Бенджамини-Хохберга
result_dataset$Adjusted_P_Value_BH <- p.adjust(result_dataset$P_Value, method = "BH")
result_dataset$test_pass = ifelse(result_dataset$Adjusted_P_Value_Bonferroni < alpha & result_dataset$Adjusted_P_Value_Holm < alpha & result_dataset$Adjusted_P_Value_BH < alpha, "Y", "N")
result_dataset_pass <- result_dataset %>% filter(test_pass == "Y")
# Вывод результатов
print(result_dataset_pass)## Variable_Name Test_Type P_Value
## 1 Eukaryota_D Kruskal-Wallis 3.641890e-07
## 2 Acidobacteriota_P Kruskal-Wallis 4.931868e-06
## 3 Actinobacteriota_P Kruskal-Wallis 5.956848e-07
## 4 Armatimonadota_P Kruskal-Wallis 5.555616e-10
## 5 Bdellovibrionota_P Kruskal-Wallis 1.102695e-09
## 6 Campylobacterota_P Kruskal-Wallis 4.120866e-06
## 7 Cyanobacteria_P Kruskal-Wallis 2.162075e-22
## 8 Desulfobacterota_P Kruskal-Wallis 2.250375e-08
## 9 Fibrobacterota_P Kruskal-Wallis 9.167248e-08
## 10 Firmicutes_P Kruskal-Wallis 3.498944e-16
## 11 Fusobacteriota_P Kruskal-Wallis 2.304884e-12
## 12 Nitrospirota_P Kruskal-Wallis 7.764816e-07
## 13 Proteobacteria_P Kruskal-Wallis 1.121119e-31
## 14 Verrucomicrobiota_P Kruskal-Wallis 1.976683e-08
## 15 Bacillales_O Kruskal-Wallis 1.093474e-12
## 16 Bdellovibrionales_O Kruskal-Wallis 2.180046e-12
## 17 Burkholderiales_O Kruskal-Wallis 2.874918e-05
## 18 Clostridia UCG-014_O Kruskal-Wallis 3.732801e-19
## 19 Clostridia vadinBB60 group_O Kruskal-Wallis 3.209141e-28
## 20 Clostridiales_O Kruskal-Wallis 1.067999e-26
## 21 DTU014_O Kruskal-Wallis 1.461310e-07
## 22 Desulfitobacteriales_O Kruskal-Wallis 1.646832e-05
## 23 Desulfobacterales_O Kruskal-Wallis 3.271719e-07
## 24 Desulfovibrionales_O Kruskal-Wallis 4.598530e-08
## 25 Enterobacterales_O Kruskal-Wallis 3.493634e-43
## 26 Fibrobacterales_O Kruskal-Wallis 1.952118e-11
## 27 Fusobacteriales_O Kruskal-Wallis 2.304884e-12
## 28 Gastranaerophilales_O Kruskal-Wallis 1.784014e-33
## 29 Izemoplasmatales_O Kruskal-Wallis 3.915759e-32
## 30 Lactobacillales_O Kruskal-Wallis 1.933468e-09
## 31 Opitutales_O Kruskal-Wallis 5.646650e-07
## 32 Oscillospirales_O Kruskal-Wallis 6.906239e-11
## 33 Pedosphaerales_O Kruskal-Wallis 1.302641e-15
## 34 Peptostreptococcales-Tissierellales_O Kruskal-Wallis 1.840308e-26
## 35 Pirellulales_O Kruskal-Wallis 3.196572e-09
## 36 Propionibacteriales_O Kruskal-Wallis 1.267265e-13
## 37 Pseudomonadales_O Kruskal-Wallis 3.208077e-12
## 38 RF39_O Kruskal-Wallis 1.317623e-08
## 39 Rhodobacterales_O Kruskal-Wallis 9.110302e-22
## 40 Rhodospirillales_O Kruskal-Wallis 9.132432e-06
## 41 Rickettsiales_O Kruskal-Wallis 2.020389e-16
## 42 SBR1031_O Kruskal-Wallis 1.172360e-06
## 43 Staphylococcales_O Kruskal-Wallis 3.046562e-07
## 44 Veillonellales-Selenomonadales_O Kruskal-Wallis 1.606580e-11
## 45 Verrucomicrobiales_O Kruskal-Wallis 7.214817e-30
## 46 Victivallales_O Kruskal-Wallis 1.262006e-43
## 47 Xanthomonadales_O Kruskal-Wallis 2.298532e-35
## 48 Bdellovibrionia_C Kruskal-Wallis 1.961073e-08
## 49 Campylobacteria_C Kruskal-Wallis 4.506978e-06
## 50 Chloroflexia_C Kruskal-Wallis 1.333103e-52
## 51 Clostridia_C Kruskal-Wallis 2.869853e-19
## 52 Dehalococcoidia_C Kruskal-Wallis 1.999580e-05
## 53 Desulfitobacteriia_C Kruskal-Wallis 1.646832e-05
## 54 Desulfobacteria_C Kruskal-Wallis 2.570935e-06
## 55 Desulfovibrionia_C Kruskal-Wallis 4.598530e-08
## 56 Fibrobacteria_C Kruskal-Wallis 1.952118e-11
## 57 Fusobacteriia_C Kruskal-Wallis 2.304884e-12
## 58 Gammaproteobacteria_C Kruskal-Wallis 5.052401e-24
## 59 Gracilibacteria_C Kruskal-Wallis 3.949566e-09
## 60 Lentisphaeria_C Kruskal-Wallis 1.437163e-32
## 61 Microgenomatia_C Kruskal-Wallis 2.221509e-05
## 62 Negativicutes_C Kruskal-Wallis 1.630876e-10
## 63 Parcubacteria_C Kruskal-Wallis 4.142854e-11
## 64 Phycisphaerae_C Kruskal-Wallis 3.006549e-07
## 65 Vampirivibrionia_C Kruskal-Wallis 1.714190e-17
## 66 Verrucomicrobiae_C Kruskal-Wallis 5.551747e-20
## 67 vadinHA49_C Kruskal-Wallis 4.885983e-06
## 68 A4b_F Kruskal-Wallis 5.664201e-18
## 69 Aerococcaceae_F Kruskal-Wallis 1.005536e-10
## 70 Akkermansiaceae_F Kruskal-Wallis 1.680017e-29
## 71 Alteromonadaceae_F Kruskal-Wallis 5.510037e-25
## 72 Bacillaceae_F Kruskal-Wallis 2.467063e-12
## 73 Bdellovibrionaceae_F Kruskal-Wallis 2.180046e-12
## 74 Burkholderiaceae_F Kruskal-Wallis 4.981468e-21
## 75 Caloramatoraceae_F Kruskal-Wallis 2.538328e-21
## 76 Carnobacteriaceae_F Kruskal-Wallis 1.039051e-05
## 77 Clostridiaceae_F Kruskal-Wallis 8.902870e-27
## 78 Comamonadaceae_F Kruskal-Wallis 6.571902e-11
## 79 Coriobacteriaceae_F Kruskal-Wallis 4.658545e-12
## 80 Corynebacteriaceae_F Kruskal-Wallis 1.917933e-06
## 81 Desulfovibrionaceae_F Kruskal-Wallis 9.189183e-09
## 82 Dethiosulfatibacteraceae_F Kruskal-Wallis 3.006610e-48
## 83 Enterobacteriaceae_F Kruskal-Wallis 2.753246e-45
## 84 Erwiniaceae_F Kruskal-Wallis 1.426000e-46
## 85 Family XI_F Kruskal-Wallis 1.732333e-07
## 86 Fusibacteraceae_F Kruskal-Wallis 1.175304e-12
## 87 Fusobacteriaceae_F Kruskal-Wallis 1.130697e-06
## 88 Gemellaceae_F Kruskal-Wallis 3.263173e-17
## 89 Leptotrichiaceae_F Kruskal-Wallis 3.156349e-20
## 90 ML635J-40 aquatic group_F Kruskal-Wallis 1.343215e-06
## 91 Micrococcaceae_F Kruskal-Wallis 3.198537e-28
## 92 Moraxellaceae_F Kruskal-Wallis 3.150003e-27
## 93 Morganellaceae_F Kruskal-Wallis 2.198451e-15
## 94 Neisseriaceae_F Kruskal-Wallis 4.802029e-38
## 95 Oxalobacteraceae_F Kruskal-Wallis 1.372032e-12
## 96 Pasteurellaceae_F Kruskal-Wallis 1.032882e-24
## 97 Pedosphaeraceae_F Kruskal-Wallis 1.302641e-15
## 98 Peptostreptococcaceae_F Kruskal-Wallis 7.392404e-35
## 99 Pirellulaceae_F Kruskal-Wallis 3.196572e-09
## 100 Planococcaceae_F Kruskal-Wallis 3.691366e-18
## 101 Propionibacteriaceae_F Kruskal-Wallis 6.631706e-09
## 102 Pseudomonadaceae_F Kruskal-Wallis 3.996889e-22
## 103 Rhodobacteraceae_F Kruskal-Wallis 9.110302e-22
## 104 Rhodocyclaceae_F Kruskal-Wallis 7.399735e-20
## 105 Ruminococcaceae_F Kruskal-Wallis 1.582549e-08
## 106 SB-5_F Kruskal-Wallis 3.298360e-07
## 107 Shewanellaceae_F Kruskal-Wallis 5.652343e-08
## 108 Sutterellaceae_F Kruskal-Wallis 1.095159e-05
## 109 UCG-010_F Kruskal-Wallis 1.173862e-23
## 110 Veillonellaceae_F Kruskal-Wallis 2.025402e-12
## 111 Vibrionaceae_F Kruskal-Wallis 1.133000e-19
## 112 Victivallaceae_F Kruskal-Wallis 3.983873e-47
## 113 Weeksellaceae_F Kruskal-Wallis 7.658696e-15
## 114 Xanthomonadaceae_F Kruskal-Wallis 1.867012e-05
## 115 Yersiniaceae_F Kruskal-Wallis 1.036265e-37
## 116 [Eubacterium] coprostanoligenes group_F Kruskal-Wallis 1.838722e-27
## 117 Acetanaerobacterium_G Kruskal-Wallis 7.477478e-29
## 118 Acidaminococcus_G Kruskal-Wallis 2.000921e-05
## 119 Acinetobacter_G Kruskal-Wallis 7.548236e-30
## 120 Actinobacillus_G Kruskal-Wallis 9.404740e-23
## 121 Aeromonas_G Kruskal-Wallis 5.221036e-06
## 122 Akkermansia_G Kruskal-Wallis 1.680017e-29
## 123 Anaerococcus_G Kruskal-Wallis 1.600133e-09
## 124 Anaerocolumna_G Kruskal-Wallis 3.200634e-07
## 125 Anaerofilum_G Kruskal-Wallis 1.254379e-11
## 126 Anaerosporobacter_G Kruskal-Wallis 3.218415e-05
## 127 Anaerostipes_G Kruskal-Wallis 1.316182e-06
## 128 Bacillus_G Kruskal-Wallis 1.174276e-11
## 129 CAG-352_G Kruskal-Wallis 8.685810e-06
## 130 CAG-56_G Kruskal-Wallis 1.266937e-11
## 131 CHKCI001_G Kruskal-Wallis 6.501996e-06
## 132 CHKCI002_G Kruskal-Wallis 2.413639e-05
## 133 Candidatus Phytoplasma_G Kruskal-Wallis 7.466909e-06
## 134 Candidatus Stoquefichus_G Kruskal-Wallis 4.657966e-17
## 135 Caproiciproducens_G Kruskal-Wallis 1.982204e-06
## 136 Catenibacterium_G Kruskal-Wallis 5.744837e-07
## 137 Christensenella_G Kruskal-Wallis 4.540380e-13
## 138 Citrobacter_G Kruskal-Wallis 3.269696e-08
## 139 Cloacibacillus_G Kruskal-Wallis 2.656491e-19
## 140 Clostridium sensu stricto 13_G Kruskal-Wallis 1.765588e-33
## 141 Clostridium sensu stricto 1_G Kruskal-Wallis 1.001200e-29
## 142 Collinsella_G Kruskal-Wallis 1.584679e-11
## 143 DTU089_G Kruskal-Wallis 1.469309e-07
## 144 Desulfovibrio_G Kruskal-Wallis 8.406321e-18
## 145 Dethiosulfatibacter_G Kruskal-Wallis 3.006610e-48
## 146 Eggerthella_G Kruskal-Wallis 1.512409e-07
## 147 Enterobacter_G Kruskal-Wallis 4.283633e-49
## 148 Epulopiscium_G Kruskal-Wallis 4.252884e-05
## 149 Escherichia-Shigella_G Kruskal-Wallis 1.211205e-45
## 150 Faecalibacterium_G Kruskal-Wallis 1.487630e-10
## 151 Fastidiosipila_G Kruskal-Wallis 1.336125e-06
## 152 Fermentimonas_G Kruskal-Wallis 2.441946e-07
## 153 Fusibacter_G Kruskal-Wallis 1.175304e-12
## 154 Fusobacterium_G Kruskal-Wallis 1.088967e-09
## 155 GCA-900066575_G Kruskal-Wallis 6.399238e-14
## 156 GCA-900066755_G Kruskal-Wallis 7.629800e-39
## 157 Gemella_G Kruskal-Wallis 3.263173e-17
## 158 Geobacillus_G Kruskal-Wallis 2.557631e-41
## 159 Granulicatella_G Kruskal-Wallis 2.758976e-05
## 160 Halobacillus_G Kruskal-Wallis 4.880366e-05
## 161 Harryflintia_G Kruskal-Wallis 3.870844e-22
## 162 Hespellia_G Kruskal-Wallis 1.148969e-05
## 163 Holdemanella_G Kruskal-Wallis 2.340090e-13
## 164 Intestinimonas_G Kruskal-Wallis 9.422743e-07
## 165 Klebsiella_G Kruskal-Wallis 1.636362e-24
## 166 Lachnospiraceae NC2004 group_G Kruskal-Wallis 1.126652e-05
## 167 Lachnospiraceae NK4B4 group_G Kruskal-Wallis 3.406312e-05
## 168 Lachnospiraceae UCG-001_G Kruskal-Wallis 3.250466e-05
## 169 Lachnospiraceae UCG-002_G Kruskal-Wallis 2.994427e-09
## 170 Lachnospiraceae UCG-006_G Kruskal-Wallis 3.057389e-05
## 171 Lachnospiraceae UCG-008_G Kruskal-Wallis 3.008204e-05
## 172 Lachnospiraceae UCG-010_G Kruskal-Wallis 1.108805e-05
## 173 Lacticaseibacillus_G Kruskal-Wallis 9.016788e-11
## 174 Lysinibacillus_G Kruskal-Wallis 4.843857e-30
## 175 Macellibacteroides_G Kruskal-Wallis 8.252963e-10
## 176 Megamonas_G Kruskal-Wallis 2.480778e-05
## 177 Moryella_G Kruskal-Wallis 1.698210e-05
## 178 Negativibacillus_G Kruskal-Wallis 3.505090e-12
## 179 OM27 clade_G Kruskal-Wallis 2.689783e-40
## 180 Olsenella_G Kruskal-Wallis 6.665175e-09
## 181 Paludibacter_G Kruskal-Wallis 7.121028e-06
## 182 Pantoea_G Kruskal-Wallis 1.357796e-40
## 183 Paraclostridium_G Kruskal-Wallis 2.973228e-10
## 184 Paraprevotella_G Kruskal-Wallis 3.160620e-10
## 185 Parvimonas_G Kruskal-Wallis 4.199992e-28
## 186 Peptoniphilus_G Kruskal-Wallis 1.264624e-13
## 187 Peptostreptococcus_G Kruskal-Wallis 1.711585e-35
## 188 Porphyromonas_G Kruskal-Wallis 1.328965e-07
## 189 Prevotella_7_G Kruskal-Wallis 1.519248e-07
## 190 Prevotella_G Kruskal-Wallis 5.583780e-06
## 191 Prevotellaceae NK3B31 group_G Kruskal-Wallis 1.352145e-08
## 192 Prevotellaceae UCG-001_G Kruskal-Wallis 3.947135e-08
## 193 Robinsoniella_G Kruskal-Wallis 7.475667e-08
## 194 Romboutsia_G Kruskal-Wallis 2.498546e-34
## 195 Ruminiclostridium_G Kruskal-Wallis 8.539573e-14
## 196 Salmonella_G Kruskal-Wallis 3.407245e-50
## 197 Serratia_G Kruskal-Wallis 9.170091e-39
## 198 Shewanella_G Kruskal-Wallis 6.216394e-14
## 199 Sporobacter_G Kruskal-Wallis 8.346727e-13
## 200 Streptococcus_G Kruskal-Wallis 4.895500e-05
## 201 Subdoligranulum_G Kruskal-Wallis 1.307132e-12
## 202 Sutterella_G Kruskal-Wallis 3.585245e-19
## 203 Turicibacter_G Kruskal-Wallis 9.040827e-35
## 204 UCG-002_G Kruskal-Wallis 1.932637e-09
## 205 UCG-004_G Kruskal-Wallis 2.840630e-48
## 206 UCG-005_G Kruskal-Wallis 9.285072e-10
## 207 UCG-012_G Kruskal-Wallis 3.913332e-05
## 208 Veillonella_G Kruskal-Wallis 2.021157e-43
## 209 Vibrio_G Kruskal-Wallis 1.439854e-15
## 210 XBB1006_G Kruskal-Wallis 4.544741e-06
## 211 [Eubacterium] fissicatena group_G Kruskal-Wallis 6.453837e-08
## 212 [Ruminococcus] gnavus group_G Kruskal-Wallis 2.739855e-11
## Normal_Distribution Adjusted_P_Value_Bonferroni Adjusted_P_Value_Holm
## 1 No 3.084681e-04 2.498337e-04
## 2 No 4.177292e-03 3.294488e-03
## 3 No 5.045450e-04 4.068527e-04
## 4 No 4.705606e-07 4.038933e-07
## 5 No 9.339824e-07 7.972483e-07
## 6 No 3.490373e-03 2.769222e-03
## 7 No 1.831277e-19 1.721012e-19
## 8 No 1.906068e-05 1.591015e-05
## 9 No 7.764659e-05 6.407906e-05
## 10 No 2.963605e-13 2.704683e-13
## 11 No 1.952236e-09 1.730968e-09
## 12 No 6.576800e-04 5.295605e-04
## 13 No 9.495882e-29 9.170757e-29
## 14 No 1.674250e-05 1.399491e-05
## 15 No 9.261728e-10 8.299471e-10
## 16 No 1.846499e-09 1.641574e-09
## 17 No 2.435056e-02 1.854322e-02
## 18 No 3.161683e-16 2.919051e-16
## 19 No 2.718142e-25 2.596195e-25
## 20 No 9.045952e-24 8.586712e-24
## 21 No 1.237729e-04 1.018533e-04
## 22 No 1.394866e-02 1.078675e-02
## 23 No 2.771146e-04 2.250943e-04
## 24 No 3.894955e-05 3.237365e-05
## 25 No 2.959108e-40 2.917185e-40
## 26 No 1.653444e-08 1.442615e-08
## 27 No 1.952236e-09 1.730968e-09
## 28 No 1.511060e-30 1.464676e-30
## 29 No 3.316648e-29 3.207007e-29
## 30 No 1.637647e-06 1.393432e-06
## 31 No 4.782713e-04 3.867955e-04
## 32 No 5.849585e-08 5.069179e-08
## 33 No 1.103337e-12 1.005639e-12
## 34 No 1.558741e-23 1.477767e-23
## 35 No 2.707496e-06 2.295138e-06
## 36 No 1.073374e-10 9.669235e-11
## 37 No 2.717241e-09 2.396434e-09
## 38 No 1.116026e-05 9.381473e-06
## 39 No 7.716426e-19 7.224470e-19
## 40 No 7.735170e-03 6.036538e-03
## 41 No 1.711270e-13 1.563781e-13
## 42 No 9.929892e-04 7.960327e-04
## 43 No 2.580438e-04 2.102128e-04
## 44 No 1.360773e-08 1.188869e-08
## 45 No 6.110950e-27 5.887291e-27
## 46 No 1.068919e-40 1.056299e-40
## 47 No 1.946857e-32 1.898588e-32
## 48 No 1.661029e-05 1.390401e-05
## 49 No 3.817410e-03 3.024182e-03
## 50 No 1.129138e-49 1.129138e-49
## 51 No 2.430765e-16 2.249965e-16
## 52 No 1.693644e-02 1.301727e-02
## 53 No 1.394866e-02 1.078675e-02
## 54 No 2.177582e-03 1.730239e-03
## 55 No 3.894955e-05 3.237365e-05
## 56 No 1.653444e-08 1.442615e-08
## 57 No 1.952236e-09 1.730968e-09
## 58 No 4.279384e-21 4.036868e-21
## 59 No 3.345282e-06 2.827889e-06
## 60 No 1.217277e-29 1.178474e-29
## 61 No 1.881618e-02 1.441759e-02
## 62 No 1.381352e-07 1.190540e-07
## 63 No 3.508997e-08 3.049140e-08
## 64 No 2.546547e-04 2.077525e-04
## 65 No 1.451919e-14 1.333640e-14
## 66 No 4.702330e-17 4.374777e-17
## 67 No 4.138427e-03 3.268722e-03
## 68 No 4.797578e-15 4.418077e-15
## 69 No 8.516894e-08 7.360527e-08
## 70 No 1.422975e-26 1.365854e-26
## 71 No 4.667001e-22 4.419049e-22
## 72 No 2.089602e-09 1.845363e-09
## 73 No 1.846499e-09 1.641574e-09
## 74 No 4.219303e-18 3.935360e-18
## 75 No 2.149964e-18 2.007817e-18
## 76 No 8.800762e-03 6.857737e-03
## 77 No 7.540731e-24 7.166811e-24
## 78 No 5.566401e-08 4.830348e-08
## 79 No 3.945788e-09 3.470616e-09
## 80 No 1.624490e-03 1.294605e-03
## 81 No 7.783238e-06 6.551888e-06
## 82 No 2.546599e-45 2.534572e-45
## 83 No 2.331999e-42 2.307220e-42
## 84 No 1.207822e-43 1.197840e-43
## 85 No 1.467286e-04 1.200507e-04
## 86 No 9.954821e-10 8.908801e-10
## 87 No 9.577005e-04 7.688741e-04
## 88 No 2.763908e-14 2.535486e-14
## 89 No 2.673428e-17 2.490360e-17
## 90 No 1.137703e-03 9.080131e-04
## 91 No 2.709161e-25 2.590815e-25
## 92 No 2.668053e-24 2.538902e-24
## 93 No 1.862088e-12 1.690609e-12
## 94 No 4.067318e-35 3.980882e-35
## 95 No 1.162111e-09 1.035884e-09
## 96 No 8.748511e-22 8.273385e-22
## 97 No 1.103337e-12 1.005639e-12
## 98 No 6.261366e-32 6.098733e-32
## 99 No 2.707496e-06 2.295138e-06
## 100 No 3.126587e-15 2.882957e-15
## 101 No 5.617055e-06 4.741670e-06
## 102 No 3.385365e-19 3.173530e-19
## 103 No 7.716426e-19 7.224470e-19
## 104 No 6.267575e-17 5.823591e-17
## 105 No 1.340419e-05 1.123610e-05
## 106 No 2.793711e-04 2.265974e-04
## 107 No 4.787535e-05 3.967945e-05
## 108 No 9.275996e-03 7.217097e-03
## 109 No 9.942614e-21 9.367421e-21
## 110 No 1.715515e-09 1.527153e-09
## 111 No 9.596507e-17 8.905378e-17
## 112 No 3.374340e-44 3.350437e-44
## 113 No 6.486915e-12 5.881878e-12
## 114 No 1.581359e-02 1.217292e-02
## 115 No 8.777168e-35 8.580277e-35
## 116 No 1.557397e-24 1.483849e-24
## 117 No 6.333424e-26 6.064235e-26
## 118 No 1.694780e-02 1.301727e-02
## 119 No 6.393356e-27 6.151812e-27
## 120 No 7.965815e-20 7.495578e-20
## 121 No 4.422218e-03 3.482431e-03
## 122 No 1.422975e-26 1.365854e-26
## 123 No 1.355312e-06 1.155296e-06
## 124 No 2.710937e-04 2.205237e-04
## 125 No 1.062459e-08 9.320033e-09
## 126 No 2.725998e-02 2.066223e-02
## 127 No 1.114807e-03 8.923717e-04
## 128 No 9.946116e-09 8.736612e-09
## 129 No 7.356881e-03 5.750006e-03
## 130 No 1.073095e-08 9.400671e-09
## 131 No 5.507190e-03 4.323827e-03
## 132 No 2.044352e-02 1.564038e-02
## 133 No 6.324472e-03 4.950561e-03
## 134 No 3.945297e-14 3.609923e-14
## 135 No 1.678927e-03 1.336006e-03
## 136 No 4.865877e-04 3.929469e-04
## 137 No 3.845702e-10 3.455229e-10
## 138 No 2.769433e-05 2.308406e-05
## 139 No 2.250048e-16 2.085346e-16
## 140 No 1.495453e-30 1.451313e-30
## 141 No 8.480166e-27 8.149770e-27
## 142 No 1.342223e-08 1.174247e-08
## 143 No 1.244504e-04 1.022639e-04
## 144 No 7.120154e-15 6.548524e-15
## 145 No 2.546599e-45 2.534572e-45
## 146 No 1.281011e-04 1.051124e-04
## 147 No 3.628237e-46 3.619670e-46
## 148 No 3.602192e-02 2.713340e-02
## 149 No 1.025891e-42 1.016201e-42
## 150 No 1.260022e-07 1.087457e-07
## 151 No 1.131698e-03 9.045564e-04
## 152 No 2.068329e-04 1.689827e-04
## 153 No 9.954821e-10 8.908801e-10
## 154 No 9.223555e-07 7.884125e-07
## 155 No 5.420155e-11 4.901816e-11
## 156 No 6.462441e-36 6.340364e-36
## 157 No 2.763908e-14 2.535486e-14
## 158 No 2.166313e-38 2.133064e-38
## 159 No 2.336852e-02 1.782298e-02
## 160 No 4.133670e-02 3.108793e-02
## 161 No 3.278605e-19 3.077321e-19
## 162 No 9.731768e-03 7.537237e-03
## 163 No 1.982056e-10 1.783148e-10
## 164 No 7.981063e-04 6.416888e-04
## 165 No 1.385999e-21 1.309090e-21
## 166 No 9.542746e-03 7.402106e-03
## 167 No 2.885146e-02 2.180039e-02
## 168 No 2.753145e-02 2.083549e-02
## 169 No 2.536280e-06 2.152993e-06
## 170 No 2.589609e-02 1.965901e-02
## 171 No 2.547949e-02 1.937284e-02
## 172 No 9.391580e-03 7.295938e-03
## 173 No 7.637220e-08 6.609306e-08
## 174 No 4.102747e-27 3.957431e-27
## 175 No 6.990259e-07 5.991651e-07
## 176 No 2.101219e-02 1.605064e-02
## 177 No 1.438384e-02 1.108931e-02
## 178 No 2.968811e-09 2.614797e-09
## 179 No 2.278247e-37 2.237900e-37
## 180 No 5.645403e-06 4.758935e-06
## 181 No 6.031510e-03 4.728362e-03
## 182 No 1.150053e-37 1.131044e-37
## 183 No 2.518324e-07 2.167483e-07
## 184 No 2.677045e-07 2.300931e-07
## 185 No 3.557393e-25 3.393594e-25
## 186 No 1.071137e-10 9.661731e-11
## 187 No 1.449712e-32 1.415481e-32
## 188 No 1.125633e-04 9.276176e-05
## 189 No 1.286803e-04 1.054358e-04
## 190 No 4.729462e-03 3.718798e-03
## 191 No 1.145267e-05 9.613751e-06
## 192 No 3.343223e-05 2.782730e-05
## 193 No 6.331890e-05 5.232967e-05
## 194 No 2.116268e-31 2.056303e-31
## 195 No 7.233018e-11 6.532773e-11
## 196 No 2.885937e-47 2.882530e-47
## 197 No 7.767067e-36 7.611175e-36
## 198 No 5.265285e-11 4.767974e-11
## 199 No 7.069677e-10 6.343512e-10
## 200 No 4.146488e-02 3.113538e-02
## 201 No 1.107141e-09 9.881918e-10
## 202 No 3.036703e-16 2.807247e-16
## 203 No 7.657580e-32 7.449641e-32
## 204 No 1.636944e-06 1.393432e-06
## 205 No 2.406013e-45 2.397492e-45
## 206 No 7.864456e-07 6.731678e-07
## 207 No 3.314592e-02 2.500619e-02
## 208 No 1.711920e-40 1.689688e-40
## 209 No 1.219556e-12 1.108687e-12
## 210 No 3.849396e-03 3.044977e-03
## 211 No 5.466400e-05 4.524140e-05
## 212 No 2.320657e-08 2.019273e-08
## Adjusted_P_Value_BH test_pass
## 1 1.904124e-06 Y
## 2 2.320718e-05 Y
## 3 3.057848e-06 Y
## 4 3.888931e-09 Y
## 5 7.471859e-09 Y
## 6 1.983167e-05 Y
## 7 3.521687e-21 Y
## 8 1.351821e-07 Y
## 9 5.211180e-07 Y
## 10 3.951474e-15 Y
## 11 1.971956e-11 Y
## 12 3.961927e-06 Y
## 13 3.165294e-30 Y
## 14 1.195893e-07 Y
## 15 1.040644e-11 Y
## 16 1.923436e-11 Y
## 17 1.199535e-04 Y
## 18 4.790429e-18 Y
## 19 6.969596e-27 Y
## 20 2.055898e-25 Y
## 21 8.187529e-07 Y
## 22 7.190032e-05 Y
## 23 1.731966e-06 Y
## 24 2.686176e-07 Y
## 25 2.276237e-41 Y
## 26 1.503131e-10 Y
## 27 1.971956e-11 Y
## 28 5.596519e-32 Y
## 29 1.143672e-30 Y
## 30 1.279412e-08 Y
## 31 2.934179e-06 Y
## 32 5.131214e-10 Y
## 33 1.432905e-14 Y
## 34 3.463868e-25 Y
## 35 2.066791e-08 Y
## 36 1.262793e-12 Y
## 37 2.690338e-11 Y
## 38 8.206076e-08 Y
## 39 1.377933e-20 Y
## 40 4.136455e-05 Y
## 41 2.312527e-15 Y
## 42 5.875676e-06 Y
## 43 1.633189e-06 Y
## 44 1.259975e-10 Y
## 45 1.909672e-28 Y
## 46 9.717447e-42 Y
## 47 8.849349e-34 Y
## 48 1.194985e-07 Y
## 49 2.156729e-05 Y
## 50 1.129138e-49 Y
## 51 3.798071e-18 Y
## 52 8.559495e-05 Y
## 53 7.190032e-05 Y
## 54 1.244332e-05 Y
## 55 2.686176e-07 Y
## 56 1.503131e-10 Y
## 57 1.971956e-11 Y
## 58 8.733436e-23 Y
## 59 2.534305e-08 Y
## 60 4.347418e-31 Y
## 61 9.455367e-05 Y
## 62 1.170637e-09 Y
## 63 3.133033e-10 Y
## 64 1.622004e-06 Y
## 65 2.074170e-16 Y
## 66 7.837216e-19 Y
## 67 2.311971e-05 Y
## 68 7.055262e-17 Y
## 69 7.342150e-10 Y
## 70 3.952707e-28 Y
## 71 1.014565e-23 Y
## 72 2.089602e-11 Y
## 73 1.923436e-11 Y
## 74 7.274661e-20 Y
## 75 3.771866e-20 Y
## 76 4.681256e-05 Y
## 77 1.753658e-25 Y
## 78 4.926019e-10 Y
## 79 3.830862e-11 Y
## 80 9.390114e-06 Y
## 81 5.765362e-08 Y
## 82 4.244331e-46 Y
## 83 2.331999e-43 Y
## 84 1.509777e-44 Y
## 85 9.466363e-07 Y
## 86 1.093936e-11 Y
## 87 5.700598e-06 Y
## 88 3.838761e-16 Y
## 89 4.531234e-19 Y
## 90 6.614551e-06 Y
## 91 6.969596e-27 Y
## 92 6.352506e-26 Y
## 93 2.357074e-14 Y
## 94 2.140694e-36 Y
## 95 1.249581e-11 Y
## 96 1.861385e-23 Y
## 97 1.432905e-14 Y
## 98 2.722333e-33 Y
## 99 2.066791e-08 Y
## 100 4.666547e-17 Y
## 101 4.212988e-08 Y
## 102 6.269195e-21 Y
## 103 1.377933e-20 Y
## 104 1.027471e-18 Y
## 105 9.713180e-08 Y
## 106 1.735224e-06 Y
## 107 3.279133e-07 Y
## 108 4.907935e-05 Y
## 109 1.988523e-22 Y
## 110 1.825016e-11 Y
## 111 1.547824e-18 Y
## 112 4.820486e-45 Y
## 113 8.108644e-14 Y
## 114 8.068160e-05 Y
## 115 4.388584e-36 Y
## 116 3.798530e-26 Y
## 117 1.711736e-27 Y
## 118 8.559495e-05 Y
## 119 1.937381e-28 Y
## 120 1.561925e-21 Y
## 121 2.443214e-05 Y
## 122 3.952707e-28 Y
## 123 1.075645e-08 Y
## 124 1.704992e-06 Y
## 125 1.011865e-10 Y
## 126 1.323300e-04 Y
## 127 6.557686e-06 Y
## 128 9.563573e-11 Y
## 129 3.955312e-05 Y
## 130 1.012354e-10 Y
## 131 3.009394e-05 Y
## 132 1.022176e-04 Y
## 133 3.418633e-05 Y
## 134 5.404516e-16 Y
## 135 9.649006e-06 Y
## 136 2.966998e-06 Y
## 137 4.420347e-12 Y
## 138 1.950305e-07 Y
## 139 3.571505e-18 Y
## 140 5.596519e-32 Y
## 141 2.494167e-28 Y
## 142 1.254414e-10 Y
## 143 8.187529e-07 Y
## 144 1.031906e-16 Y
## 145 4.244331e-46 Y
## 146 8.355864e-07 Y
## 147 1.209412e-46 Y
## 148 1.715330e-04 Y
## 149 1.139878e-43 Y
## 150 1.076942e-09 Y
## 151 6.614551e-06 Y
## 152 1.325852e-06 Y
## 153 1.093936e-11 Y
## 154 7.438351e-09 Y
## 155 6.609945e-13 Y
## 156 3.801436e-37 Y
## 157 3.838761e-16 Y
## 158 1.547366e-39 Y
## 159 1.156858e-04 Y
## 160 1.955891e-04 Y
## 161 6.186047e-21 Y
## 162 5.068629e-05 Y
## 163 2.304716e-12 Y
## 164 4.779080e-06 Y
## 165 2.887497e-23 Y
## 166 4.996202e-05 Y
## 167 1.387089e-04 Y
## 168 1.330022e-04 Y
## 169 1.966108e-08 Y
## 170 1.263224e-04 Y
## 171 1.248995e-04 Y
## 172 4.942937e-05 Y
## 173 6.641061e-10 Y
## 174 1.323467e-28 Y
## 175 5.729721e-09 Y
## 176 1.045383e-04 Y
## 177 7.376328e-05 Y
## 178 2.910599e-11 Y
## 179 1.423904e-38 Y
## 180 4.212988e-08 Y
## 181 3.277995e-05 Y
## 182 7.667023e-39 Y
## 183 2.116239e-09 Y
## 184 2.230871e-09 Y
## 185 8.893484e-27 Y
## 186 1.262793e-12 Y
## 187 6.903392e-34 Y
## 188 7.504222e-07 Y
## 189 8.355864e-07 Y
## 190 2.598605e-05 Y
## 191 8.359612e-08 Y
## 192 2.337918e-07 Y
## 193 4.278304e-07 Y
## 194 8.465073e-33 Y
## 195 8.714480e-13 Y
## 196 1.442968e-47 Y
## 197 4.315037e-37 Y
## 198 6.500352e-13 Y
## 199 8.033724e-12 Y
## 200 1.955891e-04 Y
## 201 1.203414e-11 Y
## 202 4.671850e-18 Y
## 203 3.190658e-33 Y
## 204 1.279412e-08 Y
## 205 4.244331e-46 Y
## 206 6.393867e-09 Y
## 207 1.585929e-04 Y
## 208 1.426600e-41 Y
## 209 1.563533e-14 Y
## 210 2.162582e-05 Y
## 211 3.718639e-07 Y
## 212 2.090682e-10 Y- Посмотрим на данные здоровых людей и людей с СРК как на многомерный вектор по всем таксонам и группам
combined_bacteria_G <- combined_bacteria_clean %>%
select(Health_state, ends_with("_G"))
d <- dist(combined_bacteria_G) # euclidean distances between the rows
fit <- cmdscale(d,eig=TRUE, k=2) # k is the number of dim
df_mds <- data.frame(
x = fit$points[,1],
y = fit$points[,2]
)
df_full <- cbind(df_mds, combined_info) %>% mutate(Health_state_n = case_when(Health_state == "Health" ~ 0,
Health_state == "Disease" ~ 1))
ggplot(df_full, aes(x = x, y = y, color = Health_state)) +
geom_point() +
theme_bw() +
ggtitle("Распределение вектора таксонов в зависимости от группы пациентов")
- Используя метод пермутаций проверим отличаются ли группы в зависимомти от Health_state
adonis2(d ~ Health_state_n, data = df_full)## Permutation test for adonis under reduced model
## Terms added sequentially (first to last)
## Permutation: free
## Number of permutations: 999
##
## adonis2(formula = d ~ Health_state_n, data = df_full)
## Df SumOfSqs R2 F Pr(>F)
## Health_state_n 1 1046 0.0122 4.6817 0.004 **
## Residual 379 84659 0.9878
## Total 380 85705 1.0000
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1Тест Манна-Уитни для сравнения каждого таксона между больными и здоровыми
- после округления всех значений до целого
Wilcox_comparison_round_0 <- data_wide %>%
select(Health_state, Archaea, Bacteria,
ends_with(c("_D", "_P", "_O", "_C", "_F", "_G"))) %>%
mutate(across (where (is.numeric), function (x) round (x,0))) %>%
summarise_if (is.numeric, function (x) (wilcox.test(x ~ .$Health_state)$p.value)) %>%
pivot_longer(everything()) %>%
rename (Taxon = name, p_value = value) %>%
filter (p_value <= 0.05 ) %>%
arrange(p_value) %>%
add_column(p_value_holm = p.adjust(.$p_value, "holm")) %>%
add_column(p_value_BH = p.adjust(.$p_value, "BH"))
rbind (
"Количество значимо различающихся таксонов по p_value" = nrow (Wilcox_comparison_round_0),
"Количество значимо различающихся таксонов по p_value_holm" = nrow (Wilcox_comparison_round_0 %>% filter (p_value_holm <= 0.05 )),
"Количество значимо различающихся таксонов по p_value_BH" = nrow (Wilcox_comparison_round_0 %>% filter (p_value_BH <= 0.05 ))
)## [,1]
## Количество значимо различающихся таксонов по p_value 100
## Количество значимо различающихся таксонов по p_value_holm 54
## Количество значимо различающихся таксонов по p_value_BH 100- после округления всех значений до десятых
Wilcox_comparison_round_1 <- data_wide %>%
select(Health_state, Archaea, Bacteria,
ends_with(c("_D", "_P", "_O", "_C", "_F", "_G"))) %>%
mutate(across (where (is.numeric), function (x) round (x,1))) %>%
summarise_if (is.numeric, function (x) (wilcox.test(x ~ .$Health_state)$p.value)) %>%
pivot_longer(everything()) %>%
rename (Taxon = name, p_value = value) %>%
filter (p_value <= 0.05 ) %>%
arrange(p_value) %>%
add_column(p_value_holm = p.adjust(.$p_value, "holm")) %>%
add_column(p_value_BH = p.adjust(.$p_value, "BH"))
rbind (
"Количество значимо различающихся таксонов по p_value" = nrow (Wilcox_comparison_round_1),
"Количество значимо различающихся таксонов по p_value_holm" = nrow (Wilcox_comparison_round_1 %>% filter (p_value_holm <= 0.05 )),
"Количество значимо различающихся таксонов по p_value_BH" = nrow (Wilcox_comparison_round_1 %>% filter (p_value_BH <= 0.05 ))
)## [,1]
## Количество значимо различающихся таксонов по p_value 273
## Количество значимо различающихся таксонов по p_value_holm 155
## Количество значимо различающихся таксонов по p_value_BH 273- после округления всех значений до сотых
Wilcox_comparison_round_2 <- data_wide %>%
select(Health_state, Archaea, Bacteria,
ends_with(c("_D", "_P", "_O", "_C", "_F", "_G"))) %>%
mutate(across (where (is.numeric), function (x) round (x,2))) %>%
summarise_if (is.numeric, function (x) (wilcox.test(x ~ .$Health_state)$p.value)) %>%
pivot_longer(everything()) %>%
rename (Taxon = name, p_value = value) %>%
filter (p_value <= 0.05 ) %>%
arrange(p_value) %>%
add_column(p_value_holm = p.adjust(.$p_value, "holm")) %>%
add_column(p_value_BH = p.adjust(.$p_value, "BH"))
rbind (
"Количество значимо различающихся таксонов по p_value" = nrow (Wilcox_comparison_round_2),
"Количество значимо различающихся таксонов по p_value_holm" = nrow (Wilcox_comparison_round_2 %>% filter (p_value_holm <= 0.05 )),
"Количество значимо различающихся таксонов по p_value_BH" = nrow (Wilcox_comparison_round_2 %>% filter (p_value_BH <= 0.05 ))
)## [,1]
## Количество значимо различающихся таксонов по p_value 599
## Количество значимо различающихся таксонов по p_value_holm 374
## Количество значимо различающихся таксонов по p_value_BH 599GLM метод для нулей
library("haven")
library("ResourceSelection") ## Package to perform the Hosmer-Lemeshow GOF test
library("survey")
library("prediction")
library("margins")
library("ggeffects")
library("sjPlot")
library("statmod")
#devtools::install_github("strengejacke/strengejacke")
#install.packages(c("haven", "ResourceSelection", "survey", "prediction", "margins", "ggeffects", "sjPlot", "statmod"))options(survey.lonely.psu = 'adjust')
start_values <- c(0, 0, 1)G - Genus (Род)
analyze_taxon <- function(taxon_name, data) {
tryCatch(
{
data_filtered <- data %>%
filter(Taxon == taxon_name) %>%
select(patient_ID, Health_state, Percentage, Age_range, research_ID) %>%
mutate(Health_state_num = ifelse(Health_state == "Health", 0, 1)) # для упрацения интерпритации процентов
mepsdsgn = svydesign(
id = ~patient_ID,
strata = ~research_ID,
weights = NULL,
data = data_filtered,
nest = TRUE)
start_values <- c(0, 0, 1)
model <- svyglm(Percentage ~ Health_state_num + research_ID,
mepsdsgn,
family = tweedie(var.power = 2, link.power = 1),
start = start_values)
summary_table <- summary(model)
tidy_output <- tidy(model)
result_table1 <- tidy_output %>%
filter(term == "Health_state_num") %>%
select(estimate, p.value)
result_table2 <- as.data.frame(confint(model)["Health_state_num", ])
result_table2_transposed <- t(result_table2)
final_result_table_transposed <- bind_cols(result_table1, result_table2_transposed) %>%
select(estimate, `2.5 %`, `97.5 %`, p.value)
final_result_table_transposed$Taxon <- taxon_name
return(final_result_table_transposed)
},
error = function(e) {
# Обработка ошибки (можно добавить сообщение или просто вернуть NULL)
cat("Error in analyze_taxon for Taxon:", taxon_name, "\n")
return(NULL)
}
)
}
# Применение функции ко всем таксонам
unique_taxa <- unique(G_long$Taxon)
result_list <- lapply(unique_taxa, function(taxon) {
analyze_result <- analyze_taxon(taxon, G_long)
if (!is.null(analyze_result)) {
return(analyze_result)
} else {
return(data.frame()) # Вернуть пустой data.frame, чтобы не влиять на bind_rows
}
})## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: A2_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Acetanaerobacterium_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Acetitomaculum_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Acetobacterium_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Acidaminococcus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Acidovorax_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Acinetobacter_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Actinobacillus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Actinomyces_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Aeromonas_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Agathobacter_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Akkermansia_G## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Alcanivorax_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Alistipes_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Alloprevotella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Anaerococcus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Anaerocolumna_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Anaerofilum_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Anaerofustis_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Anaerosporobacter_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Anaerostipes_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Anaerotruncus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Anaerovorax_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: BCf9-17 termite group_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Bacillus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Bacteroides_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Barnesiella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Bifidobacterium_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Bilophila_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Blautia_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Burkholderia-Caballeronia-Paraburkholderia_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Butyricicoccus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Butyricimonas_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Butyrivibrio_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: CAG-352_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: CAG-56_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: CHKCI001_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: CHKCI002_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Caldalkalibacillus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Candidatus Omnitrophus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Candidatus Phytoplasma_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Candidatus Soleaferrea_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Candidatus Stoquefichus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Candidatus Vestibaculum_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Caproiciproducens_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Catalinimonas_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Catenibacterium_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Catonella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Christensenella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Christensenellaceae R-7 group_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Citrobacter_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Cloacibacillus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Clostridioides_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Clostridium sensu stricto 11_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Clostridium sensu stricto 12_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Clostridium sensu stricto 13_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Clostridium sensu stricto 1_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Colidextribacter_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Collinsella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Coprobacillus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Coprobacter_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Coprococcus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Corynebacterium_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Cupriavidus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: DTU089_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Dechloromonas_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Defluviitaleaceae UCG-011_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Delftia_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Desulfovibrio_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Dethiosulfatibacter_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Dialister_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Dielma_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Dysgonomonas_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Eggerthella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Eisenbergiella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Enterobacter_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Enterococcus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Enterorhabdus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Epulopiscium_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Erysipelatoclostridium_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Erysipelotrichaceae UCG-003_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Escherichia-Shigella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Ezakiella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Faecalibacterium_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Faecalibaculum_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Family XIII AD3011 group_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Family XIII UCG-001_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Fastidiosipila_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Fermentimonas_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Fournierella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Frisingicoccus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Fusibacter_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Fusicatenibacter_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Fusobacterium_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: GCA-900066575_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: GCA-900066755_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Gemella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Geobacillus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Granulicatella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Haemophilus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Harryflintia_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Herbinix_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Holdemanella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Holdemania_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Howardella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Hungatella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Intestinibacter_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Intestinimonas_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Johnsonella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Klebsiella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnoanaerobaculum_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnoclostridium_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospira_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae AC2044 group_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae FCS020 group_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae FE2018 group_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae NC2004 group_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae ND3007 group_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae NK3A20 group_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae NK4A136 group_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae UCG-001_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae UCG-002_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae UCG-004_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae UCG-006_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae UCG-008_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae UCG-009_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae UCG-010_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Lachnospiraceae XPB1014 group_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Lacticaseibacillus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Lactobacillus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Lactococcus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Limnohabitans_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Limosilactobacillus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Lutispora_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Lysinibacillus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Magnetococcus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Mailhella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Marvinbryantia_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Massilia_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Megasphaera_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Methylomonas_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Error in analyze_taxon for Taxon: Microbacterium_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Mogibacterium_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Monoglobus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Moryella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: NK4A214 group_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Negativibacillus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: OM27 clade_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Odoribacter_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Olsenella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Oribacterium_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Oscillibacter_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Oscillospira_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Paenibacillus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Paludicola_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Pantoea_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Papillibacter_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Parabacteroides_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Paraclostridium_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Paraprevotella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Parasutterella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Parvimonas_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Peptoclostridium_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Peptococcus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Peptoniphilus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Peptostreptococcus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Phascolarctobacterium_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Phocea_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Photobacterium_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Porphyromonas_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Prevotella_7_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Prevotella_9_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Prevotella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Prevotellaceae NK3B31 group_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Prevotellaceae UCG-001_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Prevotellaceae UCG-003_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Prevotellaceae UCG-004_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Proteiniclasticum_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Proteiniphilum_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Pseudobutyrivibrio_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Pseudomonas_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Ralstonia_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Rhodoferax_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Rikenellaceae RC9 gut group_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Robinsoniella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Romboutsia_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Roseburia_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Ruminiclostridium_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Ruminococcus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Saccharofermentans_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Salmonella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Sarcina_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Selenomonas_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Sellimonas_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Serratia_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Shewanella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Shuttleworthia_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Slackia_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Spirosoma_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Sporacetigenium_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Sporobacter_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Staphylococcus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Stenotrophomonas_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Stomatobaculum_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Streptococcus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Streptomyces_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Subdoligranulum_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Succiniclasticum_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Sutterella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Syntrophococcus_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Tannerella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Terrisporobacter_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Turicibacter_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Tuzzerella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Tyzzerella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: UBA1819_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: UCG-002_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: UCG-003_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: UCG-004_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: UCG-005_G## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся
## Warning: созданы NaN
## Warning: созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: UCG-008_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: UCG-009_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: UCG-012_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: V9D2013 group_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью
## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Veillonella_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Vibrio_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: Victivallis_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: [Bacteroides] pectinophilus group_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: [Eubacterium] brachy group_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: [Eubacterium] eligens group_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: [Eubacterium] fissicatena group_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: [Eubacterium] hallii group_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: [Eubacterium] nodatum group_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: [Eubacterium] oxidoreducens group_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: [Eubacterium] ruminantium group_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: [Eubacterium] siraeum group_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: [Eubacterium] ventriosum group_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: [Eubacterium] xylanophilum group_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся## Warning: glm.fit: алгоритм остановился на краевом значении## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: [Ruminococcus] gauvreauii group_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: [Ruminococcus] gnavus group_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN
## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Error in analyze_taxon for Taxon: [Ruminococcus] torques group_G## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning in log(y1/mu): созданы NaN## Warning: размер шага уменьшен в связи с расходимостью## Warning: glm.fit: алгоритм не сошелся# Объединение результатов в один dataframe
final_result_df <- bind_rows(result_list) %>%
mutate(estimate = round(estimate, 3),
`2.5 %` = round(`2.5 %`, 4),
`97.5 %` = round(`97.5 %`, 4)
)
# Коррекция на множественные сравнения по методу Холма
final_result_df$p.adjusted <- p.adjust(final_result_df$p.value, method = "holm")
# Фильтрация только статистически значимых результатов
significant_results_G <- final_result_df %>%
filter(p.adjusted < 0.05)
# Вывод статистически значимых результатов
cat("Статистически значимые результаты:\n")## Статистически значимые результаты:significant_results_G## estimate 2.5 % 97.5 % p.value Taxon
## 1 -0.002 -0.0031 -0.0015 5.575959e-08 Acetoanaerobium_G
## 2 0.004 0.0024 0.0058 2.241619e-06 Acholeplasma_G
## 3 -0.003 -0.0036 -0.0016 4.349645e-07 Achromobacter_G
## 4 0.058 0.0444 0.0707 2.274454e-16 Acidaminobacter_G
## 5 -0.001 -0.0020 -0.0008 4.047637e-06 Aeriscardovia_G
## 6 -0.050 -0.0664 -0.0329 1.150352e-08 Alkaliflexus_G
## 7 0.002 0.0011 0.0023 5.803507e-08 Anaerospora_G
## 8 0.009 0.0068 0.0113 8.355986e-14 Anaerostignum_G
## 9 0.010 0.0062 0.0129 4.466792e-08 Anoxybacillus_G
## 10 0.003 0.0013 0.0041 1.600273e-04 Antarcticibacterium_G
## 11 -0.001 -0.0013 -0.0006 1.358989e-06 Arcicella_G
## 12 -0.001 -0.0020 -0.0009 8.420553e-07 Blvii28 wastewater-sludge group_G
## 13 -0.007 -0.0101 -0.0038 2.012172e-05 Candidatus Armantifilum_G
## 14 -0.002 -0.0026 -0.0010 1.074295e-05 Chthoniobacter_G
## 15 -0.001 -0.0014 -0.0006 1.996290e-06 Clostridiisalibacter_G
## 16 0.007 0.0057 0.0084 7.905729e-22 Colwellia_G
## 17 -0.003 -0.0047 -0.0019 3.622570e-06 Coriobacteriaceae UCG-002_G
## 18 -0.004 -0.0046 -0.0029 9.515334e-17 Crocinitomix_G
## 19 -0.003 -0.0037 -0.0016 8.885081e-07 Desulfurispora_G
## 20 -0.009 -0.0113 -0.0075 4.495532e-20 Erysipelotrichaceae UCG-002_G
## 21 0.050 0.0277 0.0724 1.410394e-05 Faecalitalea_G
## 22 -0.107 -0.1274 -0.0869 2.191088e-22 Flavobacterium_G
## 23 0.013 0.0071 0.0197 3.381871e-05 Flavonifractor_G
## 24 -0.003 -0.0031 -0.0021 1.774451e-24 Formosa_G
## 25 0.003 0.0015 0.0040 1.023083e-05 Halobacillus_G
## 26 0.009 0.0071 0.0104 3.042978e-22 Halochromatium_G
## 27 0.003 0.0022 0.0046 4.125348e-08 Hassallia_G
## 28 0.006 0.0047 0.0079 1.163144e-13 Hespellia_G
## 29 -0.003 -0.0043 -0.0014 1.026609e-04 Hydrogenispora_G
## 30 -0.001 -0.0021 -0.0008 1.941392e-05 Izimaplasma_G
## 31 0.009 0.0063 0.0127 9.174004e-09 Lachnospiraceae NK4B4 group_G
## 32 -0.003 -0.0035 -0.0023 2.073960e-17 Lachnotalea_G
## 33 0.018 0.0117 0.0242 3.406944e-08 Lactiplantibacillus_G
## 34 -0.001 -0.0021 -0.0007 4.283525e-05 Lawsonella_G
## 35 0.004 0.0022 0.0052 2.133461e-06 Lentilactobacillus_G
## 36 -0.003 -0.0036 -0.0016 4.664252e-07 Leptococcus JA-3-3Ab_G
## 37 0.001 0.0008 0.0017 4.907282e-08 Leucobacter_G
## 38 -0.004 -0.0062 -0.0024 9.792366e-06 Macellibacteroides_G
## 39 -0.003 -0.0045 -0.0016 3.336594e-05 Marinifilum_G
## 40 0.007 0.0036 0.0112 1.342625e-04 Marinobacter_G
## 41 0.114 0.0529 0.1743 2.664571e-04 Methanobrevibacter_G
## 42 0.002 0.0010 0.0028 7.425223e-05 Nocardia_G
## 43 0.013 0.0082 0.0178 1.991548e-07 Oxalobacter_G
## 44 -0.003 -0.0037 -0.0021 7.131965e-12 Oxobacter_G
## 45 -0.003 -0.0039 -0.0022 6.501018e-12 Paramaledivibacter_G
## 46 0.013 0.0095 0.0173 6.604233e-11 Porphyrobacter_G
## 47 -0.006 -0.0087 -0.0025 4.268308e-04 Prevotellaceae Ga6A1 group_G
## 48 0.004 0.0030 0.0047 6.993651e-18 Pseudarthrobacter_G
## 49 -0.001 -0.0014 -0.0006 2.909338e-06 Pseudoclostridium_G
## 50 -0.003 -0.0042 -0.0016 1.093742e-05 Pygmaiobacter_G
## 51 0.003 0.0012 0.0040 1.788832e-04 RB41_G
## 52 -0.006 -0.0086 -0.0030 6.662858e-05 Rikenella_G
## 53 0.004 0.0019 0.0054 6.310511e-05 Rubrobacter_G
## 54 -0.003 -0.0046 -0.0017 2.144453e-05 Salinibacter_G
## 55 -0.006 -0.0077 -0.0052 1.327532e-21 Sedimentibacter_G
## 56 0.086 0.0564 0.1152 2.015036e-08 Senegalimassilia_G
## 57 -0.003 -0.0033 -0.0021 5.274500e-17 Serpentinicella_G
## 58 0.065 0.0375 0.0929 5.236525e-06 Solobacterium_G
## 59 0.002 0.0012 0.0038 1.601488e-04 Spirochaeta 2_G
## 60 0.001 0.0007 0.0017 3.115478e-06 Sporanaerobacter_G
## 61 -0.003 -0.0032 -0.0023 3.065788e-26 Subsaximicrobium_G
## 62 0.004 0.0032 0.0048 3.216253e-19 Syntrophomonas_G
## 63 -0.016 -0.0198 -0.0116 4.044468e-13 Thermacetogenium_G
## 64 0.002 0.0012 0.0023 1.096515e-09 Truepera_G
## 65 -0.001 -0.0018 -0.0007 1.169751e-05 Virgibacillus_G
## 66 -0.003 -0.0040 -0.0013 8.050199e-05 XBB1006_G
## 67 -0.001 -0.0015 -0.0007 1.499675e-07 [Eubacterium] yurii group_G
## p.adjusted
## 1 8.642736e-06
## 2 3.227932e-04
## 3 6.567964e-05
## 4 3.866572e-14
## 5 5.666692e-04
## 6 1.852067e-06
## 7 8.937401e-06
## 8 1.412162e-11
## 9 7.012863e-06
## 10 1.920328e-02
## 11 1.997715e-04
## 12 1.254662e-04
## 13 2.635945e-03
## 14 1.461041e-03
## 15 2.914583e-04
## 16 1.407220e-19
## 17 5.107823e-04
## 18 1.627122e-14
## 19 1.314992e-04
## 20 7.912135e-18
## 21 1.875825e-03
## 22 3.943958e-20
## 23 4.328795e-03
## 24 3.211755e-22
## 25 1.401624e-03
## 26 5.446931e-20
## 27 6.518049e-06
## 28 1.954081e-11
## 29 1.252463e-02
## 30 2.562637e-03
## 31 1.486189e-06
## 32 3.587950e-15
## 33 5.417042e-06
## 34 5.440077e-03
## 35 3.093519e-04
## 36 6.996378e-05
## 37 7.655360e-06
## 38 1.351347e-03
## 39 4.304206e-03
## 40 1.624576e-02
## 41 3.117548e-02
## 42 9.207277e-03
## 43 3.027153e-05
## 44 1.176774e-09
## 45 1.079169e-09
## 46 1.083094e-08
## 47 4.951237e-02
## 48 1.216895e-15
## 49 4.160353e-04
## 50 1.476552e-03
## 51 2.110822e-02
## 52 8.328573e-03
## 53 7.951244e-03
## 54 2.787789e-03
## 55 2.349732e-19
## 56 3.224058e-06
## 57 9.072141e-15
## 58 7.278770e-04
## 59 1.920328e-02
## 60 4.423978e-04
## 61 5.579734e-24
## 62 5.628443e-17
## 63 6.754262e-11
## 64 1.787319e-07
## 65 1.567467e-03
## 66 9.901745e-03
## 67 2.294503e-05Распределения таксонов G(Genus - Род)
Гистограмма по количеству пациентов (Здоров - СРК)
create_and_plot_taxon_groups <- function(filter_pattern, step_size, dataset_name) {
# Получаем уникальные таксоны, удовлетворяющие условиям
unique_taxa <- Wilcox_comparison_round_2 %>%
subset(grepl(filter_pattern, Taxon)) %>%
filter(p_value_holm < 0.05) %>%
distinct(Taxon)
# Разбиваем уникальные таксоны на группы по step_size
taxon_groups <- split(unique_taxa, rep(1:ceiling(nrow(unique_taxa) / step_size), each = step_size, length.out = nrow(unique_taxa)))
# Проходим по группам и строим графики
for (i in seq_along(taxon_groups)) {
current_taxa <- taxon_groups[[i]]
current_dataset <- get(dataset_name) # Получаем датасет по его имени
G_long_filtered <- current_dataset %>%
filter(Taxon %in% current_taxa$Taxon & Percentage > 0) %>%
group_by(Health_state, Taxon) %>%
summarise(Count = n(), .groups = "drop")
bar_plot <- ggplot(G_long_filtered, aes(x = Health_state, y = Count, fill = Health_state == "Disease")) +
geom_bar(position = "dodge", color = "black", stat = "identity") +
scale_fill_manual(values = c("skyblue", "red"), guide = FALSE) +
labs(title = paste("Гистограмма для таксонов", (i - 1) * step_size + 1, "до", min(i * step_size, nrow(unique_taxa)), "в разрезе Health_state"),
x = "Статус пациента",
y = "Количество пациентов, у которых обнаружен данный таксон") +
coord_flip() +
facet_wrap(~Taxon, scales = "free_y", ncol = 2, shrink = 0.7) + # Уменьшение пространства между фасетами
theme(axis.text.x = element_text(angle = 45, hjust = 1, size = 5), # Поворот текста на оси X и уменьшение шрифта
axis.text.y = element_text(hjust = 1, size = 5),
strip.text = element_text(size = 5)) # Уменьшение шрифта для названия фасет
print(bar_plot) # Отображение графика на экране
}
}
# Пример вызова функции с передачей "_G" в качестве аргумента и названия датасета "G_long"
create_and_plot_taxon_groups("_G", 18, "G_long")## Warning: The `guide` argument in `scale_*()` cannot be `FALSE`. This was deprecated in
## ggplot2 3.3.4.
## ℹ Please use "none" instead.
## This warning is displayed once every 8 hours.
## Call `lifecycle::last_lifecycle_warnings()` to see where this warning was
## generated.
график солнышко
create_and_plot_circular_diagrams <- function(dataset, filter_pattern, step_size, filename) {
# Получаем уникальные таксоны, удовлетворяющие условиям
unique_taxa <- Wilcox_comparison_round_2 %>%
subset(grepl(filter_pattern, Taxon)) %>%
filter(p_value_holm < 0.05) %>%
distinct(Taxon)
# Разбиваем уникальные таксоны на группы по step_size
taxon_groups <- split(unique_taxa, rep(1:ceiling(nrow(unique_taxa) / step_size), each = step_size, length.out = nrow(unique_taxa)))
# Проходим по группам и строим графики
for (i in seq_along(taxon_groups)) {
current_taxa <- taxon_groups[[i]]
G_long_filtered <- dataset %>%
filter(Taxon %in% current_taxa$Taxon & Percentage > 0) %>%
group_by(Health_state, Taxon) %>%
summarise(Count = n(), .groups = "drop")
# Добавляем строки с Count = 0 для всех комбинаций Health_state и Taxon
G_long_filtered <- G_long_filtered %>%
complete(Health_state, Taxon, fill = list(Count = 0))
data_id <- G_long_filtered %>% filter(G_long_filtered$Health_state == "Disease") %>%
mutate(id = row_number()) %>%
select(Taxon, id)
G_long_filtered <- left_join(G_long_filtered, data_id, by = "Taxon")
labels_data <- G_long_filtered %>% filter(Health_state == "Disease")
number_of_bars <- nrow(labels_data)
#Вычислим углы для лейбла каждого барра
labels_data$angel <- 90 - 360 * (labels_data$id-0.5) / number_of_bars
# Добавим горизонтольную регулировку
labels_data <- labels_data %>%
mutate(hjust = ifelse(angel < -90, 1, 0))
# Перевернем лейбл в зависимости от "полушария"
labels_data <- labels_data %>%
mutate(angel = ifelse(angel < -90, angel + 180, angel))
# Круговая диаграмма для объединенного датасета
p <- ggplot(data = G_long_filtered, mapping = aes(x = id, y = Count, fill = Health_state)) +
geom_bar(stat = "identity", position = "stack") +
ylim(-150, 500) +
# Добавляем кастомную тему
theme_minimal(base_size = 8) +
theme(axis.text = element_blank(),
axis.title = element_blank(),
panel.grid = element_blank(),
plot.margin = unit(rep(-1, 6), "cm")) +
coord_polar(start = 0)+
geom_text(data = labels_data,
aes(x = id, y = Count,
label = Taxon,
hjust = hjust),
color = "black",
fontface = "bold",
alpha = 0.9,
size = 1.5,
angle = labels_data$angel,
inherit.aes = FALSE) +
# Добавляем горизонтальные линии сетки
geom_hline(yintercept = seq(0, 300, by = 50),
linetype = "dotted",
color = "gray",
size = 0.5) +
# Добавляем значения рядом с линиями сетки
annotate("text", x = 1.2, y = seq(0, 300, by = 50),
label = seq(0, 300, by = 50),
color = "black",
size = 3,
alpha = 40,
hjust = 0)
p <- p + annotate("text", x = 0.5, y = 490, label = "Сотношение здоровых пациентов и пациентов с СРК",
size = 5, color = "black", fontface = "bold", hjust = 0.5)
# Сформируем имя файла для сохранения
current_filename <- paste0(filename, "_", i, ".png")
# Сохраняем график под уникальным именем
ggsave(current_filename, p, width = 10, height = 8)
print(p)
}
}
# Пример вызова функции
create_and_plot_circular_diagrams(G_long, "_G", 40, "output_plot")## Warning: Using `size` aesthetic for lines was deprecated in ggplot2 3.4.0.
## ℹ Please use `linewidth` instead.
## This warning is displayed once every 8 hours.
## Call `lifecycle::last_lifecycle_warnings()` to see where this warning was
## generated.
Боксплот по возрасту
create_and_plot_boxplots <- function(G_long, filter_pattern, step_size, x_var, title) {
# Получаем уникальные таксоны, удовлетворяющие условиям
unique_taxa <- Wilcox_comparison_round_2 %>%
subset(grepl(filter_pattern, Taxon)) %>%
filter(p_value_holm < 0.05) %>%
distinct(Taxon)
# Разбиваем уникальные таксоны на группы по step_size
taxon_groups <- split(unique_taxa, rep(1:ceiling(nrow(unique_taxa) / step_size), each = step_size, length.out = nrow(unique_taxa)))
# Проходим по группам и строим боксплоты
for (i in seq_along(taxon_groups)) {
current_taxa <- taxon_groups[[i]]
G_long_filtered <- G_long %>%
filter(Taxon %in% current_taxa$Taxon & Percentage > 0)
# Создаем формулу для переменной x_var
formula <- as.formula(paste("Age ~", x_var))
# Строим боксплот
box_plot <- ggplot(G_long_filtered, aes_string(x = x_var, y = "Age", fill = "Health_state")) +
geom_boxplot() +
labs(title = paste(title),
x = x_var,
y = "Age") +
theme(axis.text.x = element_text(angle = 45, hjust = 1, size = 8), # Уменьшаем размер шрифта для подписей Taxon
axis.title.x = element_blank(), # Убираем название оси X
legend.position = "bottom") + # Перемещаем легенду вниз
scale_fill_manual(values = c("red", "skyblue")) +
facet_grid(~Taxon, scales = "free_y", space = "free") # Используем facet_grid вместо facet_wrap
# Отображаем график на экране
print(box_plot)
}
}
# Пример вызова функции с Health_state в качестве x_var
create_and_plot_boxplots(G_long, "_G", 4, "Health_state", "Боксплоты для таксонов по статусу: Здоров/СРК")## Warning: `aes_string()` was deprecated in ggplot2 3.0.0.
## ℹ Please use tidy evaluation idioms with `aes()`.
## ℹ See also `vignette("ggplot2-in-packages")` for more information.
## This warning is displayed once every 8 hours.
## Call `lifecycle::last_lifecycle_warnings()` to see where this warning was
## generated.## Warning: Removed 491 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 653 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 650 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 596 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 504 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 541 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 618 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 389 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 630 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 725 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 449 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 171 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 608 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 419 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 295 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 350 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 278 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 279 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 200 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 338 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 316 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 342 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 564 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 403 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 273 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 53 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 393 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 423 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 146 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 391 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 428 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 505 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 517 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 407 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 463 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 102 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 384 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
Боксплот по возросту и полу
create_and_plot_boxplots(G_long, "_G", 3, "interaction(Health_state, Sex)", "Боксплоты для таксона (Пол + статус заболевания)")## Warning: Removed 369 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 405 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 509 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 511 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 364 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 447 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 415 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 415 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 434 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 431 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 379 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 393 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 666 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 342 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 200 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 137 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 506 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 314 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 276 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 226 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 316 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 94 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 316 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 181 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 101 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 371 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 123 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 259 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 311 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 111 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 551 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 336 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 106 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 202 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 156 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 255 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 268 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 249 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 165 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 278 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 252 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 444 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 281 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 473 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 320 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 331 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 257 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 64 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 220 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 164 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
Боксплот по возросту и статусу курения
create_and_plot_boxplots(G_long, "_G", 3, "interaction(Health_state, Smoking)", "Боксплоты для таксона (Статус курения + статус заболевания)")## Warning: Removed 369 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 405 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 509 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 511 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 364 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 447 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 415 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 415 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 434 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 431 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 379 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 393 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 666 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 342 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 200 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 137 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 506 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 314 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 276 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 226 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 316 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 94 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 316 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 181 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 101 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 371 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 123 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 259 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 311 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 111 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 551 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 336 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 106 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 202 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 156 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 255 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 268 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 249 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 165 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 278 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 252 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 444 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 281 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 473 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 320 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 331 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 257 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 64 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 220 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 164 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
Боксплот по возросту и статусу употребления алкоголя
create_and_plot_boxplots(G_long, "_G", 3, "interaction(Health_state, Alcohol)", "Боксплоты для таксона (Статус употребления алкоголя + статус заболевания)")## Warning: Removed 369 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 405 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 509 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 511 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 364 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 447 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 415 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 415 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 434 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 431 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 379 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 393 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 666 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 342 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 200 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 137 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 506 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 314 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 276 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 226 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 316 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 94 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 316 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 181 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 101 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 371 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 123 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 259 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 311 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 111 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 551 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 336 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 106 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 202 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 156 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 255 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 268 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 249 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 165 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 278 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 252 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 444 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 281 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 473 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 320 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 331 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 257 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 64 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 220 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 164 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
Распределения таксонов F Family(семейство)
Гистограмма по количеству пациентов (Здоров - СРК)
create_and_plot_taxon_groups("_F", 18, "F_long")
Круговая столбчатая диаграмма для отобрадения отношения здоровых пациентов и пациентов с СРК
create_and_plot_circular_diagrams(F_long, "_F", 40, "F_output_plot")
Боксплот по возрасту
create_and_plot_boxplots(F_long, "_F", 4, "Health_state", "Боксплоты для таксонов по статусу: Здоров/СРК")## Warning: Removed 410 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 614 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 685 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 479 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 636 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 400 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 607 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 383 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 219 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 505 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 243 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 172 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 495 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 427 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 147 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 89 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 267 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 457 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 480 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 117 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 444 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 248 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 325 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 547 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 52 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
Боксплот по возросту и полу
create_and_plot_boxplots(F_long, "_F", 3, "interaction(Health_state, Sex)", "Боксплоты для таксона (Пол + статус заболевания)")## Warning: Removed 383 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 307 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 463 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 556 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 339 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 497 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 360 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 319 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 482 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 281 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 283 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 163 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 454 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 209 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 131 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 126 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 454 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 238 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 259 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 118 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 61 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 84 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 409 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 259 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 438 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 104 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 122 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 377 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 228 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 98 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 262 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 532 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 52 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
Боксплот по возросту и статусу курения
create_and_plot_boxplots(F_long, "_F", 3, "interaction(Health_state, Smoking)", "Боксплоты для таксона (Статус курения + статус заболевания)")## Warning: Removed 383 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 307 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 463 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 556 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 339 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 497 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 360 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 319 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 482 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 281 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 283 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 163 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 454 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 209 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 131 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 126 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 454 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 238 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 259 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 118 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 61 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 84 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 409 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 259 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 438 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 104 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 122 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 377 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 228 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 98 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 262 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 532 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 52 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
Боксплот по возросту и статусу употребления алкоголя
create_and_plot_boxplots(F_long, "_F", 3, "interaction(Health_state, Alcohol)", "Боксплоты для таксона (Статус употребления алкоголя + статус заболевания)")## Warning: Removed 383 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 307 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 463 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 556 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 339 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 497 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 360 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 319 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 482 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 281 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 283 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 163 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 454 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 209 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 131 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 126 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 454 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 238 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 259 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 118 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 61 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 84 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 409 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 259 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 438 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 104 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 122 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 377 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 228 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 98 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 262 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 532 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 52 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
Распределения таксонов C - Class (класс)
Гистограмма по количеству пациентов (Здоров - СРК)
create_and_plot_taxon_groups("_C", 18, "C_long")
Круговая столбчатая диаграмма для отобрадения отношения здоровых пациентов и пациентов с СРК
create_and_plot_circular_diagrams(C_long, "_C", 40, "F_output_plot")
Боксплот по возрасту
create_and_plot_boxplots(C_long, "_C", 4, "Health_state", "Боксплоты для таксонов по статусу: Здоров/СРК")## Warning: Removed 519 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 628 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 235 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 330 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 292 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 181 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 296 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 117 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 214 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
Боксплот по возросту и полу
create_and_plot_boxplots(C_long, "_C", 3, "interaction(Health_state, Sex)", "Боксплоты для таксона (Пол + статус заболевания)")## Warning: Removed 327 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 564 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 312 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 179 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 269 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 132 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 297 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 105 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 263 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 95 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 55 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 214 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
Боксплот по возросту и статусу курения
create_and_plot_boxplots(C_long, "_C", 3, "interaction(Health_state, Smoking)", "Боксплоты для таксона (Статус курения + статус заболевания)")## Warning: Removed 327 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 564 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 312 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 179 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 269 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 132 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 297 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 105 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 263 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 95 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 55 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 214 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
Боксплот по возросту и статусу употребления алкоголя
create_and_plot_boxplots(C_long, "_C", 3, "interaction(Health_state, Alcohol)", "Боксплоты для таксона (Статус употребления алкоголя + статус заболевания)")## Warning: Removed 327 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 564 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 312 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 179 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 269 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 132 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 297 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 105 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 263 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 95 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 55 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 214 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
Распределения таксонов O - Order (порядок)
Гистограмма по количеству пациентов (Здоров - СРК)
create_and_plot_taxon_groups("_O", 18, "O_long")
Круговая столбчатая диаграмма для отобрадения отношения здоровых пациентов и пациентов с СРК
create_and_plot_circular_diagrams(O_long, "_O", 30, "F_output_plot")
Боксплот по возрасту
create_and_plot_boxplots(O_long, "_O", 4, "Health_state", "Боксплоты для таксонов по статусу: Здоров/СРК")## Warning: Removed 497 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 705 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 596 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 465 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 604 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 384 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 385 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 284 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 287 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 613 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 168 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 110 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 275 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 376 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 306 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 94 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 269 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 321 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 244 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
Боксплот по возросту и полу
create_and_plot_boxplots(O_long, "_O", 3, "interaction(Health_state, Sex)", "Боксплоты для таксона (Пол + статус заболевания)")## Warning: Removed 374 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 428 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 621 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 375 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 386 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 284 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 643 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 140 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 342 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 242 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 242 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 130 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 391 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 337 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 81 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 82 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 59 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 282 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 343 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 273 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 73 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 268 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 47 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 296 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 244 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
Боксплот по возросту и статусу курения
create_and_plot_boxplots(O_long, "_O", 3, "interaction(Health_state, Smoking)", "Боксплоты для таксона (Статус курения + статус заболевания)")## Warning: Removed 374 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 428 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 621 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 375 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 386 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 284 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 643 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 140 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 342 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 242 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 242 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 130 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 391 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 337 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 81 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 82 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 59 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 282 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 343 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 273 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 73 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 268 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 47 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 296 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 244 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
Боксплот по возросту и статусу употребления алкоголя
create_and_plot_boxplots(O_long, "_O", 3, "interaction(Health_state, Alcohol)", "Боксплоты для таксона (Статус употребления алкоголя + статус заболевания)")## Warning: Removed 374 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 428 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 621 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 375 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 386 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 284 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 643 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 140 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 342 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 242 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 242 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 130 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 391 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 337 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 81 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 82 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 59 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 282 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 343 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 273 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 73 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 268 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 47 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 296 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 244 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
Распределения таксонов P - Phylum (тип)
Гистограмма по количеству пациентов (Здоров - СРК)
create_and_plot_taxon_groups("_P", 18, "P_long")
Круговая столбчатая диаграмма для отобрадения отношения здоровых пациентов и пациентов с СРК
create_and_plot_circular_diagrams(P_long, "_P", 30, "P_output_plot")
Боксплот по возрасту
create_and_plot_boxplots(P_long, "_P", 4, "Health_state", "Боксплоты для таксонов по статусу: Здоров/СРК")## Warning: Removed 660 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 603 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 496 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 317 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 90 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
Боксплот по возросту и полу
create_and_plot_boxplots(P_long, "_P", 3, "interaction(Health_state, Sex)", "Боксплоты для таксона (Пол + статус заболевания)")## Warning: Removed 529 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 295 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 617 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 318 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 295 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 112 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
Боксплот по возросту и статусу курения
create_and_plot_boxplots(P_long, "_P", 3, "interaction(Health_state, Smoking)", "Боксплоты для таксона (Статус курения + статус заболевания)")## Warning: Removed 529 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 295 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 617 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 318 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 295 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 112 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
Боксплот по возросту и статусу употребления алкоголя
create_and_plot_boxplots(P_long, "_P", 3, "interaction(Health_state, Alcohol)", "Боксплоты для таксона (Статус употребления алкоголя + статус заболевания)")## Warning: Removed 529 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 295 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 617 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 318 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 295 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
## Warning: Removed 112 rows containing non-finite values (`stat_boxplot()`).
Посмотрим на данные здоровых людей и людей с СРК как на многомерный вектор по всем таксонам и группам
G - Genus
perform_permutation_test <- function(data, filter_pattern) {
combined_bacteria_G <- data %>%
select(Health_state, ends_with(filter_pattern))
d <- dist(combined_bacteria_G) # euclidean distances between the rows
fit <- cmdscale(d, eig=TRUE, k=2) # k is the number of dim
df_mds <- data.frame(
x = fit$points[,1],
y = fit$points[,2]
)
df_full <- cbind(df_mds, combined_info) %>%
mutate(Health_state_n = case_when(Health_state == "Health" ~ 0,
Health_state == "Disease" ~ 1))
msd_plot <- ggplot(df_full, aes(x = x, y = y, color = Health_state)) +
geom_point() +
theme_bw() +
ggtitle("Распределение вектора таксонов в зависимости от группы пациентов")
print(msd_plot)
print("Используя метод пермутаций проверим отличаются ли группы в зависимости от Health_state")
adonis2(d ~ Health_state_n, data = df_full)
}
# Пример вызова функции с использованием другого фильтра
perform_permutation_test(combined_bacteria_clean, "_G")## Warning in dist(combined_bacteria_G): в результате преобразования созданы NA
## [1] "Используя метод пермутаций проверим отличаются ли группы в зависимости от Health_state"## Permutation test for adonis under reduced model
## Terms added sequentially (first to last)
## Permutation: free
## Number of permutations: 999
##
## adonis2(formula = d ~ Health_state_n, data = df_full)
## Df SumOfSqs R2 F Pr(>F)
## Health_state_n 1 1046 0.0122 4.6817 0.001 ***
## Residual 379 84659 0.9878
## Total 380 85705 1.0000
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1F - Family (семейство)
perform_permutation_test(combined_bacteria_clean, "_F")## Warning in dist(combined_bacteria_G): в результате преобразования созданы NA
## [1] "Используя метод пермутаций проверим отличаются ли группы в зависимости от Health_state"## Permutation test for adonis under reduced model
## Terms added sequentially (first to last)
## Permutation: free
## Number of permutations: 999
##
## adonis2(formula = d ~ Health_state_n, data = df_full)
## Df SumOfSqs R2 F Pr(>F)
## Health_state_n 1 1919 0.01423 5.4706 0.002 **
## Residual 379 132940 0.98577
## Total 380 134859 1.00000
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1C - Class (класс)
perform_permutation_test(combined_bacteria_clean, "_C")## Warning in dist(combined_bacteria_G): в результате преобразования созданы NA
## [1] "Используя метод пермутаций проверим отличаются ли группы в зависимости от Health_state"## Permutation test for adonis under reduced model
## Terms added sequentially (first to last)
## Permutation: free
## Number of permutations: 999
##
## adonis2(formula = d ~ Health_state_n, data = df_full)
## Df SumOfSqs R2 F Pr(>F)
## Health_state_n 1 32982 0.12662 54.948 0.001 ***
## Residual 379 227490 0.87338
## Total 380 260472 1.00000
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1O - Order (порядок)
perform_permutation_test(combined_bacteria_clean, "_O")## Warning in dist(combined_bacteria_G): в результате преобразования созданы NA
## [1] "Используя метод пермутаций проверим отличаются ли группы в зависимости от Health_state"## Permutation test for adonis under reduced model
## Terms added sequentially (first to last)
## Permutation: free
## Number of permutations: 999
##
## adonis2(formula = d ~ Health_state_n, data = df_full)
## Df SumOfSqs R2 F Pr(>F)
## Health_state_n 1 6923 0.04767 18.97 0.001 ***
## Residual 379 138309 0.95233
## Total 380 145232 1.00000
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1P - Phylum (тип)
perform_permutation_test(combined_bacteria_clean, "_P")## Warning in dist(combined_bacteria_G): в результате преобразования созданы NA
## [1] "Используя метод пермутаций проверим отличаются ли группы в зависимости от Health_state"## Permutation test for adonis under reduced model
## Terms added sequentially (first to last)
## Permutation: free
## Number of permutations: 999
##
## adonis2(formula = d ~ Health_state_n, data = df_full)
## Df SumOfSqs R2 F Pr(>F)
## Health_state_n 1 32728 0.12502 54.155 0.001 ***
## Residual 379 229042 0.87498
## Total 380 261770 1.00000
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1